AWS HealthOmics 资源

用户指南

通过此分步开发人员指南了解如何使用 AWS HealthOmics。

API 参考

阅读此参考指南，了解 AWS HealthOmics API 和参数。

教程

HealthOmics 端到端讲习会

开始使用 HealthOmics 工作流程和存储

HealthOmics 教程

GitHub 上的开源存储库，其中包含演示如何使用 AWS HealthOmics 存储、处理和查询基因组和生物数据集的示例代码

工作流程工具

药物研发工作流程

使用此 AWS HealthOmics 工作流程集合来加速药物研发

示例工作流程

根据开源 HealthOmics 工作流程示例构建私有工作流程

Run Analyzer

Run Analyzer 是一款运行性能优化工具，可从 CloudWatch 检索运行清单日志并生成运行统计数据，包括每个工作流任务的 CPU 和内存利用率

WDL Linter

在运行工作流程之前，使用 HealthOmics WDL linter 检测常见的工作流程错误

Nextflow Linter

在运行工作流脚本之前检查常见的 Nextflow 错误

ECR 帮助程序

使用 ECR 帮助程序将现有容器迁移到您的私有 ECR 存储库

重新运行工具

从 CloudWatch 运行清单日志重新运行存档运行

数据存储工具

读取集传输管理器

从 AWS HealthOmics 参考资料或读取集轻松下载文件

事件驱动的导入程序

CDK 应用程序演示了一种事件驱动架构，当在 Amazon S3 中创建对象时，该架构会自动将数据导入 AWS HealthOmics 序列存储。

序列存储清单生成器

为 AWS HealthOmics 序列存储导入作业生成 JSON 清单

序列存储重复读取集查找器

识别存储在 AWS HealthOmics 序列存储中的重复读取集

解决方案

AWS 实验室数据网格指南

本指南展示了如何构建一个科学数据管理系统，将实验室仪器数据和软件系统[如电子实验室笔记本（ELN）和实验室信息管理系统（LIMS）]与 HealthOmics 相集成。

AWS 上的数字互联实验室指南

本指南可帮助您通过互联网或低延迟的直接连接将生命科学数据仪器和实验室系统文件连接到 AWS 云。

有关如何使用 AWS HealthOmics 迁移和存储序列数据的指南

本指南将演示如何将组学序列数据从 Amazon Simple Storage Service（Amazon S3）导入到 AWS HealthOmics 存储。

有关如何使用 AWS Health 和 ML 服务进行多模式数据分析的指南

本指南演示了如何建立端到端框架来分析多模式医疗保健和生命科学（HCLS）数据。

AWS 生物信息学工作流程指南

本指南介绍了如何大规模构建和运行生产级生物信息学工作流程，以及如何使用 AWS 服务实现自动化、工作流程分析、存储以及运营和成本可观测性。

有关如何使用 AWS Health 和 ML 服务进行多模式数据分析的指南

本指南演示了如何建立端到端框架来分析多模式医疗保健和生命科学（HCLS）数据。