Workflows von AWS Healthomics unterstützen jetzt das Caching von Aufrufen und den Zugriff auf Zwischendateien
Wir freuen uns, Ihnen bekannt geben zu können, dass AWS HealthOmics-Workflows jetzt die Fähigkeit unterstützen, Aufgabenergebnisse aus vorherigen Durchläufen wiederzuverwenden, was Kunden Zeit und Rechenkosten spart. AWS HealthOmics ist ein vollständig verwalteter Service, der es Organisationen aus dem Gesundheitswesen und den Biowissenschaften ermöglicht, Omics-Daten zu speichern, abzufragen, zu analysieren, um Erkenntnisse zu gewinnen, die Gesundheit zu verbessern und wissenschaftliche Entdeckungen voranzutreiben. Mit diesem Release können Kunden die Entwicklung neuer Pipelines beschleunigen, indem sie Durchläufe an der Stelle wieder aufnehmen, an der zuvor ein Fehler aufgetreten ist oder einer Codeänderung vorgenommen wurde.
Das Caching von Aufrufen bzw. die Fähigkeit, Durchläufe wieder aufzunehmen, ermöglicht es Kunden, Durchläufe an dem Punkt, an dem neue Codeänderungen eingeführt werden, neu zu starten und unveränderte Aufgaben, die bereits berechnet wurden, zu überspringen, um schnellere iterative Workflow-Entwicklungszyklen zu ermöglichen. Darüber hinaus werden die Zwischendateien von Aufgaben in einem Run-Cache gespeichert, was ein erweitertes Debugging und die Behebung von Workflow-Fehlern während der Entwicklung ermöglicht. Bei Produktionsworkflows ermöglicht das Caching von Aufrufen die Speicherung von Teilergebnisse aus fehlgeschlagenen Durchläufen, sodass Kunden der Probelauf an der Stelle, an der der Fehler aufgetreten ist, erneut ausführen können, anstatt erfolgreich abgeschlossene Aufgaben erneut zu berechnen, was die Wiederaufbereitungszeiten verkürzt.
Das Caching von Aufrufen wird jetzt für die Workflow-Sprachen Nextflow, WDSL und CWL unterstützt, in allen Regionen, in denen AWS HealthOmics verfügbar ist: USA Ost (Nord-Virginia), USA West (Oregon), Europa (Frankfurt, Irland, London), Asien-Pazifik (Singapur) und Israel (Tel Aviv). Weitere Informationen für den Einsteig in Call Caching finden Sie in der Dokumentation von AWS HealthOmics.