Lewati ke Konten Utama

AWS HealthOmics

Fitur AWS HealthOmics

Mengapa menggunakan AWS HealthOmics

AWS HealthOmics memudahkan penyimpanan, kueri, dan analisis data genomik, transkriptomik, dan omics lainnya, lalu menghasilkan wawasan dari data tersebut. Layanan ini menyederhanakan dan mempercepat proses penyimpanan serta analisis informasi multiomik untuk penelitian serta penerapan klinis sehingga Anda dapat berfokus untuk memperoleh wawasan yang lebih mendalam dari data.

Dengan penyimpanan AWS HealthOmics, Anda dapat menyimpan petabyte data omics secara efisien dan hemat biaya, memungkinkan penemuan ilmiah pada skala populasi. Alur kerja AWS HealthOmics privat dan Ready2Run mengotomatiskan penyediaan dan penskalaan infrastruktur komputasi, sehingga Anda dapat menjalankan pipeline analisis bioinformatika dalam skala produksi serta mengurangi waktu dalam pengelolaan infrastruktur dan menyediakan lebih banyak waktu untuk melakukan riset. AWS HealthOmics dilengkapi dengan kumpulan alur kerja Ready2Run prabangun yang dikenai harga per run. Analitik AWS HealthOmics menyederhanakan penyiapan data omik untuk analisis multimodal, yang memungkinkan Anda menggabungkan data multiomik dan catatan kesehatan serta menghasilkan terapi yang lebih tertarget dan dipersonalisasi. Fitur ini juga memenuhi persyaratan HIPAA.

Topik halaman

Umum

Buka semua

Penyimpanan AWS HealthOmics kompatibel dengan format file bioinformatika seperti FASTQ, BAM, serta CRAM dan memungkinkan Anda menyimpan, menemukan, serta membagikan data ini secara efisien dan hemat biaya. Format file ini disimpan sebagai objek set baca dalam penyimpanan sekuens. Anda juga dapat menyimpan genom referensi dalam format FASTA. Data diimpor sebagai objek tetap dengan pengidentifikasi unik untuk mendukung beban kerja yang memerlukan asal data yang ketat. Akses ke objek data individual, termasuk referensi dan objek set baca, dapat dikontrol menggunakan tanda dan kontrol akses berbasis atribut melalui AWS Identity and Access Management (IAM). Untuk mengurangi biaya penyimpanan jangka panjang, objek data yang tidak diakses selama 30 hari dipindahkan secara otomatis ke kelas penyimpanan arsip. Objek yang diarsipkan dapat diaktifkan kembali kapan saja dengan panggilan API.

AWS HealthOmics membantu Anda menjalankan alur kerja bioinformatika dalam skala besar. Anda dapat memilih alur kerja Ready2Run atau membawa alur kerja privat Anda sendiri untuk memproses data biologis tanpa perlu mengelola infrastruktur yang mendasarinya.

Alur kerja Ready2Run adalah alur kerja prabangun yang dirancang oleh perusahaan perangkat lunak pihak ketiga terkemuka di industri seperti Sentieon, Inc., NVIDIA, dan Element Biosciences bersama dengan pipeline sumber terbuka umum seperti alur kerja praktik terbaik GATK Broad Institute dan AlphaFold untuk prediksi struktur protein. Anda dapat menggunakan alur kerja Ready2Run untuk memproses data Anda tanpa perlu mengelola alat perangkat lunak atau skrip alur kerja. Alur kerja Ready2Run berbasis bayar per run dengan harga yang telah ditentukan sebelumnya.

Alur kerja privat memungkinkan Anda membawa skrip alur kerja Anda sendiri yang ditulis dalam Workflow Description Language (WDL), Common Workflow Language (CWL), atau Nextflow, yang merupakan bahasa alur kerja yang paling umum digunakan. Anda dapat menjalankan alur kerja privat ini dengan eksekusi tunggal, yang dikenal sebagai run. Untuk alur kerja privat, Anda hanya membayar apa yang Anda minta dan akan ditagih secara terpisah untuk tipe instans omik serta penyimpanan run. Semua tugas di alur kerja Anda dipetakan ke instans yang paling cocok dengan sumber daya yang telah ditentukan.

Dengan AWS HealthOmics, Anda dapat menyerap dan mentransformasikan format data genomika dengan cepat, seperti (g)VCF, GFF3, serta TSV/CSV, menjadi tabel Apache Iceberg. Anda bisa menjadikan data genomika dapat diakses melalui layanan analitik seperti Amazon Athena. Anda dapat mengubah data varian (data dari sampel individual) dan data anotasi (informasi yang diketahui tentang posisi dalam genom). Anda dapat mengontrol akses ke penyimpanan analitik dengan AWS Lake Formation agar lebih mudah menjalankan kueri di beragam sumber data seraya mengimplementasikan kontrol akses yang terperinci. Misalnya, Anda dapat menggabungkan data genom seseorang dengan riwayat medis mereka secara aman dari Amazon HealthLake—yang dapat mencakup perawatan sebelumnya, pengobatan, atau laporan lab—untuk memfasilitasi pengobatan yang presisi.

AWS HealthOmics memudahkan para peneliti untuk berkolaborasi melalui penandaan, pengaturan izin, dan berbagi data secara aman dengan kolaborator. Layanan ini menyederhanakan cara untuk menjadikan data omik dapat ditemukan, diakses, dioperasikan, dan digunakan kembali (FAIR). Dengan metadata khusus domain, Anda dapat menautkan penyimpanan data AWS HealthOmics dengan data omik dan data layanan kesehatan lainnya untuk memfasilitasi analisis multiomik serta multimodal. Untuk asal data, AWS HealthOmics mengarsipkan semua metadata yang dijalankan alur kerja di log CloudWatch dan memungkinkan Anda untuk menyimpan kueri informasi ini dengan mudah. Anda dapat mengekspor informasi ini dari CloudWatch ke S3 untuk penyimpanan jangka panjang. Informasi ini dapat membantu melacak algoritma yang digunakan dengan data input Anda agar dapat menghasilkan data output untuk persyaratan kepatuhan.

Keamanan, privasi, dan kepatuhan

Buka semua

AWS HealthOmics memenuhi syarat HIPAA. Anda dapat menerapkan kontrol berbasis atribut untuk menentukan akses dan tata kelola data yang terperinci. Pencatatan dan penangkapan asal yang komprehensif merupakan fitur bawaan, agar Anda mengetahui data apa yang diakses, siapa yang mengaksesnya, dan kapan data diakses.