AWS HealthOmics führt Ressourcen-Fallback-Reihenfolge für Nextflow-Workflows ein
AWS Healthomics bietet ab sofort die Resource-Fallback-Direktive, mit der Sie für Aufgaben in Ihren Nextflow-Workflows eine geordnete Liste bevorzugter Beschleunigertypen definieren können, einschließlich einer Option zum Fallback auf CPU-Instances. Forscher und Bioinformatiker können diese Richtlinie nutzen, um den Zeitaufwand für die Diagnose und erneute Einreichung von Durchläufen aufgrund von Beschleunigerbeschränkungen zu reduzieren und die Produktionsabläufe am Laufen zu halten. AWS HealthOmics ist ein HIPAA-kompatibler Service, der Kunden aus dem Gesundheitswesen und den Biowissenschaften hilft, wissenschaftliche Durchbrüche skaliert mit vollständig verwalteten Bioinformatik-Workflows zu beschleunigen.
Mit Resource Fallback für Nextflow-Workflows können Sie Ihren bevorzugten Beschleuniger für Ihre Aufgabe priorisieren. Wenn Ihr bevorzugter Beschleuniger nicht verfügbar ist, durchläuft Healthomics automatisch Ihre angegebenen Alternativen im Fallback, ohne ihn erneut einzureichen. Jedes Beschleunigerprofil hat ein konfigurierbares Timeout, sodass Sie kontrollieren können, wie lange Healthomics nach diesem Beschleuniger sucht, bevor Sie zum nächsten wechseln. Kürzere Timeouts helfen dir, schnell durch die Fallback-Reihenfolge zu kommen, während längere Timeouts die Wahrscheinlichkeit erhöhen, dass du deinen bevorzugten Beschleuniger reservierst. Sie können auch ein CPU-Profil als letztes Fallback hinzufügen, um die Wahrscheinlichkeit zu erhöhen, dass Ihre Aufgabe eine Instance reserviert.
Sie können jetzt Resource-Fallback für Nextflow-Workflows in allen AWS HealthOmics-Regionen verwenden: USA Ost (Nord-Virginia, Ohio), USA West (Oregon), Europa (Frankfurt, Irland, London), Israel (Tel Aviv) und Asien-Pazifik (Seoul, Singapur, Tokio). Weitere Informationen finden Sie in der Dokumentation zur erweiterten Ressourcenkonfiguration und zu den Nextflow-Besonderheiten.