Sumber daya AWS HealthOmics

Pelajari cara menggunakan AWS HealthOmics dalam panduan pengembang terperinci ini.

Baca panduan referensi untuk API dan parameter AWS HealthOmics ini.

Panduan ini memberikan petunjuk untuk menginstal dan menggunakan modul Kiro Power dan Ekstrensi IDE AWS HealthOmics dalam Kiro IDE untuk meningkatkan pengalaman pengguna saat bekerja menggunakan HealthOmics.

Panduan ini menjelaskan proses pembuatan, deployment, dan dijalankannya alur kerja genomik menggunakan AWS HealthOmics.

Anda dapat meminta Kiro CLI untuk membangun alur kerja, menganalisis log proses, dan membuat rekomendasi pengoptimalan kinerja.

Mulai gunakan alur kerja dan penyimpanan HealthOmics

Repositori sumber terbuka di GitHub dengan kode contoh yang menunjukkan cara menyimpan, memproses, dan mengajukan kueri untuk set data genomika dan biologis menggunakan AWS HealthOmics

Menyediakan penyorotan sintaks, penyelesaian kode, dan panduan pemecahan masalah, serta pemeriksaan kompatibilitas mesin HealthOmics, rekomendasi pengoptimalan kinerja, analisis proses otomatis dengan diagnostik kegagalan, dan kemampuan impor/ekspor alur kerja.

Melengkapi server MCP HealthOmics dengan panduan, agar agen Kiro IDE dapat meningkatkan keahlian terkait pembuatan dan pengoptimalan alur kerja HealthOmics.

Server Protokol Konteks Model (MCP) yang menyediakan asisten AI dengan akses komprehensif ke layanan AWS HealthOmics untuk manajemen, eksekusi, dan analisis alur kerja genomika.

Gunakan kumpulan alur kerja AWS HealthOmics ini untuk mempercepat penemuan obat

Bangun alur kerja privat berdasarkan contoh alur kerja HealthOmics sumber terbuka

Penganalisis operasi adalah alat pengoptimalan performa operasi yang mengambil log manifes operasi dari CloudWatch dan menghasilkan statistik untuk operasi, termasuk pemanfaatan CPU dan memori untuk tugas alur kerja

Gunakan WDL linter HealthOmics untuk mendeteksi kesalahan alur kerja umum sebelum menjalankan alur kerja

Lint untuk kesalahan Nextflow umum sebelum skrip alur kerja dijalankan

Jalankan ulang operasi yang diarsipkan dari log manifes operasi CloudWatch

Unduh file dengan mudah dari referensi AWS HealthOmics atau set baca

Aplikasi CDK mendemonstrasikan arsitektur yang digerakkan peristiwa yang mengotomatiskan impor data ke penyimpanan urutan AWS HealthOmics saat objek dibuat di Amazon S3.

Menghasilkan manifes json untuk tugas impor penyimpanan urutan AWS HealthOmics

Mengidentifikasi set baca duplikat yang disimpan di penyimpanan urutan AWS HealthOmics

Panduan ini menunjukkan cara membangun sistem manajemen data ilmiah yang mengintegrasikan data instrumen laboratorium dan sistem perangkat lunak, seperti notebook lab elektronik (ELN) dan sistem manajemen informasi lab (LIMS), dengan HealthOmics.

Panduan ini membantu Anda menghubungkan instrumen data ilmu hayat dan file sistem laboratorium ke AWS Cloud, baik melalui internet maupun koneksi langsung dengan latensi rendah.

Panduan ini menunjukkan cara mengimpor data urutan omik dari Amazon Simple Storage Service (Amazon S3) ke AWS HealthOmics Storage.

Panduan ini menunjukkan cara menyiapkan kerangka kerja menyeluruh untuk menganalisis data layanan kesehatan dan ilmu hayat (HCLS) multimodal.

Panduan ini menunjukkan bagaimana Anda dapat membangun dan menjalankan alur kerja bioinformatika tingkat produksi dalam skala besar dan menggunakan layanan AWS untuk otomatisasi, analisis alur kerja, penyimpanan, serta observabilitas operasional dan biaya.