Cromwell auf AWS

Eine Zusammenarbeit mit dem Broad Institute zur Beschleunigung der Genomforschung

Cromwell ist ein Workflow-Management-System des Broad Institute – einer Forschungsorganisation, die sich der Bioinformatik widmet und ihren Sitz in Cambridge, MA, hat. Cromwell ist auf die Durchführung wissenschaftlicher Arbeitsabläufe für die Genomanalyse ausgerichtet. Cromwell ermöglicht es Genomforschern, -wissenschaftlern, -entwicklern und -analytikern, ihre Experimente effizient durchzuführen, ohne dass tiefgreifende Fachkenntnisse in den Backend-Computing-Funktionen erforderlich sind.

Cromwell wird jetzt in der AWS Cloud unterstützt. Cromwell ist eine Engine zur Ausführung von Workflows, die die Orchestrierung von Computing-Aufgaben vereinfacht, die für die Genomanalyse erforderlich sind. AWS Batch, ein vollständig verwalteter Batch-Computing-Service auf Amazon Web Services, stellt dynamisch die optimale Menge geeigneter Computing-Ressourcen bereit (z. B. CPU- oder arbeitsspeicheroptimierte Instances). Die Bereitstellung basiert auf den Volumen- und Ressourcenanforderungen der eingereichten Batch-Aufträge.

Mit Cromwell auf AWS haben Forscher und Wissenschaftler nun noch mehr Flexibilität bei der Skalierung von genomischen Experimenten mit Hilfe von Computing-Funktionen in der Cloud – anstatt um begrenzte Ressourcen On-Premises zu kämpfen.


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Webinar

Eine Einführung in die Ausführung von Cromwell auf Amazon Web Services (AWS)

Sehen Sie sich ein Webinar an, um mehr über Tools, Techniken und bewährte Verfahren für die Entwicklung und Ausführung wissenschaftlicher Workflows zu erfahren, die Cromwell auf AWS verwenden. In dem Webinar wird erläutert, wie Cromwell für AWS Batch, einen vollständig verwalteten Batch-Computing-Service, konfiguriert wird.

Demo-Video

Eine Demo ansehen: Cromwell auf AWS ausführen

Ein kurzes Video, um zwei Beispiele hervorzuheben, die die Cromwell-Funktionen auf AWS demonstrieren: Konfigurieren Sie Cromwell für die Verwendung von AWS Batch und codieren Sie einen einfachen Workflow.


Blog

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