Pudimos usar las instancias F1 basadas en FPGA para agilizar en gran medida el proceso de secuenciación de genoma integral. El resultado: el proceso que solía demorar 20 horas de tiempo de computación, ahora se completa en tan solo 3 horas.
Professor Dr. Torsten Haferlach Chief Executive Officer, Munich Leukemia Lab

El laboratorio de leucemia de Múnich (MLL) es una institución de diagnóstico e investigación cuya misión es encontrar una cura para la leucemia y el linfoma. MLL utiliza métodos moleculares de vanguardia y asistidos por la TI para dar forma al futuro del diagnóstico y la terapia hematológicos. Gracias al uso de AWS, MLL redujo el tiempo de respuesta para procesar los datos del genoma del paciente de 20 a 3 horas, lo que ayudó a acelerar la investigación y mejorar el diagnóstico de la leucemia.

El uso de la secuenciación de próxima generación (NGS) de alto rendimiento por parte de MLL provocó un gran aumento de las necesidades de computación y almacenamiento de la organización, que superaron la capacidad de la infraestructura local de MLL. Para lidiar con esta creciente necesidad de computación y almacenamiento escalables, mientras se mantiene un alto estándar para la seguridad de los datos, MLL acudió a Amazon Web Services (AWS) e implementó una solución BaseSpace de Illumina en la región de Fráncfort de AWS. MLL utiliza instancias F1 basadas en FPGA de Amazon Elastic Compute Cloud (Amazon EC2) para acelerar el procesamiento de datos genómicos y Amazon Simple Storage Service (Amazon S3) para un almacenamiento rentable de los datos. Desde 2018, se han creado más de 2,4 petabytes de datos a partir del análisis de MLL de más de 4200 genomas de pacientes. MLL ahora busca agregar paralelización, automatización y machine learning para acelerar el análisis genómico y mejorar la precisión del diagnóstico.

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