AWS ケーススタディ: MiraiBio

MiraiBio の製品の１つに、DNA、RNA、タンパク配列分析のためのオンラインのノートブック、DNASISSmartNote があります。このウェブベースのツールには、いくつか人気の高い生物情報科学用ツールが含まれており、生物医学の研究者達は、配列を簡単に解析し、結果を同僚と共有することができます。

製品強化を検討するに当たり、MiraiBio のチームは、研究者の特定の配列に関連する新しい科学的論文を組み込みたいと考えました。この新しい膨大な計算処理能力を誇る機能には、別の専用サーバーが必要でしたが、これは時間と費用がかさむものでした。そこでチームは、実装費用が低額で、市場投入時間が短く、拡張が簡単な、Amazon EC2 の機能を配備することを決定しました。

"当社の最初の目標は、良い作業プロトタイプを構築することでしたが、EC2 上で （プログラミングも含めて） 一から開発するのに、わずか２週間ほどしかかかりませんでした。EC2 上へ新しいサーバーを設定することは簡単で、素早いソフトウェア開発によく適合しました。" 当プロジェクトに携わっていた生物情報科学の専門家である Daniel Reda 氏はこのように述べています。"サーバーを自分達で用意すれば、それだけで少なくとも２週間はかかったでしょう。Amazon EC2 のおかげで、200工数と何千ドルものハードウェアコストを削減できたと見積もっています。

動作の仕組み： 生物学者が新しい DNA 配列を彼らの DNASIS SmartNote ノートブックに追加する際、新しい機能はその配列を EC2 サーバーに送信します。これは BLAST (Basic Local Alignment Search Tool) アルゴリズムを実行して、その配列を、既に知られている他の各 DNA 配列と比較します。配列の特定後、EC2 サーバーは、いくつかの著作権を有するアルゴリズムを実行し、その配列について最近発表されたものの中で、最も関連のある論文を検索します。この情報は生物学者に表示され、彼らは参照可能な論文に素早くアクセスし、研究を継続することができます。

"EC2サーバーは、強力で拡張可能なソリューションを提供します。EC2 を使用すれば、顧客のメインアプリケーションをさえぎることなく、数百・数千もの配列の検索を実行することができます。""EC2 の低コストで迅速な設定は、当社の新しいアプリケーション機能のアイデアが実現するかどうかという、当初の疑問をあっという間に消し去ってくれました。アイデアをこのように素早く安価にテストすることができたおかげで、完全な展開を進めるための承認を得ることがますます容易になりました。"

DNASIS SmartNote by MiraiBio の詳細については、smartnote.miraibio.com . MiraiBio は、日立ソフトウェア 米国子会社（Hitachi Software Engineering America, Ltd.）の、生命科学部門です。