Genômica na nuvem

Acelere as descobertas genômicas

Com a AWS, os clientes da genômica podem dedicar mais tempo e recursos à ciência, acelerando o tempo para insights, alcançando pesquisas inovadoras com mais rapidez e trazendo produtos que salvam vidas ao mercado.

A AWS permite que os clientes inovem tornando os dados genômicos mais acessíveis e úteis. A AWS oferece a amplitude e a profundidade dos serviços para reduzir o tempo entre o sequenciamento e a interpretação, com recursos de colaboração seguros e sem atrito em conjuntos de dados multimodais. Além disso, você pode escolher a ferramenta certa para o trabalho, a fim de obter o melhor custo e desempenho em escala global, acelerando o estudo moderno da genômica.

Acelere as descobertas genômicas na AWS (1:06)

Benefícios

Acelere o tempo de descoberta

Opções poderosas de computação e machine learning garantem que os cientistas possam executar cargas de trabalho com rapidez e controle. A AWS oferece a mais ampla seleção de serviços de computação, mais do que qualquer outro provedor de nuvem. Apenas a AWS oferece instâncias de computação que fornecem 100 Gbps de taxa de transferência de rede.

Mantenha os custos baixos e o desempenho alto

A definição de preço flexível e a natureza sob demanda da computação em nuvem permitem que os pesquisadores lidem com projetos genômicos complexos, sem ter que pagar por infraestrutura ociosa ou se esforçar para aumentar os núcleos durante cargas de trabalho intensas. A AWS oferece definição de preço pré-pago e capacidade de computação virtualmente ilimitada.

Colaboração segura em escala global

A área de cobertura global das regiões da AWS e da rede corresponde à natureza global da ciência, com segurança e controles de acesso que permitem aos pesquisadores de genômica gerenciar o compartilhamento de dados. A AWS é a infraestrutura de nuvem global mais segura, extensa e confiável. O programa de dados abertos da AWS está disponível publicamente, com mais de 40 conjuntos de dados abertos de ciências biológicas e genômica para permitir uma colaboração sem atrito, fornecendo às comunidades clínicas e de pesquisa uma única fonte documentada da verdade.

100 Gbps

da taxa de transferência da rede

2x

mais zonas de disponibilidade do que qualquer outro provedor de nuvem

24

Regiões lançadas, para dar suporte a soberania dos dados

90%

de economia potencial em comparação com os preços sob demanda

100x

aceleração com instâncias Amazon EC2 F1 em comparação com CPUs

Mais de 200

serviços em destaque de data centers em todo o mundo

Parceiros da AWS de genômica

A AWS oferece a maior rede de parceiros, junto com escolha flexível de fluxo de trabalho e opções para soluções totalmente gerenciadas para ajudá-lo a obter insights genômicos mais rapidamente.

Saiba mais sobre o Parceiros da AWS para genômica »

Casos de uso de genômica

  • Contêineres
  • Gerenciamento de fluxo de trabalho
  • Análise de big data
  • Conjuntos de dados
  • Colaboração
  • Contêineres
  • Contêineres para pipeline genômico

    Para que seja mais fácil distribuir e executar seu pipeline genômico, você pode encapsular seus processos e executar os contêineres na Nuvem AWS. Configure sua própria arquitetura de fluxo de trabalho “plug-and-play” e crie um ambiente específico para suas necessidades de fluxo de trabalho e pesquisa. Usando o Amazon EC2 Container Service (ECS) ou executando o Docker na AWS, você pode resolver seu problema genômico geral em pequenas partes, tornando os dados reproduzíveis e facilitando seu compartilhamento.

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    Vídeo de arquitetura

    Saiba mais sobre os pipelines de aplicativos poderosos e reutilizáveis criados na AWS pela Human Longevity, Inc. neste vídeo de arquitetura. Veja como eles processam diariamente até 12 TB de dados brutos por dia no Amazon S3 usando ferramentas de análise personalizadas executadas em contêineres do Docker.

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    Diagrama de arquitetura

    Explore o diagrama de arquitetura detalhado da Human Longevity, Inc. para usar o Docker na AWS para análise genômica

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    Estudo de caso de cliente

    Neste estudo de caso, saiba como a Benchling reduziu seu tempo de pesquisa em 90% e escalou centenas de genomas usando o AWS Lambda. 

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  • Gerenciamento de fluxo de trabalho
  • Gerenciamento de fluxo de trabalho

    Para ajudar a aumentar a eficiência do gerenciamento de um pipeline de genômica, você pode criar regras de gerenciamento de fluxo de trabalho na Nuvem AWS. Componha e execute uma série de etapas de manipulação de dados ou computacionais e otimize o paralelismo das tarefas para acelerar seu tempo de conclusão.

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    Estudo de caso de cliente

    Neste estudo de caso, veja como a Baylor College of Medicine trabalhou com a DNAnexus para mover seus pipelines de análise genômica para a Nuvem AWS. Veja como eles capacitaram grandes estudos genômicos clínicos que exigiam um ambiente seguro e em conformidade

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    Estudo de caso de cliente

    Neste estudo de caso, a DNAnexus criou uma plataforma de análise genômica na AWS. Veja como a combinação de infraestrutura da AWS e controles da DNAnexus e conformidade certificada possibilitou o cumprimento de requisitos exigentes, como HIPAA, CAP/CLIA, GxP e outras leis e regulamentos.

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  • Análise de big data
  • Análise de big data para genômica

    As organizações de genômica enfrentam um tsunami de dados, gerado pelos seus pipelines de genômica. Para que esses dados sejam mais úteis, você pode implantar componentes da AWS para apoiar todo o pipeline analítico, do consumo e análise de dados à visualização, armazenamento, armazéns de dados e arquivamento. Obtenha flexibilidade para escolher dentre uma ampla variedade de serviços de bancos de dados que se adaptam às suas necessidades e tenha os melhores resultados.

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    Vídeo de arquitetura

    Neste vídeo de arquitetura, veja como a UC Santa Cruz analisa petabytes de dados genômicos usando uma solução de baixo custo com contêineres do Docker e instâncias spot do EC2.

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    Estudo de caso de cliente

    Neste estudo de caso, veja como o laboratório Guttman no Instituto de Tecnologia da Califórnia usa clusteres de High Performance Computing (HPC - Computação de alta performance) na AWS para reduzir o tempo de computação de genômica de semanas para dias.

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    Estudo de caso de cliente

    Neste estudo de caso, veja como a GENALICE conseguiu processar genomas completos de 800 pacientes em 60 minutos usando os serviços de computação de alta performance da AWS.

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  • Conjuntos de dados
  • Como trabalhar com bancos de dados públicos e privados

    A AWS possibilita que você acesse seus próprios bancos de dados privados ou repositórios controlados, como o NIH Database of Genotypes and Phenotypes (dbGaP – Banco de dados de genótipos e fenótipos do NIH) ou o Cancer Genome Atlas (TCGA - Atlas do genoma do câncer), entre outros. Use seu conjunto de ferramentas preferido (como GATK ou Galaxy) para analisar os dados. A AWS tem todas as ferramentas necessárias para cumprir requisitos de segurança e conformidade para trabalhar com esses bancos de dados confidenciais, incluindo recursos incorporados para criptografar dados ociosos ou em trânsito.

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    Estudo de caso de cliente

    Neste estudo de caso, veja como The Icahn School of Medicine do Monte Sinai analisa e compartilha conjuntos de dados genômicos enormes com colaboradores externos e ainda mantém controles de privacidade e segurança rigorosos na AWS.

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    Whitepaper

    Architecting for Genomic Data Security and Compliance in AWS

    Veja como trabalhar com conjuntos de dados de acesso controlado do dbGaP, GWAS e outros repositórios de pesquisa genômica em nível individual

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    Estudo de caso de cliente

    Neste estudo de caso, veja como a Illumina escala extensivamente suas tecnologias de sequenciamento de DNA usando a AWS. Veja como eles oferecem suporte ao modelo Illumina BaseSpace Sequence Hub e armazenam 10 PB de dados de genômica usando produtos como Amazon RedShift.

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  • Colaboração
  • Promovendo a colaboração

    Compartilhe seus dados com os colaboradores, estejam eles no mesmo corredor ou do outro lado do planeta. A AWS pode oferecer um espaço de trabalho centralizado e compartilhado para que você e seus colegas criem conjuntos de dados, escrevam algoritmos ou criem ferramentas, sem a necessidade de mover fisicamente os dados e sem preocupações com infrações de propriedade intelectual.

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    Estudo de caso de cliente

    Neste estudo de caso, veja como a ThermoFisher oferece aos clientes uma plataforma escalável e segura para realizar pesquisas, colaborar e aprimorar tratamentos médicos para pacientes usando a Nuvem AWS globalmente.

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    Estudo de caso de cliente

    Neste estudo de caso, veja como a Celgene possibilita a colaboração entre seus próprios pesquisadores e laboratórios de pesquisa acadêmica usando a AWS, além de possibilitar o trabalho em equipe proporcionando acesso isolado para pesquisadores de diferentes organizações.

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    Estudo de caso de cliente

    Neste estudo de caso, veja como o Instituto de Genômica da UC Santa Cruz conseguiu processar amostras com mais rapidez e transmitir os resultados com segurança para os colaboradores usando a AWS.

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Conformidade em genômica

Com a AWS, os pesquisadores têm acesso a maior eficiência de computação em escala, processamento de dados reproduzível, recursos de integração de dados para extrair conjuntos de dados multimodais e dados públicos para anotações clínicas, tudo em um ambiente pronto para conformidade.

Saiba mais sobre a conformidade em genômica com a AWS »

Selecione estudos de caso e recursos

Veja todos os estudos de caso de clientes de genômica e recursos relacionados

 

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Estudo de caso da Illumina

A Illumina desenvolve, fabrica e comercializa sistemas integrados para analisar genomas. Eles mudaram para as instâncias spot do Amazon EC2 e o Amazon S3, para economizar cerca de 300.000 USD em computação mensal e 90.000 USD em custos mensais de armazenamento.

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Estudo de caso da Iniciativa de Pesquisa da Fred Hutch Microbiome

A Fred Hutch está focada em tornar as drogas terapêuticas contra o câncer mais eficazes, por meio da tradução de gigabytes de conjuntos de dados do genoma bruto em insights. Usando o Nextflow, os pesquisadores orquestram os processos do AWS Batch e os analisam com as Instâncias spot do Amazon EC2, economizando dinheiro e fornecendo mais tempo para análise.

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Estudo de caso da DNAnexus

A DNANexus desenvolveu uma plataforma de informática de genoma e gerenciamento de dados baseada em nuvem na AWS. Estar na AWS ofereceu à DNAnexus conformidade e segurança sob medida com gerenciamento de dados refinado para transparência, reprodutibilidade e proveniência de dados.

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Estudo de caso da Fabric Genomics

A Fabric Genomics fornece soluções completas de análise, anotação, curadoria, classificação e relatórios de dados genômicos para usos clínicos. A Fabric Genomics optou por executar seu software na AWS porque oferecia alta velocidade computacional e segurança para seus clientes.

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Estudo de caso da Seven Bridges Genomics

A Seven Bridges Genomics criou sua plataforma de análise genômica na AWS, tornando a análise mais acessível e financeiramente viável para os pesquisadores. 

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Estudo de caso da Baylor College of Medicine

A Baylor College of Medicine trabalha para identificar genes que contribuem para o envelhecimento e doenças cardíacas. A Baylor firmou parceria com a DNAnexus para uma solução criada inteiramente com a AWS, o DNAnexus PaaS, que usa Amazon S3 e o Amazon Glacier para armazenar mais de 1 PB de dados genômicos da Baylor.

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Estudo de caso da Bayer Crop Science

A Bayer Crop Science ajuda seus clientes a determinar onde e quando produzir seus produtos, o que requer cargas de trabalho sazonais com base no ciclo de plantio. A Bayer recorreu à AWS para obter uma solução mais elástica e econômica para executar sua plataforma.

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Estudo de caso da Icahn School of Medicine at Mount Sinai

A Icahn School of Medicine at Mount Sinai e a Station X criaram o GenePool, uma plataforma de software de dados genômicos humanos. Com a AWS como base, a plataforma pode escalar dinamicamente em minutos e armazenar conjuntos de dados para clientes de genômica clínica e translacional.


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