AWS HealthOmics 现已支持 Nextflow 配置文件

发布于: 2026年6月22日

AWS HealthOmics 现在支持 Nextflow 配置文件,使客户能够在运行时激活预定义的执行设置。借助 Nextflow 配置文件,客户可以定义可重复使用的设置并在执行时进行选择,无需修改工作流源代码即可轻松地在执行设置之间切换。AWS HealthOmics 是一项符合 HIPAA 标准的服务,能够通过完全托管式生物信息学工作流,帮助医疗保健与生命科学客户大规模加速取得科学突破。

使用 Nextflow 配置文件,您可以将平台特定的设置(例如资源限制或执行选项)与核心工作流逻辑完全分离开来。您可以在开发和生产设置之间切换,而无需创建单独的工作流定义。这不仅能够减少手动编辑产生的错误、加快工作流的可移植性,还能节省从开发到生产的时间。如果您使用 nf-core 工作流,则现在可以激活这些管道已附带的内置配置文件和机构配置文件。

现在,您可以在以下所有 AWS HealthOmics 区域的工作流运行中指定一个或多个 Nextflow 配置文件:美国东部(弗吉尼亚州北部)、美国西部(俄勒冈州)、欧洲地区(法兰克福、爱尔兰、伦敦)、以色列(特拉维夫)和亚太地区(新加坡、首尔)。要了解更多信息,请访问 HealthOmics Nextflow 引擎设置文档中的 Nextflow 配置文件部分。