Gambaran Umum

Dengan AWS HealthOmics, Anda hanya membayar sesuai penggunaan. Anda dikenai biaya berdasarkan jumlah data yang disimpan dan instans komputasi yang digunakan untuk memproses alur kerja. Dengan AWS HealthOmics, Anda dapat menyimpan sekuens dan objek atau varian data referensi serta data anotasi. Anda juga dapat menjalankan alur kerja bioinformatika untuk menganalisis dan mentransformasikan data genomika, transkriptomik, atau data omik lainnya. AWS HealthOmics dioptimalkan untuk penyimpanan dan komputasi data omik serta dapat digunakan dengan layanan AWS lainnya, seperti Amazon SageMaker, Amazon Simple Storage Service (S3), dan Amazon Athena.

Tingkat Gratis

Sebagai bagian dari AWS Tingkat Gratis, Anda dapat mulai menggunakan AWS HealthOmics secara gratis. Tingkat gratis dimulai dari bulan pertama ketika Anda membuat sumber daya AWS HealthOmics pertama. Detail AWS HealthOmics Tingkat Gratis ada di tabel berikut ini.

 

Penggunaan Tingkat Gratis per bulan untuk 2 bulan pertama

Penyimpanan AWS HealthOmics 1.500 gigabase-bulan di kelas penyimpanan aktif dan 1.500 gigabase-bulan di kelas penyimpanan arsip
Alur kerja AWS HealthOmics

275 jam instans omics.m.xlarge atau instans komputasi yang setara dan 49.000 GB-jam penyimpanan berjalan

Analitik AWS HealthOmics 200 gigabita-bulan

Pelanggan AWS menerima 100GB transfer data keluar ke internet secara gratis setiap bulan, yang dihitung secara agregat di seluruh Layanan dan Wilayah AWS (kecuali Tiongkok dan GovCloud).

Harga penyimpanan AWS HealthOmics

Saat menyimpan urutan genomika di penyimpanan AWS HealthOmics, Anda membayar penyimpanan per gigabase per bulan. Satu gigabase sama dengan satu miliar base dari file sekuens yang diimpor (seperti FASTQ, BAM, dan CRAM). Penyimpanan AWS HealthOmics menyimpan base, skor kualitas, penyelarasan, dan metadata lain dari file sumber Anda. Anda membayar per gigabase yang disimpan sehingga tidak perlu khawatir tentang format file atau teknik kompresi yang optimal. AWS HealthOmics menangani semua hal tersebut untuk Anda.

Objek sekuens disebut set baca dan secara logis setara dengan file FASTQ, BAM, atau CRAM. Penyimpanan AWS HealthOmics menawarkan kelas penyimpanan aktif dan kelas penyimpanan arsip untuk set baca Anda. Biaya penyimpanan bulanan set baca di kelas arsip lebih rendah dibandingkan set baca di kelas aktif. Set baca di kelas aktif dapat diakses dalam hitungan milidetik, sedangkan set baca di tingkat arsip harus diaktivasi sebelum dapat diakses. Jika tidak diakses selama 30 hari, set baca dialihkan secara otomatis ke kelas penyimpanan berbiaya lebih rendah hingga diaktifkan kembali.

Tidak ada biaya impor untuk set baca. Data penyimpanan AWS HealthOmics dikenai biaya untuk durasi penyimpanan minimum selama 30 hari dan data yang dihapus sebelum 30 hari akan dikenai biaya prorata yang setara dengan biaya penyimpanan untuk jumlah hari yang tersisa. Penyimpanan AWS HealthOmics didesain untuk data yang tahan lama tetapi jarang diakses yang dipertahankan selama bertahun-tahun.

Terdapat dua cara untuk mengakses data penyimpanan AWS HealthOmics: Dengan membaca, menulis, dan memperbarui melalui API HealthOmics serta dengan membaca melalui API S3.  Untuk akses melalui API HealthOmics, Anda membayar permintaan GET yang dibuat ke objek set-baca Anda. Semua tipe permintaan HealthOmics lainnya di set baca tidak dikenakan biaya. Untuk akses melalui API S3, permintaan COPY dan LIST ditagih secara terpisah dari semua tipe permintaan lainnya.  

Permintaan GET dan LIST melalui penggunaan API Amazon S3 akan ditagih dengan tarif API S3 (lihat harga di sini).

Harga analitik AWS HealthOmics

Analitik AWS HealthOmics membantu Anda menyiapkan data varian genomika dan anotasi genomika untuk digunakan dengan berbagai rangkaian layanan analitik serta machine learning AWS, seperti Amazon Athena dan Amazon SageMaker. Anda dapat menyimpan data varian genomika dengan jumlah berapa pun dan hanya membayar data yang Anda simpan. Ukuran data ditentukan sebagai ukuran data yang diubah. Namun, saat membuat kueri dan menganalisis data di layanan lain, Anda membayar penggunaan layanan tersebut.

Data analitik AWS HealthOmics dikenai biaya untuk durasi penyimpanan minimum selama 30 hari dan data yang dihapus sebelum 30 hari akan dikenai biaya prorata yang setara dengan biaya penyimpanan untuk jumlah hari yang tersisa.

Harga alur kerja privat dan Ready2Run AWS HealthOmics

AWS HealthOmics juga mengelola eksekusi alur kerja bioinformatika dengan alur kerja privat dan Ready2Run.

Alur kerja privat memungkinkan Anda membawa skrip bioinformatika miliki Anda sendiri yang ditulis dalam bahasa alur kerja yang paling sering digunakan. Anda dapat menjalankan alur kerja privat dengan satu eksekusi. Anda hanya membayar permintaan dan akan dikenai biaya secara terpisah untuk tipe instans serta penyimpanan run omics. Semua tugas di alur kerja Anda dipetakan ke instans yang paling cocok dengan sumber daya yang telah ditentukan. Misalnya, tugas yang ditentukan untuk menggunakan 8 CPU dan RAM sebesar 60 GB akan dipetakan ke tipe instans omics.r.2xlarge untuk eksekusi.

Alur kerja Ready2Run adalah alur kerja prabangun yang telah dikemas oleh perusahaan perangkat lunak pihak ketiga industri dan pipeline sumber terbuka. Anda cukup menggunakan alur kerja Ready2Run untuk memproses data Anda dengan alur kerja yang paling sering digunakan seperti Germline dan GATK-BP. Alur kerja Ready2Run berbasis pembayaran per run yang berarti bahwa Anda dikenai harga yang sama untuk setiap alur kerja.

Untuk alur kerja privat dan Ready2Run, log disimpan di log Amazon CloudWatch dalam akun Anda dan akan ditagih di CloudWatch selama Anda memilih untuk mempertahankannya. Anda dapat mengonfigurasi layanan untuk melaporkan penggunaan sumber daya per run untuk pembuatan anggaran, perencanaan, dan pencatatan yang lebih sederhana.

  • Alur kerja privat
  • Alur kerja Ready2Run

Contoh harga

Contoh 1

Inisiatif sekuensing populasi mulai membuat sekuens individu dari biobank yang telah mereka kumpulkan. Mereka memilih untuk melakukan ini di Wilayah UE Barat (Irlandia). Mereka mengurutkan 100.000 individu, masing-masing berukuran 130 gigabase, 50 gigabita, dan menyimpan data pengurutan mentah di penyimpanan AWS HealthOmics. Selama lima tahun berikutnya, data tersebut tetap berada di kelas penyimpanan arsip setelah 30 hari sejak diimpor dan rata-rata diakses dua kali, ketika data ditransisikan ke kelas penyimpanan aktif selama 30 hari. Mereka menggunakan API S3 untuk mengakses file. Setiap genom diunduh dalam 500 bagian dan menghasilkan 500 panggilan API GET. Total biaya mereka selama lima tahun untuk satu genom adalah:
Kelas penyimpanan aktif: 0,005769 USD gigabase/bulan * 130 gigabase * 90 hari = 2,22 USD
Kelas penyimpanan arsip: 0,001154 USD gigabase/bulan * 130 gigabase * (1825 – 90) hari = 8,56 USD.
API GET S3: 0,0004 USD/1000 panggilan API * (2 * 500 panggilan API) = 0,0004 USD
Total biaya selama 5 tahun: 2,22 USD + 8,56 USD + 0,0004 USD = 10,78 USD (atau 2,15 USD/tahun)

Contoh 2

Seorang ilmuwan bioinformatika ingin menjalankan alur kerja Nextflow di alur kerja AWS HealthOmics di Wilayah AS Timur (Virginia Utara). Ia memiliki tiga tugas di alur kerja tersebut. Tugas pertama memerlukan 16 vCPU, memori sebesar 30 GB, dan waktu 3 jam untuk dijalankan. Tugas kedua memerlukan 32 vCPU, memori sebesar 160 GB, dan waktu 2 jam untuk dijalankan. Tugas ketiga memerlukan 4 vCPU, memori sebesar 10 GB, dan waktu 10 menit untuk dijalankan. Pelanggan mendaftarkan alur kerja dan memanggil API StartRun dengan sistem file default sebesar 1200 GB. Total biaya keseluruhannya adalah:
Tugas 1 (omics.c.4xlarge): 0,9180 USD/jam * 3 jam = 2,754 USD
Tugas 2 (omics.r.8xlarge):
2,7216 USD/jam * 2 jam = 5,4432 USD
Tugas 3 (omics.m.xlarge): 0,2592 USD/jam * 1/6 jam = 0,0432 USD
Penyimpanan: 0,0001918 USD/ GB-jam * (1200GB*(3 jam+2 jam+1/6 jam)) = 1,18916 USD
Total: 9,42956 USD

Contoh 3

Seorang ilmuwan data memiliki 3.202 file format panggilan varian (VCF) yang ingin dianalisis di Amazon Athena di Wilayah AS Timur (Virginia Utara). Ia membuat penyimpanan varian dan menyerap file tersebut menggunakan API AWS HealthOmics. Data yang diserap berukuran 1,5 TB. Selama bulan berikutnya, ia mengeksekusi 1.000 kueri di Athena, menghitung frekuensi alel untuk subpopulasi yang berbeda, dan tiap kueri rata-rata mengonsumsi 50 GB. Biaya bulanan keseluruhannya adalah:
Penyimpanan varian: 0,035 USD GB/bulan * (1024 GB/TB * 1,5 TB) = 53,76 USD
Amazon Athena: 5 USD / TB * 1000 * 50 / 1024 = 244,14 USD

Contoh 4

Seorang ilmuwan komputasi ingin menjalankan GATK-BP Germline fq2vcf untuk alur kerja 30x genome Ready2Run di Wilayah AS Timur (Virginia Utara) untuk 3 sampel. Pelanggan memasukkan data mereka dan memanggil API StartRun untuk setiap sampel. Biaya untuk 3 run adalah:
GATK-BP Germline fq2vcf untuk alur kerja 30x genome Ready2Run: 10,00 USD/run * 3 = 30,00 USD
Total: 30,00 USD

Sumber daya harga tambahan

Kalkulator Harga AWS

Hitung biaya bulanan Anda secara mudah dengan AWS

Economics Resource Center

Hubungi spesialis AWS untuk mendapatkan penawaran pribadi