Автоматическая интерполяция входных параметров для рабочих процессов Nextflow в AWS HealthOmics
Сервис AWS HealthOmics сегодня внедряет автоматическую интерполяцию входных параметров для частных рабочих процессов Nextflow, устраняя необходимость создавать шаблоны параметров вручную. Данное усовершенствование автоматически распознает и извлекает как обязательные, так и дополнительные входные параметры непосредственно из определений рабочих процессов вместе с их описаниями. AWS HealthOmics – это сервис, соответствующий требованиям закона США о мобильности и подотчетности медицинского страхования (HIPAA), который помогает клиентам из сфер здравоохранения и медико-биологических наук ускорять научные открытия за счет полностью управляемых рабочих процессов и хранилищ для биологических данных.
Новая функция позволяет клиентам быстрее запускать рабочие процессы в области биоинформатики, так как им больше не требуется идентифицировать, описывать и проверять каждый параметр рабочего процесса вручную. Это также помогает уменьшить ошибки в конфигурации, которые могут возникать при неверном указании или пропуске параметров. При наличии особых требований клиенты по-прежнему могут вносить собственные шаблоны параметров, которые будут переопределять конфигурации, созданные автоматически.
Интерполяция входных параметров для рабочих процессов Nextflow теперь поддерживается во всех регионах, где доступен сервис AWS HealthOmics: Восток США (Северная Вирджиния), Запад США (Орегон), Европа (Франкфурт, Ирландия, Лондон), Азиатско-Тихоокеанский регион (Сингапур) и Израиль (Тель-Авив). Автоматическая интерполяция параметров для рабочих процессов на языках WDL и CWL поддерживается уже сегодня.
Подробнее об автоматической интерполяции параметров и о создании частных рабочих процессов см. в документации по AWS HealthOmics.