Fauna Bio verwendet AWS, um große Multi-Omic-Datensätze zu harmonisieren und für die menschliche Gesundheit relevante Gene aufzudecken

Forscher können Schwierigkeiten haben, große Multi-Omic-Datensätze zu harmonisieren, um spezifische Gene zu identifizieren, die für die Entwicklung gezielter Behandlungen für menschliche Krankheiten wichtig sind.

Tiere, die Winterschlaf halten, bekämpfen effektiv extreme physiologische Veränderungen, die menschliche Krankheiten widerspiegeln. Beispielsweise können sie jedes Jahr das Äquivalent von 25 Herzinfarkten erleiden, sind aber in der Lage, ihr Gewebe zu schützen und zu reparieren. Fauna Bio zielt darauf ab, Gene zu entdecken, die für die menschliche Gesundheit relevant sind, indem Gene identifiziert werden, die für die Bekämpfung von Krankheiten bei Tieren verantwortlich sind. Zu diesem Zweck überlappt Fauna Bio transkriptomische, epigenomische und evolutionäre Ratenanalysen, um Gene aufzudecken, die wirksame therapeutische Arzneimittelziele beim Menschen wären.

Fauna Bio hat eine riesige Datenbank aufgebaut, um die Daten dieser Analysen zu speichern und zu verarbeiten. Wir freuen uns, diese Analysen durchzuführen und unsere Daten in der AWS Cloud zu speichern, da uns dies einen effizienten Zugriff auf unsere vielen Terabyte an Daten von mehreren Standorten aus ermöglicht.“, sagt Linda Goodman, Chief Technology Officer bei Fauna Bio. Um diesen riesigen Datensatz seinen eigenen Forschern und Mitarbeitern zugänglich zu machen, hat Fauna Bio eine Plattform geschaffen, die auf Amazon Web Services (AWS) gehostet wird und es Benutzern ermöglicht, zwischen vergleichenden Genomik-, Transkriptomik- und Epigenomikdaten zu wählen; die betroffenen Gewebe von Interesse auszuwählen; die Art der potenziell zu entwickelnden Therapie zu benennen; und dann eine visuelle Karte der resultierenden Gennetzwerke zu sehen, die analysiert und möglicherweise für weitere Tests und Entwicklungen weitergegeben werden können.