Sederhanakan dan percepat analisis data genomika dengan akses ke alat terbaik di kelasnya yang tersedia untuk menskalakan sesuai permintaan dengan AWS for Genomics.
Alur Kerja Ready2Run AWS HealthOmics
Transformasikan data genomika dan biologis menjadi wawasan
Mengotomatiskan dan Mempercepat Analisis Sekunder
Untuk membantu organisasi genomika mengoptimalkan alur kerja dan mengurangi waktu analisis, AWS untuk Genomika menawarkan berbagai solusi dan layanan otomatisasi alur kerja serta analisis sekunder dari AWS dan Partner AWS. Layanan terkelola seperti AWS HealthOmics menyediakan komputasi bioinformatika terkelola penuh.
Kasus penggunaan analisis sekunder genomika
Otomatisasi alur kerja
Menjalankan alur kerja genomika memerlukan penyediaan dan konfigurasi manual. Alat otomatisasi dan orkestrasi alur kerja dari AWS, Partner AWS, dan komunitas sumber terbuka dapat membantu mempercepat penelitian serta menskalakan kemampuan komputasi. Layanan terkelola seperti AWS HealthOmics menyediakan komputasi bioinformatika terkelola penuh. Anda hanya perlu membawa data, alat, dan ketentuan alur kerja kemudian menjalankan analisis genomika hanya dengan beberapa klik. Buka Pustaka Solusi.
Solusi AWS
Solusi: Otomatiskan alur kerja genomika di AWS dengan Amazon Genomics CLI
Amazon Genomics CLI adalah alat sumber terbuka yang menyediakan antarmuka baris perintah yang mudah digunakan untuk menyiapkan dan menjalankan alur kerja genomika dengan cepat di AWS, yang memungkinkan studi genetika tingkat populasi yang lebih cepat dan hemat biaya, siklus penemuan obat, dan banyak lagi.
Solusi: Analisis Sekunder Genomika Menggunakan AWS Step Functions dan AWS Batch
Analisis Sekunder Genomika Menggunakan solusi AWS Step Functions dan AWS Batch menciptakan lingkungan yang dapat diskalakan di AWS untuk mengembangkan, membangun, melakukan deployment, dan menjalankan alur analisis sekunder genomika, misalnya, memproses seluruh rangkaian genom mentah menjadi panggilan varian.
Pelanggan utama
Dengan AWS, Fred Hutch Microbiome Research Initiative mengurangi waktu komputasi yang awalnya 7 tahun menjadi 7 hari dengan AWS.
Gritstone Oncology menggunakan AWS dan antrean tugas bersama berbasis Nextflow untuk mengirimkan tugas dan menangani aliran data.
Helix menggunakan BaseSpace Sequence Hub, platform analisis data genomika dari Illumina, untuk mendukung pekerjaannya.
Solusi partner unggulan
"Perusahaan diagnostik dan biofarmasi teratas memanfaatkan DNAnexus di AWS untuk mengotomatiskan tugas intensif data berulang untuk kecepatan dan akurasi. Akibatnya, perusahaan-perusahaan ini mencapai pengurangan dramatis dalam penelitian dan pengembangan mereka, yang mempercepat pengembangan alur dari minggu ke jam."
"Seqera Labs dan AWS telah berkolaborasi untuk memastikan bahwa AWS adalah lingkungan pilihan untuk beban kerja ilmu hayati. Nextflow dan Nextflow Tower terintegrasi dengan lancar ke dalam AWS Batch untuk komputasi elastis, EKS untuk deployment yang lancar, dan layanan penyimpanan file serta objek AWS untuk penyimpanan data yang hemat biaya dan beperforma baik."
"Platform Seven Bridges dan alat analisis Seven Bridges, seperti GRAF™ dan ARIA™ mengandalkan fleksibilitas dan skalabilitas AWS untuk memungkinkan peneliti memanfaatkan repositori besar data genomika dan fenotipik—yang berpotensi mengungkapkan wawasan transformatif ke dalam dasar penyakit, pendekatan terapeutik baru, dan model penyakit in silico."
Partner konsultasi utama
Platform DRAGEN Bio-IT dari Illumina memungkinkan analisis data Next Generation Sequencing (NGS) ultracepat untuk set data besar, seperti genom utuh, eksom, dan gen/panel. Analisis tersebut termasuk pemetaan, penyelarasan, pengurutan, penandaan duplikat, pemanggilan varian kecil, dan masih banyak lagi.
Analisis sekunder
Karena adopsi genomika terus dipercepat, analisis sekunder sering dianggap sebagai kendala. Untuk mempercepat analisis dan mengimbangi permintaan yang meningkat, organisasi genomika memanfaatkan skalabilitas dan efisiensi biaya AWS.
Solusi AWS
Layanan: AWS HealthOmics untuk komputasi bioinformatika terkelola penuh
AWS HealthOmics mendukung analisis berskala besar dan penelitian kolaboratif di seluruh populasi dengan penyimpanan data yang dibuat khusus, yang mengubah data genomika dan biologis mentah menjadi wawasan tingkat pasien serta kesehatan populasi.
Solusi: DRAGEN di AWS
Dynamic Read Analysis for Genomics (DRAGEN) Illumina di AWS memungkinkan analisis data pengurutan generasi berikutnya yang sangat cepat.
Solusi: Analisis Sekunder Genomika Menggunakan AWS Step Functions dan AWS Batch
Analisis Sekunder Genomika Menggunakan solusi AWS Step Functions dan AWS Batch menciptakan lingkungan yang dapat diskalakan di AWS untuk mengembangkan, membangun, melakukan deployment, dan menjalankan alur analisis sekunder genomika, misalnya, memproses seluruh rangkaian genom mentah menjadi panggilan varian.
Pelanggan utama
Platform DRAGEN Bio-IT milik Illumina memberikan hasil analisis sekunder yang akurat dan sangat cepat. Pelanggan dapat memperkuat dan mempercepat analisis mereka secara dramatis dengan DRAGEN yang berjalan pada instans Amazon EC2 F1.
Dengan AWS, Munich Leukemia Lab mengurangi waktu penyelesaian untuk memproses data genom pasien dari 20 jam ke 3 jam, dengan membantu mempercepat riset dan meningkatkan diagnosis leukemia.
Ancestry mengandalkan Amazon EFS untuk memungkinkan banyak ilmuwan melakukan penelitian genomika, meningkatkan atau menurunkan skala komputasi dan penyimpanan, serta mengikutsertakan ilmuwan dengan lebih cepat.
Solusi partner unggulan
"Akurasi dan kecepatan sangat penting untuk membuka kekuatan genom manusia. Platform DRAGEN Bio-IT oleh Illumina, memberikan hasil analisis sekunder yang akurat dan sangat cepat. Pelanggan dapat memperkuat dan mempercepat analisis mereka secara dramatis dengan DRAGEN yang berjalan di AWS."
"Pipeline NVIDIA Clara Parabricks adalah kerangka kerja komputasi berakselerasi GPU, yang mendukung aplikasi genomika yang menjangkau DNA hingga RNA. Akselerasi Parabricks yang digabungkan dengan skalabilitas AWS mendorong industri genomika untuk melakukan proyek lebih cepat, lebih hemat biaya, dan memungkinkan peneliti mengidentifikasi lebih banyak varian genetik dalam data mereka."
"Platform Seven Bridges dan alat analisis Seven Bridges, seperti GRAF™ dan ARIA™ mengandalkan fleksibilitas dan skalabilitas AWS untuk memungkinkan peneliti memanfaatkan repositori besar data genomika dan fenotipik—yang berpotensi mengungkapkan wawasan transformatif ke dalam dasar penyakit, pendekatan terapeutik baru, dan model penyakit in silico."
Partner konsultasi utama
Sumber daya unggulan
Mengoptimalkan Biaya Komputasi Analisis Sekunder
Pelajari cara mengoptimalkan biaya komputasi analisis sekunder menggunakan Amazon Elastic Compute Cloud (EC2), instans spot, dan AWS Batch.
