Gambaran Umum

AWS HealthOmics membantu pelanggan mempercepat terobosan ilmiah dengan infrastruktur bioinformatika dan penemuan obat terkelola penuh yang dirancang untuk menangani alur kerja dan penyimpanan dalam skala besar. Dengan HealthOmics, Anda hanya membayar sesuai penggunaan dan tidak ada biaya lisensi HealthOmics.

HealthOmics menawarkan dua tipe alur kerja. Alur kerja privat adalah alur kerja khusus yang ditentukan pengguna sehingga Anda dapat membawa skrip bioinformatika Anda sendiri. Skrip tersebut ditulis dalam bahasa alur kerja yang paling umum digunakan. Penetapan harga untuk alur kerja privat didasarkan pada sumber daya komputasi dan sistem {i>file

HealthOmics menawarkan dua tipe penyimpanan. Penyimpanan referensi dan penyimpanan sekuens adalah penyimpanan data untuk objek yang menggunakan sistem tingkatan, kompresi, dan katalogisasi metadata guna memungkinkan penyimpanan dan pengelolaan data bioinformatika yang hemat biaya. Harga didasarkan pada ukuran objek yang disimpan dan tingkat data. Penyimpanan varian dan anotasi adalah penyimpanan nol-ETL yang mengekstraksi data kunci dari data bioinformatika untuk membuat danau data yang dioptimalkan untuk pencarian dan pembuatan kohort. Harga didasarkan pada ukuran penyimpanan informasi yang diekstraksi.

Anda dapat menggunakan alur kerja dan penyimpanan data bersama-sama atau secara terpisah, sesuai kebutuhan. Jika Anda bersedia berkomitmen untuk menggunakan layanan selama tiga atau lima tahun, harap hubungi kami untuk mendapatkan harga diskon.

Jelajahi Harga berdasarkan Tipe

Dengan AWS HealthOmics, Anda hanya membayar sesuai penggunaan. Jelajahi harga berdasarkan tipe di bawah ini.

Tingkat Free

Sebagai bagian dari AWS Tingkat Free, Anda dapat mulai menggunakan AWS HealthOmics secara gratis. Saat mendaftar, pelanggan AWS baru menerima hingga 275 jam instans omics.m.xlarge (atau yang setara) dan 49.000 gigabita-jam penyimpanan eksekusi untuk menjalankan alur kerja privat, 1.500 gigabase-bulan penyimpanan aktif dan arsip di penyimpanan sekuens, serta 200 gigabita-bulan penyimpanan di penyimpanan varian. Penggunaan Tingkat Free Anda dikalkulasi setiap bulan di seluruh Region (kecuali Region AWS GovCloud (AS)) dan secara otomatis dikenakan pada tagihan Anda; penggunaan bulanan yang tidak digunakan akan hangus. Batasan berlaku; lihat ketentuan untuk detail selengkapnya.

 

Penggunaan Tingkat Free per bulan selama 2 bulan pertama
Alur kerja HealthOmics

Alur Kerja Privat: 275 jam instans omics.m.xlarge atau instans komputasi yang setara dan 49.000 GB-jam penyimpanan operasi
Penyimpanan Data HealthOmics Penyimpanan Sekuens: 1.500 gigabase-bulan dalam kelas penyimpanan aktif dan 1.500 gigabase-bulan dalam kelas penyimpanan arsip

Penyimpanan Varian: 200 gigabita-bulan

Pelanggan AWS menerima 100 GB transfer data ke internet secara gratis setiap bulannya, yang dihitung secara agregat di seluruh layanan AWS dan AWS Region (kecuali Tiongkok dan GovCloud).

Harga Alur Kerja Privat

Alur kerja privat adalah alur kerja kustom yang Anda tentukan berdasarkan bahasa alur kerja pilihan Anda untuk menjalankan pipeline bioinformatika atau penemuan obat. Ada dua komponen biaya: instans tugas alur kerja dan penyimpanan eksekusi.

Anda dikenai biaya untuk instans omics yang digunakan untuk setiap tugas dalam alur kerja Anda. Setiap tugas dalam alur kerja Anda dipetakan ke instans omics terkecil yang tersedia dan memenuhi persyaratan vCPUs, memori, dan/atau GPU yang diminta untuk tugas tersebut. Misalnya, tugas yang ditentukan untuk menggunakan 8 CPU dan RAM sebesar 60 GiB akan dipetakan ke tipe instans omics.r.2xlarge untuk eksekusi. HealthOmics selalu menyediakan sumber daya yang diminta dengan tepat. Dalam contoh ini, 8 CPU dan RAM 60 GiB akan tersedia untuk tugas tersebut. Tugas ditagih dalam kelipatan 1 detik. Namun, terdapat batas minimum penagihan sebesar 60 detik per tugas. Jika Anda tidak menentukan vCPUs atau memori untuk suatu tugas, HealthOmics akan secara otomatis menyediakan jenis instans terkecil yang tersedia, yaitu omics.c.large, untuk tugas tersebut. Anda juga tidak dikenai biaya untuk komputasi yang terkait dengan penahapan data (yaitu, impor dan ekspor) dan tidak ada biaya lintas AZ.

Anda hanya dikenakan biaya untuk sumber daya selama proses berada dalam status berjalan. Tidak ada biaya yang dikenakan untuk eksekusi yang berstatus tertunda, sedang dimulai, atau sedang dihentikan. Untuk proses yang dibatalkan atau gagal, Anda akan ditagih untuk setiap sumber daya yang digunakan hingga titik pembatalan atau kegagalan.

Anda dapat melihat total biaya per proses di konsol Manajemen Penagihan & Biaya. HealthOmics juga menyediakan alat analisis proses sumber terbuka untuk membantu Anda mengoptimalkan sumber daya, biaya, dan kinerja proses. Jika Anda berencana menjalankan alur kerja produksi dalam skala besar dan bersedia berkomitmen untuk menggunakan layanan selama tiga atau lima tahun, harap hubungi kami untuk mendapatkan harga diskon.

 

Penyimpanan eksekusi

HealthOmics menyediakan sistem file bersama sementara untuk setiap eksekusi yang menyimpan input alur kerja, output, direktori kerja, dan file perantara yang dapat diakses oleh semua tugas dalam eksekusi tersebut. Secara default, HealthOmics menyediakan sistem file dinamis yang diskalakan secara otomatis. Penyimpanan operasi dinamis dapat diskalakan sesuai dengan penggunaan dan tidak memiliki persyaratan penyediaan penyimpanan minimum. Anda juga dapat memilih sistem file yang telah disediakan sebelumnya (statis) dengan throughput yang lebih tinggi untuk beban kerja besar yang mengalami lonjakan aktivitas dan memiliki konkurensi tugas yang tinggi. Penyimpanan eksekusi statis dapat disediakan dalam ukuran 1.200 GiB, 2.400 GiB, dan kelipatan tambahan 2.400 GiB, dengan ukuran minimum 1.200 GiB.

Penyimpanan Sementara

HealthOmics menyediakan penyimpanan sementara bagi setiap tugas alur kerja untuk memproses data sementara pada volume lokal, bukan pada penyimpanan eksekusi bersama. Biaya penyimpanan sementara bergantung pada jumlah penyimpanan sementara yang dialokasikan untuk tugas alur kerja Anda dan durasi eksekusi tugas tersebut, yang dihitung dalam detik. 16 GiB penyimpanan sementara tersedia untuk semua tugas HealthOmics tanpa biaya tambahan. Anda dapat mengalokasikan penyimpanan sementara tambahan untuk tugas alur kerja Anda, hingga 3.072 GiB. Anda hanya membayar untuk penyimpanan sementara yang Anda konfigurasi.

Harga Alur Kerja Ready2Run

Alur kerja Ready2Run adalah alur kerja yang telah dikonfigurasi sebelumnya dan dirancang oleh perusahaan perangkat lunak pihak ketiga terkemuka di industri, seperti NVIDIA, Sentieon, Element Biosciences, dan Ultima, serta mencakup pipeline sumber terbuka yang umum digunakan, seperti alur kerja GATK dari Broad Institute dan AlphaFold untuk prediksi struktur protein. Anda dapat menggunakan alur kerja Ready2Run untuk memproses data Anda tanpa perlu mengelola alat perangkat lunak atau skrip alur kerja. Alur kerja Ready2Run adalah pembayaran per operasi dan Anda dikenai biaya tetap yang sama saat operasi berhasil diselesaikan, terlepas dari waktu pengoperasian. Jika operasi dibatalkan atau tidak berhasil diselesaikan dalam satu jam pertama, biaya per operasi dihitung secara prorata berdasarkan jam pertama penggunaan. Operasi yang dieksekusi selama lebih dari 1 jam ditagih untuk harga operasi penuh. Alur kerja Sentieon Ready2Run memerlukan langganan terpisah yang dibeli dari Sentieon. Langganan evaluasi dua minggu gratis secara otomatis disediakan oleh Sentieon tanpa biaya tambahan bagi pengguna Sentieon Ready2Run yang pertama kali bergabung. Untuk melihat informasi terperinci tentang alur kerja Ready2Run yang tersedia, termasuk parameter input, diagram alur kerja, dan perkiraan waktu eksekusi, kunjungi konsol HealthOmics.

Harga Penyimpanan Data

Penyimpanan data HealthOmics merupakan penyimpanan terkelola yang mudah ditemukan, dapat diakses, interoperabel, dan dapat digunakan kembali (FAIR) untuk data sampel berskala besar, dengan kompresi data otomatis dan kemampuan kueri varian/anotasi yang dioptimalkan.

Penyimpanan sekuens memberikan penghematan biaya melalui pengelompokan ke dalam tingkatan berdasarkan penggunaan dan kompresi. Objek yang disimpan dikelompokkan di bawah set baca agar mudah diatur dan ditemukan. Saat menyimpan data di penyimpanan sekuens, Anda dikenai biaya per gigabase per bulan. Satu gigabase setara dengan satu miliar basa dari file urutan yang Anda impor (seperti FASTQ, BAM, dan CRAM). Karena penagihan per gigabase, Anda tidak perlu khawatir mengenai format {i>file https://aws.amazon.com/blogs/industries/store-omics-data-cost-effectively-at-any-scale-with-aws-healthomics/

Penyimpanan varian dan anotasi menggunakan nol-ETL guna menyiapkan data varian dan anotasi untuk kueri, kohort, dan analisis dengan layanan AWS, seperti Amazon Athena dan Amazon SageMaker. File yang diserap diproses oleh HealthOmics dan diubah menjadi format kueri yang dioptimalkan. Anda dapat menyimpan data varian dan anotasi dalam jumlah berapa pun, dan Anda hanya membayar sesuai yang disimpan. Ukuran data yang ditagih didefinisikan sebagai ukuran data setelah proses penyerapan dan transformasi. Data di penyimpanan varian dan anotasi biasanya diakses melalui layanan AWS lainnya. Saat mengueri dan menganalisis data di layanan lain, Anda membayar penggunaan layanan tersebut.

Data yang disimpan di penyimpanan data AWS HealthOmics dikenai biaya untuk durasi penyimpanan minimum selama 30 hari, dan data yang dihapus sebelum 30 hari akan dikenai biaya prorata yang setara dengan biaya penyimpanan untuk jumlah hari yang tersisa. 

Contoh Harga

  • Seorang ilmuwan bioinformatika ingin menjalankan alur kerja Nextflow di AWS HealthOmics Workflows di Region AS Timur (Virginia Utara). Ia memiliki tiga tugas di alur kerja tersebut. Tugas pertama mengalokasikan 16 vCPUs dan memori sebesar 30 GB, serta memerlukan waktu 3 jam untuk dijalankan. Tugas kedua memerlukan 32 vCPUs dan memori sebesar 160 GB, serta memerlukan waktu 2 jam untuk dijalankan. Tugas ketiga memerlukan 4 vCPU, memori sebesar 10 GB, dan waktu 10 menit untuk dijalankan. Pelanggan mendaftarkan alur kerja dan memanggil API StartRun dengan sistem file default sebesar 1.200 GB. Total biaya keseluruhannya adalah:
    Tugas 1 (omics.c.4xlarge): 0,9180 USD/jam * 3 jam = 2,754 USD
    Tugas 2 (omics.r.8xlarge): 2,7216 USD/jam * 2 jam = 5,4432 USD
    Tugas 3 (omics.m.xlarge): 0,2592 USD/jam * 1/6 jam = 0,0432 USD
    Penyimpanan eksekusi statis: 0,0001918 USD/GB-jam * (1.200 GB*(3 jam+2 jam+1/6 jam)) = 1,18916 USD
    Total: 9,42956 USD

  • Seorang ilmuwan bioinformatika sedang mengembangkan alur kerja WDL baru di AWS HealthOmics di Region AS Timur (Virginia Utara). Dia memiliki dua tugas di alur kerja tersebut. Tugas pertama memerlukan 16 vCPUs dan memori sebesar 30 GB, dan waktu 3,5 jam untuk dijalankan. Tugas kedua memerlukan 32 vCPUs dan memori sebesar 160 GB, dan waktu 2,25 jam untuk dijalankan. Pelanggan mendaftarkan alur kerja dan memanggil API StartRun dengan sistem file dinamis. Selama 5,75 jam alur kerja dijalankan, sistem file bertambah secara linear dari 0 GB hingga 1.043 GB, dengan total penyimpanan file sebesar 3.000 GB-jam. Total biaya keseluruhannya adalah:
    Tugas 1 (omics.c.4xlarge): 0,9180 USD/jam * 3,5 jam = 3,213 USD
    Tugas 2 (omics.r.8xlarge): 2,7216 USD/jam * 2,25 jam = 6,1236 USD
    Penyimpanan eksekusi dinamis: 0,0004110 USD/ GB-jam * 3.000 GB-jam = 1,233 USD
    Total: 10,5696 USD

  • Seorang ilmuwan komputasi ingin menjalankan alur kerja Ready2Run GATK-BP Germline fq2vcf untuk genom 30x di AWS Region AS Timur (Virginia Utara) dengan 3 sampel. Pelanggan memasukkan data mereka dan memanggil API StartRun untuk setiap sampel. Biaya untuk 3 eksekusi tersebut adalah:
    Alur kerja Ready2Run GATK-BP Germline fq2vcf untuk genom 30x: 10,00 USD per eksekusi * 3 = 30,00 USD
    Total: 30,00 USD

  • Inisiatif pengurutan populasi mulai mengurutkan individu-individu dari biobank yang telah mereka kumpulkan. Mereka memilih untuk melakukan pengurutan ini di Region UE Barat (Irlandia). Mereka mengurutkan 100.000 individu, masing-masing berukuran 130 gigabase, 50 gigabita, dan menyimpan data pengurutan mentah di penyimpanan AWS HealthOmics. Selama lima tahun berikutnya, data tersebut tetap berada di kelas penyimpanan arsip setelah 30 hari sejak diimpor dan rata-rata diakses dua kali, ketika data ditransisikan ke kelas penyimpanan aktif selama 30 hari. Mereka menggunakan API S3 untuk mengakses file. Setiap genom diunduh dalam 500 bagian dan menghasilkan 500 panggilan API GET. Total biaya mereka selama lima tahun untuk satu genom adalah:
    Kelas penyimpanan aktif: 0,005769 USD/gigabase/bulan * 130 gigabase * 90 hari = 2,22 USD
    Kelas penyimpanan arsip: 0,001154 USD/gigabase/bulan * 130 gigabase * (1825 − 90) hari = 8,56 USD.
    S3 GET API: 0,0004 USD / 1000 panggilan API * (2 * 500 panggilan API) = 0,0004 USD
    Total biaya selama 5 tahun: 2,22 USD + 8,56 USD + 0,0004 USD = 10,78 USD (atau 2,15 USD/tahun)

  • Seorang ilmuwan data memiliki 3.202 {i>file Penyimpanan varian: 0,035 USD GB/bulan * (1024 GB/TB * 1,5 TB) = 53,76 USD
    Amazon Athena: 5 USD/TB * 1000 * 50/1024 = 244,14 USD

Harga Transfer Data

Anda membayar semua {i>bandwidth

Tingkat tarif memperhitungkan penggunaan keseluruhan untuk Transfer Data Keluar ke Internet di seluruh layanan AWS.

††† Transfer Data Keluar mungkin berbeda dengan data yang diterima oleh aplikasi jika Anda menghentikan koneksi sebelum waktunya, misalnya, jika Anda membuat permintaan untuk objek berukuran 10 GB dan menghentikan koneksi setelah menerima 2 GB data pertama. AWS HealthOmics mencoba menghentikan {i>streaming