本指南使用C odeBu il d和CodePipel ine来构建、打包和部署解决方案中所需的一切，以提取和存储变体调用文件（VCF），并处理来自癌症基因组图集（TCGA）和癌症成像地图集（TCIA）中数据集的多模态和多组学数据。使用完全托管的服务-Amazon Omics 演示了无服务器基因组学数据的摄取和分析。在解决方案 CodeCommit 存储库中进行的代码更改将通过提供的 C odePipeline 部署管道进行部署。

阅读“卓越运营”白皮书

本指南在 IAM 中使用基于角色的访问权限，所有存储桶都启用了加密、私有并禁止公有访问。AWS Glu e 中的数据目录已启用加密，A WS Glu e 写入亚马逊 S3 的所有元数据均已加密。所有角色都定义为最低权限，服务之间的所有通信都保留在客户账户内部。管理员可以控制 Jupyter 笔记本，亚马逊 Omics Variant Stores 的数据和 AWS Glue 目录的数据访问权限完全使用 Lake Formation 进行管理，而 A thena 、SageMak er Notebook 和 QuickS ig ht 的数据访问权限则通过提供的 IAM 角色进行管理。

阅读《安全性》白皮书

AWS Glu e、亚马逊 S3 、亚马逊 Omics 和 A thena 都是无服务器的，将随着数据量的增加而扩展数据访问性能。AWS Gl ue 预置、配置和扩展运行数据集成任务所需的资源。Athena 是无服务器的，因此您无需设置和管理任何服务器或数据仓库即可快速查询数据。QuickSight SPICE 内存存储将把你的数据探索扩展到成千上万的用户。 

阅读《可靠性》白皮书

使用无服务器技术，您只需预调配自己使用的准确资源即可。每个 AWS Glu e 任务将根据需要预置一个 Spark 集群，以转换数据并在完成后取消资源配置。如果您选择添加新的 TCGA 数据集，则可以添加新的 AWS Glue 任务和 AWS Gl u e 爬虫，它们还将按需预览资源。Athena 会自动并行执行查询，因此大多数结果会在几秒钟内返回。 亚马逊 Omics 通过将文件转换为 Apache Parquet 来大规模优化变体查询性能。

阅读《性能效率》白皮书

使用可按需扩展的无服务器技术，您只需为自己使用的资源付费。为了进一步优化成本，您可以在不使用 SageMaker 的笔记本电脑环境时将其停止。QuickSight 仪表板还通过单独的 CloudFormation 模板进行部署，因此，如果您不打算使用可视化仪表板，可以选择不部署它以节省成本。 亚马逊 Omics 大规模优化变体数据存储成本。查询成本由 Athena 扫描的数据量决定，可以通过相应地编写查询来进行优化。

阅读《成本优化》白皮书

通过密集地使用托管服务和动态扩展，您可以最大限度地降低后台服务的环境影响。可持续性的关键组件是最大限度地使用笔记本服务器实例。不使用笔记本电脑环境时，应停止运行。 

阅读《可持续性》白皮书