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AWS 上の Cromwell

ゲノミクス研究を加速するための Broad Institute とのコラボレーション

概要

Cromwell は Broad Institute のワークフロー管理システムです。同組織は、バイオインフォマティクスを専門とする研究機関であり、マサチューセッツ州ケンブリッジに拠点を置いています。Cromwell は、ゲノム解析のための科学的ワークフローを実行するためのシステムです。Cromwell は、ゲノム研究者、科学者、デベロッパー、および分析担当者が、バックエンドコンピューティング機能に関する深い専門知識がなくても、実験を効率的に行うことを可能にしています。

Cromwell は AWS クラウドでサポートされるようになりました。Cromwell は、ゲノミクス分析に必要なコンピューティングタスクのオーケストレーションを簡素化するワークフロー実行エンジンです。AWS Batch は、アマゾンウェブサービスの完全マネージド型バッチコンピューティングサービスで、送信されたバッチジョブの量と特定のリソース要件に基づいて、最適な量と種類のコンピューティングリソース (CPU やメモリ最適化インスタンスなど) を動的にプロビジョニングします。

AWS 上の Cromwell を利用することにより、研究者と科学者は、限られたオンプレミスリソースを取り合うのではなく、クラウド内でコンピューティング機能を利用したゲノミクス実験のスケーリングにおいて、より高い柔軟性を得ることができるようになります。

今すぐ視聴:

オンラインセミナー:アマゾンウェブサービス (AWS) での Cromwell の運用入門

ウェビナーを視聴して、AWS で Cromwell を利用する科学的なワークフローを開発および実行するためのツール、テクニック、ベストプラクティスについて学びましょう。このウェビナーでは、フルマネージドバッチコンピューティングサービスである AWS Batch に対して Cromwell を設定する方法について説明します。

デモを見る: AWS での Cromwell の実行

2 つの例をご紹介する簡単な動画。AWS 上で Cromwell の機能をデモンストレーションします。AWS Batch を利用するように Cromwell を設定し、簡単なワークフローをエンコードします。

リソース

ゲノミクスの未来のための分析の加速:

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