AWS HealthOmics で実行時の Nextflow バージョンの固定がサポートされるようになりました

投稿日: 2026年6月1日

AWS HealthOmics で、StartRun API を使用して Nextflow エンジンのバージョンを実行時に指定できるようになりました。これにより、お客様は実行を特定の Nextflow バージョンに固定し、移行を制御できるようになりました。本リリースにより、お客様は新しいエンジン設定パラメータを用いてサポート対象の Nextflow バージョン (22.04、23.10、24.10、25.10、26.04) から選択できるようになり、実行時の明示的な制御が可能になります。AWS HealthOmics は、フルマネージドのバイオインフォマティクスワークフローを大規模に使用して、ヘルスケアやライフサイエンスのお客様が科学的ブレークスルーを加速できるよう支援する、HIPAA 適格サービスです。

Nextflow バージョンの固定により、新しいエンジンバージョンをいつ、どのように適用するかをお客様が包括的に制御できます。ワークフロー定義の構成またはプロファイルで manifest.nextflowVersion を用いてバージョンが指定されている場合でも、実行時のバージョンのオーバーライドによって StartRun API パラメータが優先されます。そのため、ユーザーはワークフローのソースコードを変更することなく、同一のワークフローを複数のエンジンバージョンでテストできます。開発チームが新しいバージョンを並行してテストしている間、本番ワークフローは検証済みのエンジンバージョンにとどめることができるため、予期せず挙動が変化するリスクを低減できます。これは、新しいエンジンバージョンへのアップグレードに先立ってパイプラインの検証を行う必要のある規制環境で役立ちます。

Nextflow バージョンの実行時の固定は、AWS HealthOmics が提供されているすべてのリージョン (米国東部 (バージニア北部)、米国西部 (オレゴン)、欧州 (フランクフルト、アイルランド、ロンドン)、イスラエル (テルアビブ)、アジアパシフィック (シンガポール、ソウル)) における Nextflow ワークフローの実行でご利用いただけます。詳細については、Nextflow エンジンの設定のドキュメントをご覧ください。