AWS HealthOmics 리소스

이 단계별 개발자 안내서에서는 AWS HealthOmics를 사용하는 방법을 알아봅니다.

이 참조 가이드에서는 AWS HealthOmics API 및 파라미터에 대해 알아봅니다.

HealthOmics 워크플로 및 스토리지 시작하기

AWS HealthOmics를 사용하여 유전체 및 생물학적 데이터세트를 저장, 처리 및 쿼리하는 방법을 보여주는 예제 코드가 포함된 GitHub의 오픈 소스 리포지토리입니다.

이 AWS HealthOmics 워크플로 모음을 사용하여 신약 개발 가속화

오픈 소스 HealthOmics 워크플로 예제를 기반으로 비공개 워크플로 구축

Run Analyzer는 CloudWatch에서 실행 매니페스트 로그를 검색하고 각 워크플로 작업의 CPU 및 메모리 사용률을 포함하여 실행에 대한 통계를 생성하는 실행 성능 최적화 도구입니다.

HealthOmics 의 WDL Linter를 사용하여 워크플로를 실행하기 전에 일반적인 워크플로 오류를 감지할 수 있습니다.

워크플로 스크립트가 실행되기 전의 일반적인 Nextflow 오류에 대한 Lint

ECR 도우미 도구를 사용하여 기존 컨테이너를 프라이빗 ECR 리포지토리로 마이그레이션

CloudWatch 실행 매니페스트 로그에서 아카이브된 실행을 재실행

AWS HealthOmics 의 참조 또는 읽기 세트에서 파일을 쉽게 다운로드

Amazon S3에서 객체를 생성할 때 AWS HealthOmics 시퀀스 스토어로 데이터를 자동으로 가져오는 이벤트 기반 아키텍처를 보여주는 CDK 앱입니다.

AWS HealthOmics 의 시퀀스 스토어 가져오기 작업을 위한 json 매니페스트 생성

AWS HelathOmics 시퀀스 스토어에 저장된 중복 읽기 세트 식별

이 지침은 실험실 기기 데이터와 전자 실험실 노트북(ELN) 및 실험실 정보 관리 시스템(LIMS)과 같은 소프트웨어 시스템을 HealthOmics와 통합하는 과학 데이터 관리 시스템을 구축하는 방법을 보여줍니다.

이 지침은 인터넷을 통해 또는 지연 시간이 짧은 직접 연결을 통해 생명 과학 데이터 기기 및 실험실 시스템 파일을 AWS 클라우드에 연결할 수 있도록 도와줍니다.

이 지침은 Amazon Simple Storage Service(S3)에서 AWS HealthOmics 스토리지로 오믹스 시퀀스 데이터를 가져오는 방법을 보여줍니다.

이 지침은 복합 의료 및 생명 과학(HCLS) 데이터를 분석하기 위한 종합적인 프레임워크를 설정하는 방법을 보여줍니다.

이 지침은 프로덕션 수준의 생물정보학 워크플로를 대규모로 구축 및 실행하고 AWS 서비스를 사용하여 자동화, 워크플로 분석, 스토리지, 운영 및 비용 관찰성을 수행하는 방법을 보여줍니다.

이 지침은 복합 의료 및 생명 과학(HCLS) 데이터를 분석하기 위한 종합적인 프레임워크를 설정하는 방법을 보여줍니다.