I flussi di lavoro di AWS HealthOmics ora supportano il caching delle chiamate e l'accesso intermedio ai file

Inserito il: 21 nov 2024

Siamo lieti di annunciare che i flussi di lavoro di AWS HealthOmics ora supportano la capacità di riutilizzare i risultati delle attività delle esecuzioni precedenti, risparmiando tempo e costi di calcolo per i clienti. AWS HealthOmics è un servizio completamente gestito che consente alle organizzazioni sanitarie e di life sciences di archiviare, interrogare e analizzare dati omici per generare informazioni utili a migliorare la salute e promuovere scoperte scientifiche. Con questa versione, i clienti possono accelerare lo sviluppo di nuove pipeline riprendendo le esecuzioni da un precedente punto di errore o modifica del codice.

Il caching delle chiamate, o la possibilità di riprendere le esecuzioni, consente ai clienti di riavviare le esecuzioni dal punto in cui vengono introdotte nuove modifiche al codice, saltando le attività invariate che sono già state calcolate per consentire cicli di sviluppo del flusso di lavoro iterativi più rapidi. Inoltre, i file intermedi delle attività vengono archiviati in una cache di esecuzione, consentendo il debug avanzato e la risoluzione dei problemi degli errori del flusso di lavoro durante lo sviluppo. Nei flussi di lavoro di produzione, la memorizzazione nella cache delle chiamate salva i risultati parziali delle esecuzioni non riuscite in modo che i clienti possano rieseguire il campione dal punto in cui si è verificato l'errore, anziché calcolare nuovamente le attività completate correttamente, abbreviando i tempi di rielaborazione.

Il caching delle chiamate è ora supportato per i linguaggi di flusso di lavoro Nextflow, WDL e CWL in tutte le regioni in cui è disponibile AWS HealthOmics: Stati Uniti orientali (Virginia settentrionale), Stati Uniti occidentali (Oregon), Europa (Francoforte, Irlanda, Londra), Asia Pacifico (Singapore) e Israele (Tel Aviv). Per iniziare con il caching delle chiamate, consulta la documentazione di AWS HealthOmics.