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Lösungen für die Sekundäranalyse
Optimieren und beschleunigen Sie die Analyse von Genomdaten mit Zugriff auf erstklassige Tools, die für die On-Demand-Skalierung mit AWS for Genomics verfügbar sind.
Ready2Run-Workflows von AWS HealthOmics
Umwandlung genomischer und biologischer Daten in Erkenntnisse
Automatisieren und Beschleunigen der Sekundäranalyse
Um Genomik-Organisationen bei der Optimierung von Workflows und der Verkürzung von Analysezeiten zu unterstützen, stellt AWS für die Genomik eine Vielzahl von Lösungen und Services zur Workflow-Automatisierung und Sekundäranalyse von AWS und AWS-Partnern bereit. Verwaltete Services wie AWS HealthOmics stellen vollständig verwaltete Bioinformatik-Datenverarbeitung bereit.
Workflow-Automatisierung
Für die Ausführung von Genomik-Workflows sind manuelle Bereitstellung und Konfigurationen erforderlich. Workflow-Automatisierungs- und Orchestrierungstools von AWS, AWS-Partnern und der Open-Source-Community können dazu beitragen, die Forschung zu beschleunigen und die Rechenkapazitäten zu skalieren. Managed Services wie AWS HealthOmics stellen vollständig verwaltete Datenverarbeitung für die Bioinformatik bereit. Bringen Sie einfach Ihre Daten, Tools und die Definition des Workflows mit und führen Sie Ihre Genomanalysen mit nur wenigen Klicks aus. Gehen Sie zur Lösungsbibliothek .
AWS-Lösungen
Vorgestellte Kunden
Fred Hutchinson Cancer Research Center
Die Fred Hutch Microbiome Research Initiative reduziert mit AWS die Rechenzeit von 7 Jahren auf 7 Tage. Die Fallstudie lesen
Gritstone Oncology
Gritstone Oncology verwendet AWS und eine Nextflow-gesteuerte gemeinsam genutzte Auftragswarteschlange, um Aufträge zu versenden und den Datenaustausch zu verarbeiten. Die Fallstudie lesen
Helix
Helix nutzt BaseSpace Sequence Hub, eine Plattform zur Analyse von Genomdaten von Illumina, um seine Arbeit voranzutreiben. Video ansehen
Vorgestellte Partnerlösungen
DNAnexus
„Führende Diagnostik- und Biopharmaunternehmen setzen DNAnexus in AWS ein, um wiederkehrende datenintensive Aufgaben zu automatisieren und so Geschwindigkeit und Genauigkeit zu gewährleisten. Dadurch können diese Unternehmen ihre Forschungs- und Entwicklungskosten drastisch senken und die Entwicklung ihrer Pipelines von Wochen auf Stunden beschleunigen.“
Weitere InformationenSeqera Labs
„Seqera Labs und AWS haben zusammengearbeitet, um sicherzustellen, dass AWS die Umgebung der Wahl für biowissenschaftliche Workloads ist.“ Nextflow und Nextflow Tower sind nahtlos in AWS Batch für elastisches Computing, EKS für eine nahtlose Bereitstellung und AWS Datei- und Objektspeicher-Services für kosteneffektive und performante Datenspeicher integriert.“
Weitere Informationen
Seven Bridges
„Die Seven-Bridges-Plattform und Seven-Bridges-Analysetools wie GRAF™ und ARIA™ stützen sich auf die Flexibilität und Skalierbarkeit von AWS, um es Forschern zu ermöglichen, riesige Bestände an genomischen und phänotypischen Daten zu nutzen, die das Potenzial haben, transformative Einblicke in die Grundlagen von Krankheiten, neue therapeutische Ansätze und In-silico-Krankheitsmodelle zu liefern.“
Weitere Informationen
Vorgestellte Beratungspartner
AWS Marketplace
Die DRAGEN-Bio-IT-Plattform von Illumina ermöglicht die ultraschnelle Analyse von Next Generation Sequencing (NGS)-Daten für große Datensätze, wie ganze Genome, Exome und Gene/Panele. Die Analyse umfasst das Mapping, die Ausrichtung, die Sortierung, die Duplikatmarkierung, das Small Variant Calling und mehr.
Sekundäranalyse
Da die Einführung der Genomik immer schneller voranschreitet, wird die Sekundäranalyse oft als Einschränkung angeführt. Um Analysen zu beschleunigen und mit der steigenden Nachfrage Schritt zu halten, nutzen Genomikorganisationen die Skalierbarkeit und Kosteneffizienz von AWS.
AWS-Lösungen
Vorgestellte Kunden
Illumina
Die DRAGEN Bio-IT-Plattform von Illumina liefert präzise, ultraschnelle Sekundäranalyseergebnisse. Kunden können ihre Analysen beschleunigen und drastisch beschleunigen, wenn DRAGEN auf Amazon EC2 F1-Instances ausgeführt wird. Video ansehen
Münchner Leukämielabor (MLL)
Mit AWS reduziert Munich Leukemia Lab die Bearbeitungszeit für die Verarbeitung von Patientengenomdaten von 20 Stunden auf 3 Stunden und trägt so dazu bei, die Forschung zu beschleunigen und die Diagnose von Leukämie zu verbessern. Die Fallstudie lesen
Ancestry
Ancestry verlässt sich auf Amazon EFS, um mehreren Wissenschaftlern die Durchführung von Genomforschungen zu ermöglichen, die Rechen- und Speicherkapazität nach oben oder unten zu skalieren und Wissenschaftler schneller einzubinden. Die Fallstudie lesen
Vorgestellte Partnerlösungen
Illumina
„Präzision und Schnelligkeit sind unerlässlich, um das menschliche Genom zu erschließen. Die DRAGEN Bio-IT-Plattform von Illumina liefert präzise, ultraschnelle Sekundäranalyseergebnisse. Kunden können ihre Analysen mit DRAGEN auf AWS durchführen und dramatisch beschleunigen.“ Weitere Informationen
NVIDIA
„NVIDIA Clara Parabricks Pipelines ist ein GPU-beschleunigtes Computing-Framework, das genomische Anwendungen unterstützt, die von DNS bis RNS reichen. Die Beschleunigung von Parabricks in Kombination mit der Skalierbarkeit von AWS ermöglicht es der Genomik-Branche, Projekte schneller und kosteneffizienter durchzuführen und den Wissenschaftlern, mehr genetische Varianten in ihren Daten zu identifizieren.“ Weitere Informationen
Seven Bridges
„Die Seven-Bridges-Plattform und Seven-Bridges-Analysetools wie GRAF™ und ARIA™ stützen sich auf die Flexibilität und Skalierbarkeit von AWS, um es Forschern zu ermöglichen, riesige Bestände an genomischen und phänotypischen Daten zu nutzen, die das Potenzial haben, transformative Einblicke in die Grundlagen von Krankheiten, neue therapeutische Ansätze und In-silico-Krankheitsmodelle zu liefern.“ Weitere Informationen
Lifebit
Vorgestellte Beratungspartner
BioTeam
AWS Marketplace
Vorgestellte Ressource
Optimierung der Berechnungskosten für Sekundäranalysen
Erfahren Sie, wie Sie die Rechenkosten für Sekundäranalysen mithilfe von Amazon Elastic Compute Cloud (EC2), Spot-Instances und AWS Batch optimieren können. Whitepaper lesen