Piano gratuito

Poiché hai accesso al piano gratuito AWS, puoi iniziare a utilizzare Amazon Omics gratuitamente. Il piano gratuito si attiva il primo giorno del mese in cui crei la tua prima risorsa Amazon Omics. I dettagli del piano gratuito di Amazon Omics sono riportati nella tabella di seguito.

 

Uso del piano gratuito mensile per i primi 2 mesi

Domande frequenti su Amazon Omics 1.500 gigabase al mese nella classe di archiviazione attiva e 1.500 gigabase al mese nella classe di archiviazione
Flussi di lavoro di Amazon Omics

Ore di istanza da 275 omics.m.xlarge oppure istanze equivalenti di calcolo e 49.000 GB all’ora di archiviazione

Analisi di Amazon Omics 200 gigabyte al mese

Prezzi per l’archivio di Amazon Omics

Quando archivi le sequenze genomiche nell’archivio di Amazon Omics, paghi l’archivio per gigabase al mese. Un gigabase è un miliardo di basi dai file di sequenza importati (come FASTQ, BAM e CRAM). L’archivio di Amazon Omics archivia le basi, i punteggi di qualità, gli allineamenti e altri metadati dai file di origine. Paghi per gigabase memorizzato, quindi non devi preoccuparti di formati di file o tecniche di compressione ottimali. Amazon Omics si occupa di tutto questo per te.

Gli oggetti sequenza sono chiamati set di lettura e sono logicamente equivalenti a un file FASTQ, BAM o CRAM. L’archivio Amazon Omics ti offre una classe di archiviazione attiva e una per i tuoi set di lettura. I set di lettura nella classe di archiviazione costano meno al mese per l'archiviazione rispetto a quelli nella classe attiva. È possibile accedere ai set di lettura nella classe attiva in millisecondi, mentre quelli nel livello di archiviazione devono essere attivati prima di potervi accedere. Dopo il mancato accesso ai set di lettura per 30 giorni, questi passano automaticamente alla classe di archiviazione a costo ridotto finché non vengono riattivati.

Non ci sono costi di importazione per i set di lettura. I dati di archiviazione di Amazon Omics vengono addebitati per una durata minima di archiviazione di 30 giorni e i dati eliminati prima dei 30 giorni comportano un addebito proporzionale pari al costo di archiviazione per i giorni rimanenti. L’archivio di Amazon Omics è progettato per dati di lunga durata, ma a cui si accede raramente e che vengono conservati per anni.

Paghi per le richieste GET fatte ai tuoi oggetti set di lettura. Tutti gli altri tipi di richiesta sui set di lettura sono gratuiti.

Prezzi per analisi di Amazon Omics

L'analisi di Amazon Omics ti aiuta a preparare i dati delle varianti genomiche e le annotazioni genomiche da utilizzare con l'ampia suite di analisi AWS e servizi di machine learning come Amazon Athena e Amazon SageMaker. Puoi archiviare qualsiasi quantità di dati sulle varianti genomiche e paghi solo per ciò che archivi. La dimensione dei dati è definita come la dimensione dei dati trasformati. Tuttavia, quando esegui query e analizzi i dati in altri servizi, paghi per l'utilizzo di tali servizi.

I dati di analisi di Amazon Omics vengono addebitati per una durata di archiviazione minima di 30 giorni e i dati eliminati prima dei 30 giorni comportano un addebito proporzionale pari al costo di archiviazione per i giorni rimanenti.

Prezzi per flussi di lavoro di Amazon Omics

Amazon Omics gestisce anche l'interpretazione e l'esecuzione dei flussi di lavoro bioinformatici. I flussi di lavoro di Amazon Omics possono eseguire script bioinformatici scritti nei due linguaggi di flusso di lavoro più comunemente utilizzati: WDL e Nextflow. Una singola esecuzione di questi script è chiamata un'esecuzione. Il prezzo viene calcolato solo in base all'uso effettivo e viene addebitato separatamente per i tipi di istanza omici e l'esecuzione dell'archiviazione. Tutte le attività nel tuo flusso di lavoro sono mappate all'istanza che si adatta meglio alle loro risorse definite. Ad esempio, un'attività definita per utilizzare 8 CPU e 60 GB di RAM verrà mappata al tipo di istanza omics.r.2xlarge per l'esecuzione. I log del flusso di lavoro vengono archiviati nei log di Amazon CloudWatch nel tuo account e fatturati in CloudWatch per tutto il tempo in cui decidi di conservarli. È possibile configurare il servizio in modo da segnalare l'utilizzo per esecuzione per budget, pianificazione e contabilità semplificati.

Esempi di prezzo

Esempio 1

Un'iniziativa di sequenziamento della popolazione sta iniziando a sequenziare gli individui da una biobanca raccolta. Si è scelto di farlo nella regione occidentale (Irlanda) dell’UE. Sequenziano 100.000 individui, ciascuno su 130 gigabase e archiviano i dati di sequenziamento non elaborati nell’archivio di Amazon Omics. Nei successivi cinque anni, rimangono nella classe di archiviazione dell'archivio dopo i 30 giorni successivi all'importazione e vi si accede in media due volte quando passano alla classe di archiviazione attiva per 30 giorni. Ogni genoma viene scaricato in 500 parti, generando 500 chiamate API GET. Il loro costo totale in cinque anni per un singolo genoma è:
Classe di archiviazione attiva: 0,005769 USD gigabase/mese * 130 gigabase * 90 giorni = 2,22 USD
Classe di archiviazione attiva: 0,001154 USD gigabase/mese * 130 gigabase * (1.825-90) giorni = 8,56 USD.
API GET: 0,005/1.000 chiamate API * (2 * 500 chiamate API) = 0,005 USD
Costo totale per 5 anni: 2,22 USD + 8,56 USD + 0,005 USD = 10,79 USD (o 2,16 USD/anno)

Esempio 2

Una scienziata bioinformatica desidera eseguire un flusso di lavoro Nextflow nei flussi di lavoro Amazon Omics nella regione degli Stati Uniti orientali (Virginia settentrionale). Ha tre attività nel flusso di lavoro. La prima riserva 16 vCPU e 30 GB di memoria e impiega 3 ore per essere eseguita. La seconda richiede 32 vCPU e 160 GB di memoria e impiega 2 ore per essere eseguita. La terza riserva 4 vCPU e 10 GB di memoria e impiega 10 minuti per l'esecuzione. Il cliente registra il flusso di lavoro e chiama l'API StartRun con il file system predefinito da 1.200 GB. I costi complessivi addebitati sono:
Attività 1 (omics.c.4xlarge): 0.918 USD/ora * 3 ore = 2,754 USD
Attività 2 (omics.c.8xlarge):
2,7216 USD/ora * 2 ore = 5,4432 USD
Attività 3 (omics.m.xlarge): 0,2592 USD/ora * 1/6 ore = 0,0432 USD
Archiviazione: 0.0001918 USD/GB all’ora * (1.200 GB* (3 ore+2 ore+1/6 ora)) = 1,18916 USD
Total: 9,42956 USD

Esempio 3

Uno scienziato di dati ha 3.202 file di formato (VCF) di chiamata che desidera analizzare in Amazon Athena nella regione della Virginia orientale (Virginia settentrionale). Crea un archivio di variante e inserisce questi file con le API di Amazon Omics. I dati inseriti hanno la dimensione di 1,5 TB. Nel corso del mese successivo, esegue 1.000 query in Athena, calcolando le frequenze alleliche per diverse sottopopolazioni, ciascuna delle quali consuma in media 50 GB. I suoi costi totali mensili sono:
Archivio di variante: 0,035 USD GB/mese * (1.024 GB/TB * 1,5 TB) = 53,76 USD
Amazon Athena: 5 USD/TB * 1.000 * 50/1.024 = 244,14 USD

Risorse di prezzi aggiuntive

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