Sumber daya AWS HealthOmics

Panduan Pengguna

Pelajari cara menggunakan AWS HealthOmics dalam panduan developer langkah demi langkah ini.

Referensi API

Baca panduan referensi untuk API dan parameter AWS HealthOmics.

Tutorial

Lokakarya Menyeluruh HealthOmics

Mulai alur kerja dan penyimpanan HealthOmics

Tutorial HealthOmics

Repositori sumber terbuka di GitHub dengan kode contoh yang menunjukkan cara menyimpan, memproses, dan mengueri set data genomika dan biologis menggunakan AWS HealthOmics

Alat Alur Kerja

Alur Kerja Penemuan Obat

Gunakan kumpulan alur kerja AWS HealthOmics ini untuk mempercepat penemuan obat

Contoh Alur Kerja

Bangun alur kerja privat berdasarkan contoh alur kerja HealthOmics sumber terbuka

Penganalisis Operasi

Penganalisis Operasi adalah alat optimisasi performa operasi yang mengambil log manifes operasi dari CloudWatch dan menghasilkan statistik untuk operasi, termasuk pemanfaatan CPU dan memori untuk tugas alur kerja

WDL Linter

Gunakan WDL linter HealthOmics untuk mendeteksi kesalahan alur kerja umum sebelum menjalankan alur kerja

Nextflow Linter

Lint untuk kesalahan Nextflow umum sebelum skrip alur kerja dijalankan

Pembantu ECR

Migrasikan kontainer yang ada ke repositori ECR privat Anda menggunakan alat pembantu ECR

Jalankan Ulang Alat

Jalankan ulang operasi yang diarsipkan dari log manifes operasi CloudWatch

Alat Penyimpanan Data

Manajer Transfer Set Baca

Unduh file dengan mudah dari referensi AWS HealthOmics atau set baca

Importir yang Didorong Peristiwa

Aplikasi CDK mendemonstrasikan arsitektur yang didorong peristiwa yang mengotomatiskan impor data ke penyimpanan urutan AWS HealthOmics saat objek dibuat di Amazon S3.

Generator Manifes Penyimpanan Urutan

Menghasilkan manifes json untuk tugas impor penyimpanan urutan AWS HealthOmics

Pencari Kumpulan Baca Duplikat Penyimpanan Urutan

Mengidentifikasi set baca duplikat yang disimpan di penyimpanan urutan AWS HealthOmics

Solusi

Panduan untuk Jala Data Laboratorium di AWS

Panduan ini menunjukkan cara membangun sistem manajemen data ilmiah yang mengintegrasikan data instrumen laboratorium dan sistem perangkat lunak, seperti notebook lab elektronik (ELN) dan sistem manajemen informasi lab (LIMS), dengan HealthOmics.

Panduan untuk Lab yang Terhubung secara Digital di AWS

Panduan ini membantu Anda menghubungkan instrumen data ilmu hayati dan file sistem laboratorium ke AWS Cloud, baik melalui internet maupun koneksi langsung dengan latensi rendah.

Panduan untuk Migrasi & Penyimpanan Data Urutan dengan AWS HealthOmics

Panduan ini menunjukkan cara mengimpor data urutan omik dari Amazon Simple Storage Service (Amazon S3) ke AWS HealthOmics Storage.

Panduan untuk Analisis Data Multi-Modal dengan AWS Health dan Layanan ML

Panduan ini menunjukkan cara menyiapkan kerangka kerja menyeluruh untuk menganalisis data layanan kesehatan dan ilmu hayati (HCLS) multimodal.

Panduan untuk Alur Kerja Bioinformatika di AWS

Panduan ini menunjukkan bagaimana Anda dapat membangun dan menjalankan alur kerja bioinformatika tingkat produksi dalam skala besar dan menggunakan layanan AWS untuk otomatisasi, analisis alur kerja, penyimpanan, serta observabilitas operasional dan biaya.