我們已經能夠利用 FPGA 型 F1 執行個體大幅加快全基因體定序的程序。因此,過去需要花費 20 小時運算時間才能完成的工作,現在只需要 3 小時。
Professor Dr. Torsten Haferlach Chief Executive Officer, Munich Leukemia Lab

Munich Leukemia Lab (MLL) 是一間診斷和研究機構,其使命是尋找治療白血病和淋巴瘤的方法。MLL 使用先進的分子和 IT 支援方法,來塑造血液學診斷和治療的未來。藉助 AWS,MLL 將處理患者基因體資料的周轉時間從 20 小時減少至 3 小時,從而有助於加速研究並改善白血病的診斷。

MLL 使用高輸送量新一代定序 (NGS) 導致組織的計算和儲存需求大量增加,這超出了 MLL 本機基礎設施的容量。為了滿足其對可擴展運算和儲存日益增長的需求,同時保持高標準的資料安全性,MLL 轉向 Amazon Web Services (AWS),在 AWS 法蘭克福地區部署 Illumina 的 BaseSpace 解決方案。MLL 使用 Amazon Elastic Compute Cloud (Amazon EC2) FPGA 型 F1 執行個體來加速其基因體資料處理,與使用 Amazon Simple Storage Service (Amazon S3),以經濟實惠地儲存資料。自 2018 年以來,MLL 對 4,200 多名患者基因體的分析建立了超過 2.4 PB 的資料。MLL 目前正在尋求增加平行化、自動化和機器學習,以加速基因體分析並提升診斷準確性。