Cromwell sur AWS

Une collaboration avec le Broad Institute pour accélérer la recherche génomique

Cromwell est un système de gestion des flux de travail du Broad Institute, un organisme de recherche dédié à la bioinformatique, basé à Cambridge, dans le Massachusetts. Cromwell est conçu pour exécuter des flux de travail scientifiques pour l'analyse du génome. Cromwell permet aux chercheurs, aux scientifiques, aux développeurs et aux analystes en génomique de mener efficacement leurs expériences à bien sans avoir besoin d'une expertise approfondie en calcul backend.

Cromwell est désormais pris en charge dans le Cloud AWS. Cromwell est un moteur d'exécution de flux de travail qui simplifie l'orchestration des tâches de calcul requises pour l'analyse du génome. AWS Batch, un service de traitement par lots entièrement géré sur Amazon Web Services, alloue de manière dynamique la quantité optimale et le type de ressources de calcul (par exemple, des instances optimisées pour le CPU ou la mémoire) en fonction du volume et des besoins en ressources spécifiques des tâches par lots soumises.

Avec Cromwell sur AWS, les chercheurs et scientifiques disposent d'encore plus de flexibilité pour mettre à l'échelle les expériences de génomique à l'aide de capacités de calcul dans le cloud, plutôt que de se contenter de ressources sur site limitées.


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webinaire

Présentation de l'exécution de Cromwell sur Amazon Web Services (AWS)

Regardez un webinaire pour en savoir plus sur les outils, les techniques et les meilleures pratiques pour développer et exécuter des flux de travail scientifiques utilisant Cromwell sur AWS. Le webinaire explique comment configurer Cromwell sur AWS Batch, un service de traitement par lots entièrement géré.

Vidéo de démonstration

Regardez une démonstration : exécuter Cromwell sur AWS

Une courte vidéo présentant deux exemples démontrant les fonctionnalités de Cromwell sur AWS : configurez Cromwell pour utiliser AWS Batch et encodez un flux de travail simple.


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