Amazon Genomics CLI

Procese de manera fácil y eficiente los datos sin procesar genómicos y biológicos en la nube a escala de petabytes.

Con unas pocas líneas de comandos, puede configurar motores de flujo de trabajo como Cromwell y Nextflow en AWS en cuestión de minutos sin cambiar el código existente ni modificar las herramientas de genómica de código abierto.

Automatice las tareas demandantes, como la configuración y la implementación de motores de flujo de trabajo, la creación de políticas de acceso a los datos y el ajuste de clústeres de computación para que funcionen a escala.

Ejecute flujos de trabajo de datos de genómica a mayor escala y en menos tiempo, lo que reducirá el tiempo para adquirir información útil, como la identificación de variantes y el diagnóstico de enfermedades.

El código del proyecto de la CLI de genómica de Amazon ya no se mantiene de forma activa y el repositorio de GitHub se archivará a partir del 31 de mayo de 2024. Si busca un servicio para ejecutar los flujos de trabajo de genómica, le recomendamos que explore AWS HealthOmics o que se ponga en contacto con el equipo de cuentas de AWS para obtener soluciones alternativas.

Funcionamiento

Amazon Genomics CLI es una herramienta de código abierto para los clientes de genómica y ciencias biológicas que simplifica y automatiza la implementación de infraestructura en la nube, lo que le brinda una interfaz de línea de comandos fácil de usar para configurar y ejecutar rápidamente flujos de trabajo de genómica en Amazon Web Services (AWS), especificados por lenguajes como WDL. Al eliminar el trabajo pesado de configurar y ejecutar flujos de trabajo de genómica en la nube, los desarrolladores de software y los investigadores pueden aprovisionar, configurar y escalar automáticamente los recursos de la nube para permitir, entre otros, estudios genéticos a nivel de población y ciclos de descubrimiento de fármacos más rápidos y más rentables.

Casos de uso

Medicina de precisión

Se habilita el análisis de datos de la secuenciación genómica y se utilizan los hallazgos en un entorno clínico para mejorar la salud de las personas. A nivel de la población, se identifican los grupos que son susceptibles a desarrollar un determinado problema de salud o a ser portadores durante un brote de patógenos.

Descubrimiento y desarrollo de fármacos

Se aprovecha la genética humana y el conocimiento de las funciones de los genes para permitir el desarrollo de tratamientos preventivos y el descubrimiento de fármacos nuevos.

Genómica ambiental

Se utilizan los datos de la secuenciación genómica para describir la biodiversidad, supervisar los cambios en los ecosistemas y modelar las predicciones sobre cómo responderán los organismos a nivel genético a los cambios a nivel ambiental.

Cómo comenzar

Introducción a Amazon Genomics CLI

Visite GitHub para descargar e instalar las instrucciones.

Comience »

Contacte con un experto

Desde el desarrollo hasta los programas de nivel empresarial, obtenga el soporte adecuado en el momento oportuno.

Explore opciones de soporte »