AWS HealthOmics kündigt automatische Interpolation von Eingabeparametern für Nextflow-Workflows an
Heute führt AWS HealthOmics die automatische Interpolation von Eingabeparametern für private Nextflow-Workflows ein. Das macht die manuelle Erstellung von Parametervorlagen überflüssig. Diese Erweiterung identifiziert und extrahiert erforderliche und optionale Eingabeparameter zusammen mit ihren Beschreibungen auf intelligente Weise direkt aus Workflow-Definitionen. AWS HealthOmics ist ein HIPAA-fähiger Service, der Kunden aus dem Bereich Gesundheitswesen und Biowissenschaften zur Verfügung steht, um mit vollständig verwalteten biologischen Datenspeichern und Workflows wissenschaftliche Durchbrüche zu beschleunigen.
Mit diesem neuen Feature können Kunden Bioinformatik-Workflows schneller starten, da sie nicht mehr jeden Workflow-Parameter manuell identifizieren, definieren und validieren müssen. Das trägt außerdem dazu bei, Konfigurationsfehler zu reduzieren, die auftreten können, wenn Parameter falsch angegeben oder weggelassen werden. Für spezielle Anforderungen können Kunden weiterhin benutzerdefinierte Parametervorlagen bereitstellen, um die automatisch generierten Konfigurationen zu überschreiben.
Die Interpolation von Eingabeparametern für Nextflow-Workflows wird jetzt in allen Regionen unterstützt, in denen AWS HealthOmics verfügbar ist: USA Ost (Nord-Virginia), USA West (Oregon), Europa (Frankfurt, Irland, London), Asien-Pazifik (Singapur) und Israel (Tel Aviv). Die automatische Parameterinterpolation wird bereits für WDL- und CWL-Workflows unterstützt.
Weitere Informationen zur automatischen Parameterinterpolation und zur Implementierung von WDL-Workflows finden Sie in der Dokumentation zu AWS HealthOmics.