Hochleistungsinformatik für Gesundheitswesen und Biowissenschaften

Beschleunigen Sie das Tempo der Resultate im Gesundheitswesen und in den Biowissenschaften

Bessere Ergebnisse und schnellere Forschung auf AWS

Beschleunigen Sie die Zeit bis zur Erkenntnis und überwinden Sie die Grenzen der On-Premises-Infrastruktur mit High Performance Computing (HPC) auf AWS. Flexible Konfiguration und virtuelle unbegrenzte Skalierbarkeit bedeuten, dass Sie die Infrastruktur an Ihre Workloads anpassen und skalieren können und nicht andersherum. AWS unterstützt eine breite Auswahl an Sicherheitsstandards und Compliance-Zertifizierungen, inklusive PCI-DSS, HIPAA/HITECH, FedRAMP, GDPR, FIPS 140-2 und NIST 800-171, um Ihnen zu helfen, die wichtigsten Sicherheits- und Compliance-Anforderungen zu erfüllen. Treiben Sie Innovationen im Gesundheitswesen und in den Biowissenschaften mit dem AWS-Partnernetzwerk und einem umfangreichen Portfolio von speziell entwickelten HPC-Tools und -Services voran.

Anwendungsfälle

Computergestützte Chemie und strukturbasierter Arzneimittel-Design

AWS HPC bietet unmittelbaren Zugriff auf quasi unbegrenzte Computing-Ressourcen zur Beschleunigung des strukturbasierten Arzneimittel-Designs. Verbinden Sie die rasche Weiterentwicklung von Proteinstrukturlösungen mit schnelleren Algorithmen zur Beschreibung und Darstellung flexibler 3D-Molekülmodelle. Die AWS-Infrastruktur unterstützt Verbesserungen bei Geschwindigkeit, Genauigkeit und Skalierung in den Bereichen virtuelles Screening, Molekulardynamik, Quantenmechanik und 3-D-Strukturlösung.

Amazon-EC2-Instances wie der C5n oder C6gn können rechenintensive Anwendungen optimieren und der G4 kann helfen, GPU-kompatible Anwendungen zu beschleunigen. Sie können AWS ParallelCluster verwenden, um Ihre Anwendungen einzurichten und zu konfigurieren, sowie Elastic Fabric Adapter (EFA) für Anwendungen verwenden, die eine Netzwerkverbindung mit hoher Bandbreite, niedriger Latenz und geringem Jitter für die Kommunikation zwischen den Knoten benötigen. Amazon FSx for Lustre liefert das Hochleistungsdateisystem, das mehrere Instances für den Zugriff auf denselben Datensatz benötigen. Erfahren Sie, wie Sie die Preisleistung für Molekulardynamiksimulationen mit GROMACS auf AWS ParallelCluster optimieren oder den Prozess der Arzneimittelentwicklung mit dem AWS-Partner OpenEye Scientific beschleunigen können.  

Genomik

Mit AWS können Sie Datenanwendungen entwickeln und ausführen, die retrospektiv, in Echtzeit oder prädiktiv sind, um den Weg von genomischen Daten zu genomischen Erkenntnissen zu beschleunigen. Verkürzen Sie die Datenverarbeitungszeiten von Wochen auf Stunden und gewinnen Sie frühzeitig Erkenntnisse über Krankheiten wie Krebs, Mukoviszidose und Alzheimer. Erfahren Sie mehr darüber, wie AWS-Kunden wie AstraZeneca und Fred Hutchinson die Ergebnisse in kürzerer Zeit erzielen und ihre Genomik-Workloads in großem Umfang auf AWS ausführen.

Unabhängig davon, ob Sie rechenintensive, FPGA- oder GPU-beschleunigte Anwendungen ausführen, können Sie in Amazon EC2 die richtige Computing-Plattform finden. Falls Sie rechenintensive Anwendungen betreiben, lesen Sie diesen Blog, um herauszufinden, wie Sie die Kosten mit AWS Graviton2 erheblich senken können. Außerdem können Sie AWS Batch verwenden, um Batch-Workloads zu orchestrieren und mit beliebigen Workflow-Sprachen wie Nextflow, DRAGEN, Cromwell und NVIDIA Clara Parabricks zu arbeiten, um Ihre Analysen auszuführen. Das AWS Open Data Program umfasst öffentlich zugängliche Datensätze mit über 40 offenen Biowissenschafts- und Genomikdatensätzen, die eine reibungslose Zusammenarbeit ermöglichen und den Forschungs- und Klinikgemeinschaften eine einheitlich dokumentierte Wissensquelle bieten.

Modellierung und Simulation

Greifen Sie auf nahezu unbegrenzte Rechen- und Speicherressourcen für die Modellierung und Simulation zu, um Informationen für die Planung klinischer Studien zu erhalten und Studienergebnisse vorherzusagen. Durch AWS können Modellierungs- und Simulations-Workloads, wie beispielsweise numerische Strömungsdynamik, Pharmakokinetik, Pharmakodynamik (PK, PD), klinische Studien und systembiologische Simulationen, die Anforderungen an Berechnungen, Datenstandardisierung und Interoperabilität erfüllen. Der AWS-Kunde Relay Therapeutics war in der Lage, 5 Milliarden molekulare Verbindungen an einem Tag zu analysieren, was bei Verwendung seiner On-Premises-Umgebung Monate gedauert hätte.

Führen Sie klinische Studiensimulationen nach Bedarf durch, indem Sie Amazon-EC2-GPU-Instances wie G4 und P4d einsetzen, um die Zeit und die Kosten für deren Durchführung zu verringern. Mit dem AWS Deep Learning AMI und Amazon Sagemaker Notebooks können Sie potenzielle Arzneimittelkandidaten für die Erforschung und Entwicklung neuer Arzneimittel schneller und kostengünstiger identifizieren.

Imaging

AWS bietet die umfassendste und tiefste Palette an Instance-Typen, skalierbaren Speicherlösungen und fortschrittlichen Services für Machine Learning und Datenintegration, um die Anforderungen von Imaging-Workloads zu erfüllen. Mit AWS können Sie die Image-Analyse verbessern und die langfristige Datenspeicherung erleichtern. HPC auf AWS ermöglicht Workloads wie Grundlagenforschung, Datentransfer, Geräteintegration, diagnostische medizinische Imaging, hochauflösendes Screening, digitale Pathologie, MRI, PET, Röntgen und CT-Scans. Erfahren Sie, wie AMBRA Health die Plattform für medizinische Imaging auf AWS erweitert hat und wie UC San Diego die HIPAA-sichere Umgebung von AWS genutzt hat, um auf Machine Learning basierende Algorithmen für Röntgenbilder bereitzustellen.

Nutzen Sie die Vorteile der grafikoptimierten G4-Amazon-EC2-Instances, um das Rendern medizinischer Images in Echtzeit zu ermöglichen. Mit AWS DataSync können Sie Daten zur Speicherung oder Verarbeitung schnell zwischen lokalen oder Cloud-Speicherlösungen übertragen oder über das NICE-DCV-Remote-Streaming-Protokoll von Ihrer lokalen Workstation aus streamen. Sie können die Identifizierung und Musterklassifizierung in medizinischen Images mit den Machine-Learning-Funktionen von AWS SageMaker verbessern.

Kunden

„AWS Genomics Workflows hilft uns bei Amgen, unsere analytischen Workflows in der Cloud aufzubauen und zu standardisieren. Die Anleitung von AWS hat dazu beigetragen, diesen Prozess zu beschleunigen und uns auf dem richtigen Weg zu halten.“

Jamie Rosner, Amgen Principal IS Business Systems Analyst

AWS-Partner für Gesundheitswesen und Biowissenschaften

AWS arbeitet mit einigen der führenden Anbieter von Lösungen für das Gesundheitswesen und die Biowissenschaften zusammen.

Ressourcen

AWS arbeitet mit einigen der führenden Anbieter von Lösungen für das Gesundheitswesen und die Biowissenschaften zusammen.

„Damit Dinge schnell laufen“, beginnend mit GROMACS

Infografik: Beschleunigen Sie Innovationen im Gesundheitswesen und in den Biowissenschaften mit HPC auf AWS

Durch Amazon Web Services können Forscher auf speziell entwickelte HPC-Tools und -Services sowie auf wissenschaftliches und technisches Fachwissen zugreifen, um das Tempo ihrer Entdeckungen zu beschleunigen

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Imaging für die COVID-19-Diagnose mit der Universität Liverpool und Alces Flight

Verwendung von FSx for Lustre für Genomik-Workloads 

Erfahren Sie, wie Sie Genomik-Workflows mit dem leistungsstarken POSIX-kompatiblen Shared-File-System von Amazon FSx for Lustre unter Verwendung von AWS Batch und AWS Step Functions in großem Maßstab erstellen und ausführen.

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Wie man die CryoEM-Analyse mit AWS ParallelCluster und FSx for Lustre beschleunigt

Whitepaper: HPC auf AWS für Biowissenschaften

Beschleunigen Sie die Zeit bis zum Erkenntnisgewinn und überwinden Sie die Grenzen von On-Premises-Lösungen, indem Sie HPC auf einer AWS-Infrastruktur einsetzen, die für die am stärksten regulierten und anspruchsvollen Workloads im Gesundheitswesen und in den Biowissenschaften entwickelt wurde.

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Ausführen von Genomik-Workflows mit Nextflow

GROMACS Preis-Leistungsoptimierungen auf AWS

In diesem Blog wird eine Studie über die Leistung und den Preis der Ausführung von GROMACS, einer beliebten Open-Source-Molekulardynamik-Anwendung, in einer Vielzahl von Instancetypen der Amazon Elastic Compute Cloud (Amazon EC2) vorgestellt.

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