AWS HealthOmics が Nextflow ワークフロー向けの自動入力パラメータ補間機能を発表

投稿日: 2025年6月27日

本日、AWS HealthOmics は Nextflow プライベートワークフロー向けの入力パラメータの自動補間機能を発表しました。これにより、手動でパラメータテンプレートを作成する必要がなくなります。この機能強化により、ワークフロー定義から必須とオプションの両方の入力パラメータとその説明を、インテリジェントに識別して抽出できます。 AWS HealthOmics は、フルマネージドの生物学的データストアとワークフローを使用して、ヘルスケアやライフサイエンスのお客様が科学的ブレークスルーを加速できるよう支援する、HIPAA 適格サービスです。

この新機能により、お客様は各ワークフローパラメータを手動で識別、定義、検証する必要がなくなるため、バイオインフォマティクスワークフローをより迅速に起動できます。これは、パラメータを誤って指定したり省略したりした場合に発生する可能性のある設定エラーを減らすのにも役立ちます。特殊な要件がある場合、お客様はカスタムパラメータテンプレートを用意して、自動生成された設定をオーバーライドすることもできます。

Nextflow ワークフローの入力パラメータ補間機能は、AWS HealthOmics が利用可能なすべてのリージョン (米国東部 (バージニア北部)、米国西部 (オレゴン)、欧州 (フランクフルト、アイルランド、ロンドン)、アジアパシフィック (シンガポール)、イスラエル (テルアビブ)) でサポートされています。自動パラメータ補間機能は、WDL および CWL ワークフローで現在既にサポートされています。

自動パラメータ補間機能とプライベートワークフローの構築方法について詳しくは、AWS HealthOmics のドキュメントを参照してください。