AWS HealthOmics kaynakları

Kullanıcı Kılavuzu

Bu adım adım açıklamalı geliştirici kılavuzunda AWS HealthOmics'i nasıl kullanacağınızı öğrenin.

API Başvurusu

AWS HealthOmics API'leri ve parametreleri için bu referans kılavuzunu okuyun.

Öğreticiler

HealthOmics Uçtan Uca Atölye Çalışması

HealthOmics iş akışlarını ve depolamayı kullanmaya başlayın

HealthOmics Eğitimleri

AWS HealthOmics'i kullanarak genomik ve biyolojik veri kümelerinin nasıl depolanacağını, işleneceğini ve sorgulanacağını gösteren örnek kod içeren GitHub'da açık kaynak deposu

İş Akışı Araçları

İlaç Keşfi İş Akışları

İlaç keşfini hızlandırmak için AWS HealthOmics iş akışlarının bu koleksiyonunu kullanın

Örnek İş Akışları

Açık kaynaklı HealthOmics iş akışı örneklerine dayalı özel iş akışları oluşturun

Çalıştırma Analiz Aracı

Çalıştırma analiz aracı, CloudWatch'tan çalıştırma bildirimi günlüklerini alan ve her bir iş akışı görevi için CPU ve bellek kullanımı dahil olmak üzere çalıştırma için istatistikler üreten bir çalıştırma performansı optimizasyon aracıdır

WDL Linter

İş akışlarını çalıştırmadan önce yaygın iş akışı hatalarını tespit etmek için HealthOmics WDL Linter'ı kullanın

Nextflow Linter

Bir iş akışı komut dosyası çalıştırılmadan önce yaygın Nextflow hataları için Lint

ECR Yardımcısı

ECR yardımcı aracını kullanarak mevcut container'ları özel ECR deponuza taşıyın

Yeniden Çalıştırma Aracı

CloudWatch çalıştırma bildirimi günlüklerinden arşivlenmiş çalıştırmaları yeniden çalıştırın

Veri Depolama Alanı Araçları

Set Transfer Yöneticisi'ni okuyun

Bir AWS HealthOmics referansından veya okuma setinden dosyaları kolayca indirin

Olay Odaklı İçe Aktarma Aracı

Amazon S3'te nesneler oluşturulduğunda AWS HealthOmics dizi depolarına veri içe aktarmayı otomatikleştiren olay odaklı bir mimariyi gösteren CDK uygulaması.

Dizi Deposu Bildirim Oluşturucu

AWS HealthOmics dizi deposu içe aktarma işleri için bir json bildirimi oluşturur

Dizi Deposu Yinelenen Okuma Kümesi Bulucu

AWS HealthOmics dizi depolarında depolanan yinelenen okuma kümelerini tanımlar

Çözümler

AWS'de Bir Laboratuvar Veri Ağı İçin Rehberlik

Bu Rehber, hem laboratuvar aleti verilerini hem de elektronik laboratuvar not defterleri (ELN'ler) ve laboratuvar bilgi yönetim sistemleri (LIMS) gibi yazılım sistemlerini HealthOmics ile entegre eden bilimsel bir veri yönetim sisteminin nasıl oluşturulacağını göstermektedir.

AWS'de Dijital Bağlantılı Laboratuvarla İlgili Rehberlik

Bu Rehber, yaşam bilimleri veri araçlarını ve laboratuvar sistem dosyalarını internet üzerinden veya düşük gecikme süresiyle doğrudan bir bağlantı üzerinden AWS Bulut'a bağlamanıza yardımcı olur.

AWS HealthOmics ile Dizi Verilerini Taşıma ve Depolama Rehberi

Bu Rehber, omik dizi verilerinin Amazon Basit Depolama Hizmeti'nden (Amazon S3) AWS HealthOmics Depolama Alanı'na nasıl aktarılacağını açıklar.

AWS Durum ve Makine Öğrenimi Hizmetleriyle Çok Modlu Veri Analizi Rehberi

Bu Rehber, çok modlu sağlık hizmetleri ve yaşam bilimleri (HCLS) verilerini analiz etmek için uçtan uca bir çerçevenin nasıl kurulacağını gösterir.

AWS'de Biyoinformatik İş Akışları Rehberi

Bu Rehber, üretim düzeyinde biyoinformatik iş akışlarını geniş ölçekte nasıl oluşturup çalıştırabileceğinizi ve AWS hizmetlerini; otomasyon, iş akışı analizi, depolama, ayrıca operasyonel ve maliyet gözlemlenebilirliği için nasıl kullanabileceğinizi gösterir.