AWS HealthOmics unterstützt jetzt das Pinning von Nextflow-Versionen zur Laufzeit
Mit AWS HealthOmics können Kunden jetzt die Nextflow-Engine-Version zur Laufzeit über die StartRun API angeben, sodass Kunden Ausführungen für eine kontrollierte Migration an eine bestimmte Nextflow-Version anhängen können. Mit diesem Launch können Kunden mithilfe des neuen Parameters „engine-settings“ aus den unterstützten Nextflow-Versionen (22.04, 23.10, 24.10, 25.10, 26.04) auswählen, sodass die Ausführung explizit gesteuert wird. AWS HealthOmics ist ein HIPAA-kompatibler Service, der Kunden aus dem Gesundheitswesen und den Biowissenschaften hilft, wissenschaftliche Durchbrüche skaliert mit vollständig verwalteten Bioinformatik-Workflows zu beschleunigen.
Das Pinning von Nextflow-Versionen gibt Kunden die volle Kontrolle darüber, wann und wie sie neue Engine-Versionen einführen. Die Überschreibung der Laufzeitversion stellt sicher, dass selbst dann, wenn eine Workflow-Definition eine Version über „manifest.nextFlowVersion“ in ihrer Konfiguration oder ihrem Profil angibt, der StartRun API-Parameter Vorrang hat, sodass Kunden denselben Workflow über mehrere Engine-Versionen hinweg testen können, ohne den Workflow-Quellcode zu ändern. Produktions-Workflows können auf einer validierten Engine-Version verbleiben, während Entwicklungsteams neuere Versionen parallel testen, wodurch das Risiko unerwarteter Verhaltensänderungen reduziert wird. Dies ist nützlich für regulierte Umgebungen, in denen vor dem Upgrade auf eine neue Engine-Version eine Pipeline-Validierung erforderlich ist.
Das Pinning von Nextflow-Versionen ist jetzt für Nextflow-Workflow-Ausführungen in allen AWS HealthOmics-Regionen verfügbar: USA Ost (Nord-Virginia), USA West (Oregon), Europa (Frankfurt, Irland, London), Israel (Tel Aviv) und Asien-Pazifik (Singapur, Seoul). Weitere Informationen finden Sie in der Dokumentation zu den Nextflow-Engine-Einstellungen.