Amazon Genomics CLI

Einfache und effiziente Verarbeitung von genomischen und biologischen Rohdaten in der Cloud, im Petabyte-Maßstab.

Richten Sie mit wenigen Befehlszeilen in wenigen Minuten Workflow-Engines wie Cromwell und Nextflow auf AWS ein, ohne bestehenden Code zu ändern oder Open-Source-Genomik-Tools zu modifizieren.

Automatisieren Sie zeitaufwändige Aufgaben wie das Konfigurieren und Bereitstellen von Workflow-Engines, das Erstellen von Datenzugriffsrichtlinien und das Optimieren von Rechenclustern für den Betrieb im großen Maßstab.

Führen Sie Genomik-Workflows in größerem Umfang und in kürzerer Zeit aus, wodurch Sie die Zeit verkürzen, um nützliche Erkenntnisse wie die Identifizierung von Varianten und die Diagnose von Krankheiten zu gewinnen.

Funktionsweise

Amazon Genomics CLI ist ein Open-Source-Tool für Genomik- und Biowissenschaften-Kunden, das die Bereitstellung von Cloud-Infrastrukturen vereinfacht und automatisiert und Ihnen eine benutzerfreundliche Befehlszeilenschnittstelle zum schnellen Einrichten und Ausführen von Genomik-Workflows auf Amazon Web Services (AWS) spezifiziert durch Sprachen wie WDL bietet. Softwareentwickler und Forscher können Cloud-Ressourcen automatisch bereitstellen, konfigurieren und skalieren, um schnellere und kosteneffizientere genetische Studien auf Populationsebene, Arzneimittelentwicklungszyklen und vieles mehr zu ermöglichen, da die Einrichtung und Ausführung von Genomik-Workflows in der Cloud nicht mehr so schwer ist.

Anwendungsfälle

Präzisionsmedizin

Ermöglichen Sie die Analyse von Genomsequenzierungsdaten und wenden Sie Erkenntnisse in einem klinischen Umfeld an, um die menschliche Gesundheit zu verbessern. Identifizieren Sie auf Bevölkerungsebene Gruppen, die anfällig für die Entwicklung eines bestimmten Gesundheitsproblems oder Träger während eines Krankheitserregerausbruchs sind.

Arzneimittelforschung und -entwicklung

Nutzen Sie die Humangenetik und das Wissen über Genfunktionen, um die Entwicklung vorbeugender Behandlungen und die Entdeckung neuartiger Arzneimittel zu ermöglichen.

Umgebungsgenomik

Verwenden Sie Genomsequenzierungsdaten, um die Biodiversität zu charakterisieren, Ökosystemveränderungen zu überwachen und Modellvorhersagen darüber zu machen, wie Organismen auf genetischer Ebene auf Veränderungen auf Umgebungsebene reagieren werden.

Erste Schritte

Erste Schritte mit Amazon Genomics CLI

Besuchen Sie GitHub, um Anweisungen zum Herunterladen und Installieren zu erhalten.

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