Genômica na nuvem

Simplifique e escale com segurança suas análises genômicas com a AWS.

A AWS oferece a você uma escalabilidade inerente e um ecossistema de parceiros e ferramentas que estão preparados para lidar com dados e cargas de trabalho confidenciais. Os clientes da AWS podem acelerar insights sobre genômica e criar uma ponte entre a infraestrutura local atual e a nuvem.

Com a AWS, você pode armazenar e avaliar seus dados, colaborar com colegas, incorporar análises e Machine Learning, e integrar descobertas à prática clínica, tudo isso de forma eficiente e dinâmica.   

Assista a líderes globais em genômica discutindo os benefícios da nuvem

Benefícios

Acelere o ritmo das descobertas científicas

A AWS permite que clientes do setor de genômica obtenham insights práticos a partir de dados grandes e complexos. Não é necessário fazer grandes investimentos antecipados de tempo e dinheiro para criar e manter a infraestrutura. A AWS oferece acesso flexível e econômico a tantos recursos quantos forem necessários, quase instantaneamente, e você só paga pelo que usar.

Garanta a escalabilidade e ofereça recursos dinâmicos

A execução de pipelines de análise genômica na AWS significa que você pode aumentar eficientemente a escala para acompanhar a demanda e voltar à escala original com o fim da demanda. A AWS também oferece métodos alternativos de definição de preço e computação para complementar os testes de genômica.

Personalize e otimize seus fluxos de trabalho

Da criação do pipeline de genômica à integração das descobertas genômicas em padrões de tratamento de diagnóstico, a AWS tem um amplo ecossistema de parceiros disponíveis para trabalhar com você para otimizar e personalizar seus fluxos de trabalho. Esse ecossistema oferece diversas opções flexíveis, permitindo incorporar diversas escolhas às suas soluções.  

Cromwell na AWS

Cromwell, um sistema de gerenciamento de fluxo de trabalho do Broad Institute, agora conta com o suporte da Nuvem AWS. Com o Cromwell na AWS, os pesquisadores e cientistas agora terão ainda mais flexibilidade para escalar experimentos de genômica usando recursos de computação na nuvem, em vez de disputar os recursos limitados no local.

Casos de uso de genômica

  • Contêineres
  • Gerenciamento de fluxo de trabalho
  • Análise de big data
  • Conjuntos de dados
  • Colaboração
  • Contêineres
  • Contêineres para pipeline genômico

    Para que seja mais fácil distribuir e executar seu pipeline genômico, você pode encapsular seus processos e executar os contêineres na Nuvem AWS. Configure sua própria arquitetura de fluxo de trabalho “plug-and-play” e crie um ambiente específico para suas necessidades de fluxo de trabalho e pesquisa. Usando o Amazon EC2 Container Service (ECS) ou executando o Docker na AWS, você pode resolver seu problema genômico geral em pequenas partes, tornando os dados reproduzíveis e facilitando seu compartilhamento.

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    Vídeo de arquitetura

    Saiba mais sobre os pipelines de aplicativos poderosos e reutilizáveis criados na AWS pela Human Longevity, Inc. neste vídeo de arquitetura. Veja como eles processam diariamente até 12 TB de dados brutos por dia no Amazon S3 usando ferramentas de análise personalizadas executadas em contêineres do Docker.

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    Diagrama de arquitetura

    Explore o diagrama de arquitetura detalhado da Human Longevity, Inc. para usar o Docker na AWS para análise genômica.

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    Estudo de caso de cliente

    Neste estudo de caso, saiba como a Benchling reduziu seu tempo de pesquisa em 90% e escalou centenas de genomas usando o AWS Lambda. 

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  • Gerenciamento de fluxo de trabalho
  • Gerenciamento de fluxo de trabalho

    Para ajudar a aumentar a eficiência do gerenciamento de um pipeline de genômica, você pode criar regras de gerenciamento de fluxo de trabalho na Nuvem AWS. Componha e execute uma série de etapas de manipulação de dados ou computacionais e otimize o paralelismo das tarefas para acelerar seu tempo de conclusão.

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    Estudo de caso de cliente

    Neste estudo de caso, veja como a Baylor College of Medicine trabalhou com a DNAnexus para mover seus pipelines de análise genômica para a Nuvem AWS. Veja como eles capacitaram grandes estudos genômicos clínicos que exigiam um ambiente seguro e em conformidade.

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    Estudo de caso de cliente

    Neste estudo de caso, a DNAnexus criou uma plataforma de análise genômica na AWS. Veja como a combinação de infraestrutura da AWS e controles da DNAnexus e conformidade certificada possibilitou o cumprimento de requisitos exigentes, como HIPAA, CAP/CLIA, GxP e outras leis e regulamentos.

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  • Análise de big data
  • Análise de big data para genômica

    As organizações de genômica enfrentam um tsunami de dados, gerado pelos seus pipelines de genômica. Para que esses dados sejam mais úteis, você pode implantar componentes da AWS para apoiar todo o pipeline analítico, do consumo e análise de dados à visualização, armazenamento, armazéns de dados e arquivamento. Obtenha flexibilidade para escolher dentre uma ampla variedade de serviços de bancos de dados que se adaptam às suas necessidades e tenha os melhores resultados.

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    Vídeo de arquitetura

    Neste vídeo de arquitetura, veja como a UC Santa Cruz analisa petabytes de dados genômicos usando uma solução de baixo custo com contêineres do Docker e instâncias spot do EC2.

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    Estudo de caso de cliente

    Neste estudo de caso, veja como o laboratório Guttman no Instituto de Tecnologia da Califórnia usa clusteres de High Performance Computing (HPC - Computação de alta performance) na AWS para reduzir o tempo de computação de genômica de semanas para dias.

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    Estudo de caso de cliente

    Neste estudo de caso, veja como a GENALICE conseguiu processar genomas completos de 800 pacientes em 60 minutos usando os serviços de computação de alta performance da AWS.

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  • Conjuntos de dados
  • Como trabalhar com bancos de dados públicos e privados

    A AWS possibilita que você acesse seus próprios bancos de dados privados ou repositórios controlados, como o NIH Database of Genotypes and Phenotypes (dbGaP – Banco de dados de genótipos e fenótipos do NIH) ou o Cancer Genome Atlas (TCGA - Atlas do genoma do câncer), entre outros. Use seu conjunto de ferramentas preferido (como GATK ou Galaxy) para analisar os dados. A AWS tem todas as ferramentas necessárias para cumprir requisitos de segurança e conformidade para trabalhar com esses bancos de dados confidenciais, incluindo recursos incorporados para criptografar dados ociosos ou em trânsito.

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    Estudo de caso de cliente

    Neste estudo de caso, veja como The Icahn School of Medicine do Monte Sinai analisa e compartilha conjuntos de dados genômicos enormes com colaboradores externos e ainda mantém controles de privacidade e segurança rigorosos na AWS.

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    Whitepaper

    Architecting for Genomic Data Security and Compliance in AWS

    Veja como trabalhar com conjuntos de dados de acesso controlado do dbGaP, GWAS e outros repositórios de pesquisa genômica em nível individual.

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    Estudo de caso de cliente

    Neste estudo de caso, veja como a Illumina escala extensivamente suas tecnologias de sequenciamento de DNA usando a AWS. Veja como eles oferecem suporte ao modelo Illumina BaseSpace Sequence Hub e armazenam 10 PB de dados de genômica usando produtos como Amazon RedShift.

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  • Colaboração
  • Promovendo a colaboração

    Compartilhe seus dados com os colaboradores, estejam eles no mesmo corredor ou do outro lado do planeta. A AWS pode oferecer um espaço de trabalho centralizado e compartilhado para que você e seus colegas criem conjuntos de dados, escrevam algoritmos ou criem ferramentas, sem a necessidade de mover fisicamente os dados e sem preocupações com infrações de propriedade intelectual.

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    Estudo de caso de cliente

    Neste estudo de caso, veja como a ThermoFisher oferece aos clientes uma plataforma escalável e segura para realizar pesquisas, colaborar e aprimorar tratamentos médicos para pacientes usando a Nuvem AWS globalmente.

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    Estudo de caso de cliente

    Neste estudo de caso, veja como a Celgene possibilita a colaboração entre seus próprios pesquisadores e laboratórios de pesquisa acadêmica usando a AWS, além de possibilitar o trabalho em equipe proporcionando acesso isolado para pesquisadores de diferentes organizações.

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    Estudo de caso de cliente

    Neste estudo de caso, veja como o Instituto de Genômica da UC Santa Cruz conseguiu processar amostras com mais rapidez e transmitir os resultados com segurança para os colaboradores usando a AWS.

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Fortalecendo a medicina de precisão na AWS

A medicina adaptada aos indivíduos de acordo com assinaturas quantitativas, incluindo genômica, estilo de vida ou meio ambiente, agora está se tornando possível por meio de novas tecnologias como sequenciamento genômico e dispositivos wearable de IoT. Veja como as iniciativas de medicina de precisão já estão acontecendo na AWS.

Selecione estudos de caso e recursos

Veja todos os estudos de caso de clientes de genômica e recursos relacionados

 

Estudo de caso da Illumina

Neste estudo de caso, veja como a Illumina escala extensivamente suas tecnologias de sequenciamento de DNA usando a AWS. Veja como eles oferecem suporte ao modelo Illumina BaseSpace Sequence Hub e armazenam 10 PB de dados de genômica usando produtos como Amazon RedShift.

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Estudo de caso da Sequence Bio

Neste estudo de caso, veja como a Sequence Bio criou rapidamente uma plataforma segura e protegida para descoberta de medicamentos orientada a dados na AWS.

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Estudo de caso Smithsoniano

Neste estudo de caso, veja como a equipe de ciências de dados do Instituto Smithsoniano amplia e reduz instâncias de computação da AWS conforme a necessidade, possibilitando a anotação de genomas e o gerenciamento de custos simultaneamente.

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Estudo de caso da UC Santa Cruz

Neste estudo de caso, veja como o Instituto de Genômica da UC Santa Cruz conseguiu reduzir o tempo do cálculo de genômica de três meses para quatro dias usando serviços de cálculo de alta performance da AWS, além de reduzir os custos gerais.

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Blog: conduzindo o momentum na pesquisa genômica

Blog da AWS Education: AWS colabora com o Broad Institute

Veja como o Cromwell, um mecanismo de execução que simplifica a orquestração de tarefas de computação necessárias para análise genômica, agora opera na Nuvem AWS.

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Blog: implante o Illumina DRAGEN com o novo Quick Start

O que há de novo na AWS: novo Quick Start para implantar o Illumina DRAGEN na Nuvem AWS.

Veja como este Quick Start implanta a plataforma de análise de dados da Illumina, o Dynamic Read Analysis for GENomics Complete Suite (DRAGEN CS), na Nuvem AWS em cerca de 15 minutos.

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Blog: medicina de precisão em grande escala

Blog de computação da AWS: acelerando a medicina de precisão em grande escala

Saiba como a Edico Genome desenvolveu uma nova solução para acelerar a análise genômica usando aplicativos habilitados para FPGA na AWS.

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Blog: Human Longevity, Inc.

Blog de notícias da AWS: mudando a medicina por meio da pesquisa genômica.

Veja como a Human Longevity, Inc. está usando a AWS para armazenar a quantidade enorme de dados gerados como parte de um esforço para revolucionar a medicina.

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Conceitos básicos

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