基因组学数据传输与存储使用案例

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数据传输与迁移

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用于将基因组学数据安全迁移和传输到 AWS 以优化成本的解决方案和服务。AWS 解决方案支持您传输和存储大规模基因组数据,并提供高吞吐量的数据摄取、低成本的存储选项,以及让您以安全且合规的方式进行安全访问。 AWS HealthOmics 提供基因组学感知对象存储,可帮助您降低存储成本、管理数据生命周期并安全地共享数据。

Illumina 徽标

通过在 Amazon S3 Glacier Deep Archive 中存储 PB 级不经常访问的数据,Illumina 客户可节省 90% 以上的存储成本。

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Genomics England 徽标

Genomics England 在 AWS 迁移加速计划(MAP)中,借助 AWS Professional Services 和 AWS 合作伙伴 Kainos 的力量,将数据从其 100,000 Genome Project 项目中迁移出。

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Paradigm4 徽标

Paradigm4 支持研究人员在 AWS 上对复杂的科学数据进行快速访问和可扩展分析。

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DNAnexus 徽标

“迁移到 DNAnexus on AWS 让企业为应对数据增长的情况打下了坚实的基础,且无需降低管道的便携性。我们将帮助诊断和生物制药领域的客户显著加快管道执行速度,在某些情况下甚至可以提速一倍以上。”

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Illumina 徽标

“我们致力于帮助研究人员管理海量的多基因组数据,为此构建了 Illumina Connected Analytics,这是一个完善且基于云的平台,能够让用户在安全、可扩展且灵活的 AWS 环境中开展数据管理、分析工作,并解读大批量的多基因组数据。”

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Seven Bridges 徽标

“Seven Bridges 平台和 GRAF™ 及 ARIA™ 等分析工具基于 AWS 所提供的灵活度与可扩展性打造,能够让研究人员充分利用基因组和表型数据的海量存储库,从而或能揭示对基础疾病的变革性洞察、全新治疗方法和计算机疾病模型。”

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NetAPP Cloud Manager 是用于部署和运行 NetApp 云数据服务的管理和自动化平台。

安全协作

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能够实现安全行业协作和数据共享的解决方案。AWS HealthOmics Storage 和 AWS 合作伙伴提供可扩展、成本高效且易于维护的解决方案,以在全球范围内实现快速、安全的合作。 

Lifebit 徽标

Lifebit 创建了一个高校系统,支持研究人员数秒内就能在大型数据集上进行安全协作。 

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Biogen 徽标

Biogen 的 AWS 架构让其能够轻松地与合作伙伴合作,为 50 万参与者分析数据。  

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Melbourne Genomics Health Alliance 徽标

Melbourne Genomics Health Alliance 在 AWS 上构建了 GenoVic,使联盟成员之间能够共享基因组数据。

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DNAnexus 徽标

“DNAnexus Apollo 帮助医疗中心和生物制药公司实现跨合作伙伴站点的协作,并对将基本发现转化为实践临床应用程序这一过程进行优化,以为患者提供更精准的治疗方案。”

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Illumina 徽标

“Illumina 凭借 Illumina Connected Analytics (ICA) on AWS 加速研究人员发现新成果的速度。有了 ICA,研究人员便可以安全地在可扩展且灵活的环境中管理、分析和解读大量多基因组数据。”

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Seven Bridges 徽标

“Seven Bridges 借助 AWS 的服务来确保全球最珍贵的数据——从世界各地人们身上获取的基因组和医疗保健数据——在保证安全的前提下仍能够让研究人员、生物医药领域的开发人员、临床医学界、学术界和政府以协作的方式加以利用。”

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DataEz 是一款专为生命科学而设计的模块化、可扩展、安全且合规的数据分析平台。客户可以部署核心基础设施,配置托管式数据服务,并将多个数据服务链接在一起,以创建自定义数据管道。

基因组数据共享

以负责且安全的方式共享基因组数据的解决方案。AWS 及其合作伙伴将为全球范围内的基因组数据集提供所需的工具、解决方案以及安全措施,以便托管和访问这些数据集并为其做出贡献。

AWS 解决方案

Registry of Open Data on AWS

Registry of Open Data on AWS 托管着 70 多个 生命科学数据库,其中包括 Cancer Genome Atlas 和 Genome Aggregation Database。 

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英国生物银行徽标

DNAnexus 和 AWS 为英国生物银行研究分析平台提供技术支持。

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英属哥伦比亚大学徽标

英属哥伦比亚大学使用 AWS Registry of Open Data 在 11 天内识别出 13 万种新病毒。

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斯坦福大学徽标

借助 AWS,Wall Lab 创建了 iHART 数据集,并将其包含在 Registry of Open Data on AWS 中。

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DNAnexus 徽标

“英国生物银行的研究分析平台由 DNAnexus on AWS 构建,实现了民主化的基因组数据访问并强化了协作,帮助全球最顶尖的科学家们充分发挥自身想象力(无论他们身处何方),以期取得能够改善人类健康状况的重大发现。

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Illumina 徽标

“在 Illumina,我们通过与 AWS 上的 Illumina Connected Analytics 进行全面合作,使研究人员能够加速发现成果的进程,让他们可以在安全、可扩展和灵活的环境中轻松管理、分析和解读大量多组学数据。”  

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Seven Bridges 徽标

“Seven Bridges 借助 AWS 的服务来确保全球最珍贵的数据——从世界各地人们身上获取的基因组和医疗保健数据——在保证安全的前提下仍能够让研究人员、生物医药领域的开发人员、临床医学界、学术界和政府以协作的方式加以利用。”

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DataEz 是一款专为生命科学而设计的模块化、可扩展、安全且合规的数据分析平台。客户可以部署核心基础设施,配置托管式数据服务,并将多个数据服务链接在一起,以创建自定义数据管道。

白皮书:使用 AWS 服务进行基因组数据传输、分析和机器学习

本白皮书中说明了如何使用 AWS 服务构建一个覆盖了仪器到解释的整个过程的下一代测序 (NGS) 平台,并给出了开发该平台的建议和参考架构,包括:1) 将基因组数据传输到 AWS 并建立数据访问模式,2) 运行二次分析工作流,3) 使用数据湖进行第三级分析,以及 4) 使用机器学习进行第三级分析。

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