Piano gratuito

Grazie al Piano gratuito AWS, è possibile iniziare a utilizzare AWS HealthOmics gratuitamente. Il piano gratuito si attiva il primo giorno del mese in cui crei la tua prima risorsa AWS HealthOmics. I dettagli del piano gratuito di AWS HealthOmics sono riportati nella tabella di seguito.

 

Uso del piano gratuito mensile per i primi 2 mesi

Archiviazione di AWS HealthOmics 1.500 gigabase al mese nella classe di archiviazione attiva e 1.500 gigabase al mese nella classe di archiviazione
Flussi di lavoro di AWS HealthOmics

275 ore di istanza omics.m.xlarge oppure istanze equivalenti di calcolo e 49.000 GB all’ora di archiviazione

Analisi di AWS HealthOmics 200 gigabyte al mese

Prezzi dell’archiviazione di AWS HealthOmics

Quando archivi le sequenze genomiche nell’archivio di AWS HealthOmics, paghi l’archiviazione per gigabase al mese. Un gigabase è un miliardo di basi dai file di sequenza importati (come FASTQ, BAM e CRAM). L’archiviazione di AWS HealthOmics archivia le basi, i punteggi di qualità, gli allineamenti e altri metadati dai file di origine. Paghi per gigabase memorizzato, quindi non devi preoccuparti di formati di file o tecniche di compressione ottimali. AWS HealthOmics si occupa di tutto questo per te.

Gli oggetti sequenza sono chiamati set di lettura e dal punto di vista logico sono equivalenti a un file FASTQ, BAM o CRAM. L'archiviazione di AWS HealthOmics offre una classe di archiviazione attiva e una per i set di lettura. L'archiviazione dei set di lettura nella classe di archiviazione costa meno al mese rispetto alla classe attiva. È possibile accedere ai set di lettura nella classe attiva nell'arco di millisecondi, mentre quelli nel livello di archiviazione devono essere attivati prima di potervi accedere. Dopo il mancato accesso ai set di lettura per 30 giorni, questi passano automaticamente alla classe di archiviazione a costo ridotto finché non vengono riattivati.

I set di lettura non prevedono costi di importazione. I dati di archiviazione di AWS HealthOmics vengono addebitati per una durata minima di archiviazione di 30 giorni e i dati eliminati prima dei 30 giorni comportano un addebito proporzionale pari al costo di archiviazione per i giorni rimanenti. L’archiviazione di AWS HealthOmics è progettata per dati di lunga durata, ma a cui si accede raramente e che vengono conservati per anni.

Paghi in base alle richieste GET inviate ai tuoi oggetti set di lettura. Tutti gli altri tipi di richiesta sui set di lettura sono gratuiti.

Prezzi di analisi AWS HealthOmics

L'analisi di AWS HealthOmics ti aiuta a preparare i dati delle varianti genomiche e le annotazioni genomiche da utilizzare con l'ampia suite di analisi AWS e servizi di machine learning come Amazon Athena e Amazon SageMaker. Puoi archiviare qualsiasi quantità di dati sulle varianti genomiche e paghi solo per ciò che archivi. La dimensione dei dati è definita come la dimensione dei dati trasformati. Tuttavia, quando esegui query e analizzi i dati in altri servizi, paghi per l'utilizzo di tali servizi.

I dati di analisi di AWS HealthOmics vengono addebitati per una durata di archiviazione minima di 30 giorni e i dati eliminati prima dei 30 giorni comportano un addebito proporzionale pari al costo di archiviazione per i giorni rimanenti.

Prezzi dei flussi di lavoro privati e Ready2Run di AWS HealthOmics

AWS HealthOmics gestisce anche l'esecuzione di flussi di lavoro bioinformatici con flussi di lavoro privati e Ready2Run.

I flussi di lavoro privati ti consentono di portare i tuoi script bioinformatici scritti nei linguaggi di flusso di lavoro più comunemente usati. Puoi eseguire flussi di lavoro privati con un'unica esecuzione. Il prezzo viene calcolato solo in base alle richieste e viene addebitato separatamente per i tipi di istanza omici e l'esecuzione dell'archiviazione. Tutte le attività nel tuo flusso di lavoro sono mappate all'istanza che si adatta meglio alle loro risorse definite. Ad esempio, un'attività definita per utilizzare 8 CPU e 60 GB di RAM verrà mappata al tipo di istanza omics.r.2xlarge per l'esecuzione.

I flussi di lavoro Ready2Run sono flussi di lavoro predefiniti che sono stati confezionati da società di software terze del settore e pipeline open source. Puoi semplicemente utilizzare i flussi di lavoro Ready2Run per elaborare i tuoi dati con i flussi di lavoro più comunemente usati come Germline e GATK-BP. I flussi di lavoro Ready2Run sono pay-per-run, il che significa che viene addebitato lo stesso prezzo per ogni flusso di lavoro.

Per i flussi di lavoro privati e Ready2Run, i log vengono archiviati nei file di log Amazon CloudWatch nel tuo account e fatturati in CloudWatch per tutto il tempo in cui decidi di conservarli. È possibile configurare il servizio in modo da segnalare l'utilizzo per esecuzione per budget, pianificazione e contabilità semplificati.

  • Flussi di lavoro privati
  • Flussi di lavoro Ready2Run

Esempi di prezzo

Esempio 1

Un'iniziativa di sequenziamento della popolazione sta iniziando a sequenziare gli individui da una biobanca raccolta. Si è scelto di farlo nella Regione Europa occidentale (Irlanda). Sequenziano 100.000 individui, ciascuno su 130 gigabase e archiviano i dati di sequenziamento non elaborati nell’archivio di AWS HealthOmics. Nei successivi cinque anni, rimangono nella classe di archiviazione dell'archivio dopo i 30 giorni successivi all'importazione e vi si accede in media due volte quando passano alla classe di archiviazione attiva per 30 giorni. Ogni genoma viene scaricato in 500 parti, generando 500 chiamate API GET. Il loro costo totale in cinque anni per un singolo genoma è:
Classe di archiviazione attiva: 0,005769 USD gigabase/mese * 130 gigabase * 90 giorni = 2,22 USD
Classe di archiviazione attiva: 0,001154 USD gigabase/mese * 130 gigabase * (1.825-90) giorni = 8,56 USD.
API GET: 0,005/1.000 chiamate API * (2 * 500 chiamate API) = 0,005 USD
Costo totale per 5 anni: 2,22 USD + 8,56 USD + 0,005 USD = 10,79 USD (o 2,16 USD/anno)

Esempio 2

Una scienziata bioinformatica desidera eseguire un flusso di lavoro Nextflow nei flussi di lavoro AWS HealthOmics nella Regione degli Stati Uniti orientali (Virginia settentrionale). Ha tre attività nel flusso di lavoro. La prima riserva 16 vCPU e 30 GB di memoria e impiega 3 ore per essere eseguita. La seconda richiede 32 vCPU e 160 GB di memoria e impiega 2 ore per essere eseguita. La terza riserva 4 vCPU e 10 GB di memoria e impiega 10 minuti per l'esecuzione. Il cliente registra il flusso di lavoro e chiama l'API StartRun con il file system predefinito da 1.200 GB. I costi complessivi addebitati sono:
Attività 1 (omics.c.4xlarge): 0.918 USD/ora * 3 ore = 2,754 USD
Attività 2 (omics.c.8xlarge):
2,7216 USD/ora * 2 ore = 5,4432 USD
Attività 3 (omics.m.xlarge): 0,2592 USD/ora * 1/6 ore = 0,0432 USD
Archiviazione: 0.0001918 USD/GB all’ora * (1.200 GB* (3 ore+2 ore+1/6 ora)) = 1,18916 USD
Total: 9,42956 USD

Esempio 3

Uno scienziato di dati ha 3.202 file di formato (VCF) di chiamata che desidera analizzare in Amazon Athena nella regione della Virginia orientale (Virginia settentrionale). Crea un archivio di variante e inserisce questi file con le API di AWS HealthOmics. I dati inseriti hanno la dimensione di 1,5 TB. Nel corso del mese successivo, esegue 1.000 query in Athena, calcolando le frequenze alleliche per diverse sottopopolazioni, ciascuna delle quali consuma in media 50 GB. I suoi costi totali mensili sono:
Archivio di variante: 0,035 USD GB/mese * (1.024 GB/TB * 1,5 TB) = 53,76 USD
Amazon Athena: 5 USD/TB * 1.000 * 50/1.024 = 244,14 USD

Esempio 4

Uno scienziato computazionale desidera eseguire la linea germinale GATK-BP fq2vcf per un flusso di lavoro Ready2Run del genoma 30x nella regione degli Stati Uniti orientali (Virginia settentrionale) per 3 campioni. Il cliente inserisce i propri dati e chiama l'API StartRun per ogni campione. Il costo per le 3 esecuzioni è:
GATK-BP Germline fq2vcf per un flusso di lavoro Ready2Run con genoma 30x: 10 USD per esecuzione * 3 = 30 USD
Totale: 30 USD

Risorse aggiuntive sui prezzi

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