AWS 上の Cromwell

Cromwell は Broad Institute のワークフロー管理システムです。同組織は、バイオインフォマティクスを専門とする研究機関であり、マサチューセッツ州ケンブリッジに拠点を置いています。Cromwell は、ゲノム解析のための科学的ワークフローを実行するためのシステムです。Cromwell は、ゲノム研究者、科学者、デベロッパー、および分析担当者が、バックエンドコンピューティング機能に関する深い専門知識がなくても、実験を効率的に行うことを可能にしています。

Cromwell は AWS クラウドでサポートされるようになりました。Cromwell は、ゲノミクス分析に必要なコンピューティングタスクのオーケストレーションを簡素化するワークフロー実行エンジンです。Amazon Web Services のフルマネージドバッチコンピューティングサービスである AWS Batch では、コンピューティングリソース (CPU やメモリ最適化インスタンスなど) の最適な数量とタイプを、送信された一連のバッチジョブの量と具体的なリソース要件に基づいて動的にプロビジョニングします。

AWS 上の Cromwell を利用することにより、研究者と科学者は、限られたオンプレミスリソースを取り合うのではなく、クラウド内でコンピューティング機能を利用したゲノミクス実験のスケーリングにおいて、より高い柔軟性を得ることができるようになります。