ゲノミクス データ転送およびストレージユースケース

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データ転送と移行

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ゲノムデータを有料でAWS に安全に移行して転送するためのソリューション。AWS ソリューションにより、大規模なゲノムデータを転送および保存し、高スループットのデータインジェスト、費用対効果の高いストレージオプション、安全で準拠した方法による安全なアクセスを活用できます。

Illumina ロゴ

Illumina は、アクセス頻度の低いペタバイト単位のデータを Amazon S3 Glacier Deep Archive に保存し、顧客のストレージコストを 90% 以上節約しています。

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Genomics England ロゴ

Genomics England は、AWS Migration Acceleration Program (MAP) の一環として、AWS プロフェッショナルサービスと AWS パートナーの Kainos と協働して、100,000 ゲノムプロジェクトからデータを移行しています。

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Paradigm4 ロゴ

Paradigm4 は、研究者が AWS 上の複雑な科学データへの迅速なアクセスとスケーラブルな分析を行えるようにしています。

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DNAnexus ロゴ

「AWS 上の DNAnexus に移行することで、企業はパイプラインのポータビリティを損なうことなく、データ成長のための強固な基盤を得ることができます。当社は、診断薬やバイオ医薬品企業のお客様がパイプラインの実行を大幅に加速することを支援しており、中には 2 倍以上に加速するケースもあります」

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Illumina ロゴ

「当社は研究者が大量のマルチオミックスデータを管理できるようにすることに取り組んでおり、安全性、拡張性、柔軟性に優れた AWS 環境上で、大量のマルチオミックスデータのデータ管理、分析、解釈を容易にする包括的なクラウドベースのプラットフォームである Illumina Connected Analytics を構築しました」

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Seven Bridges ロゴ

「Seven Bridges プラットフォームと GRAF™ や ARIA™ などの Seven Bridges 分析ツールは、AWS の柔軟性と拡張性を利用しており、研究者がゲノムや表現型の膨大なデータのリポジトリを活用することを可能にしています。これにより、疾患の根底にあるもの、新しい治療法、試験管内疾患モデルに関する革新的なインサイトを見出せる可能性があります」

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NetApp Cloud Manager は、ネットアップのクラウドデータサービスをデプロイおよび運用するための管理および自動化プラットフォームです。

安全なコラボレーション

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安全な業界コラボレーションとデータ共有を可能にするソリューション。AWS と AWS パートナーは、スケーラブルでコスト効率が高く、メンテナンスが行えるソリューションを提供し、迅速で安全なグローバルなコラボレーションを実現します。 

Lifebit ロゴ

Lifebit は、研究者が大規模なデータセットを数秒で安全に共同作業できるシステムを作成しました。 

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Biogen ロゴ

Biogen の AWS アーキテクチャにより、パートナーと容易に連携して 500,000 人分の患者データを分析できるようになりました。  

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メルボルンゲノミクスヘルス連盟のロゴ

メルボルンゲノミクスヘルス連盟は AWS 上で GenoVic を構築し、Alliance メンバー間でゲノムデータを共有できるようにしています。

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DNAnexus ロゴ

「DNAnexus Apollo は、医療センターとバイオ医薬品企業がパートナーサイト間で協力し、基礎的な発見を実用的な臨床応用へとつなげることを最適化することで、より正確な患者の治療を追求できるようにしています」

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Illumina ロゴ

「Illumina は、AWS 上の Illumina Connected Analytics (ICA) により、研究者が迅速に発見できるようにしています。ICA を使うことで、研究者は大量のマルチオミックスデータをスケーラブルで柔軟な環境で安全に管理、分析、解釈することができます」

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Seven Bridges ロゴ

「Seven Bridges は、AWS の力を活用して、世界で最も貴重なデータである世界中の個人から集められたゲノムデータやヘルスケアデータの安全性を確保しつつ、バイオファーマ、臨床現場、アカデミア、政府の研究者や医薬品開発者が共同で利用できるようにしています」

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DataEz は、ライフサイエンス分野向けに設計された、モジュール式で拡張性があり、安全性とコンプライアンスに優れたデータ分析プラットフォームです。お客様は、コアインフラストラクチャをデプロイし、マネージドデータサービスを設定し、複数のデータサービスを連結してカスタムデータパイプラインを構築することができます。

ゲノムデータ共有

ゲノムデータを責任を持って安全に共有するためのソリューション。AWS とそのパートナーは、世界中のゲノムデータセットをホストし、アクセスし、貢献するために必要なツール、ソリューション、セキュリティを提供しています。

AWS のソリューションとガイダンス

Registry of Open Data on AWS

Registry of Open Data on AWS は、Cancer Genome Atlas や Genome Aggregation Database を含む 70 以上のライフサイエンスデータベースをホストしています。 

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Biobank ロゴ

DNAnexus と AWS は、UK Biobank の研究分析プラットフォームを支えるテクノロジーを強化しています。

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ブリティッシュコロンビア大学のロゴ

ブリティッシュコロンビア大学は AWS Registry of Open Data を使用して、11 日間で 130,000 個の新しいウイルスを特定しました。

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スタンフォード大学のロゴ

Wall Lab は AWS の支援を受けて iHART データセットを作成し、Registry of Open Data on AWS に含めました。

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DNAnexus ロゴ

「DNAnexus が AWS 上に構築した UK Biobank の研究分析プラットフォームは、ゲノムデータへのアクセスを民主化し、よりコラボレーションしやすくすることで、世界最高の科学者がどこにいようともその想像力を解き放ち、人々の健康を向上させる発見が行えるように支援しています」

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Illumina ロゴ

「Illumina では、AWS 上の Illumina Connected Analytics により、研究者が安全でスケーラブルかつ柔軟な環境で大量のマルチオミックスデータを容易に管理、分析、解釈できるようにし、世界中で協力して迅速な発見を支援しています」  

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Seven Bridges ロゴ

「Seven Bridges は、AWS の力を活用して、世界で最も貴重なデータである世界中の個人から集められたゲノムデータやヘルスケアデータの安全性を確保しつつ、バイオファーマ、臨床現場、アカデミア、政府の研究者や医薬品開発者が共同で利用できるようにしています」

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DataEz は、ライフサイエンス分野向けに設計された、モジュール式で拡張性があり、安全性とコンプライアンスに優れたデータ分析プラットフォームです。お客様は、コアインフラストラクチャをデプロイし、マネージドデータサービスを設定し、複数のデータサービスを連結してカスタムデータパイプラインを構築することができます。

ホワイトペーパー: AWS のサービスを使用したゲノミクスデータの転送、分析、および機械学習

このホワイトペーパーでは、AWS のサービスを利用してツールから解釈までの次世代シーケンシング (NGS) プラットフォームを構築する方法について説明し、次のようなプラットフォームを開発するための推奨事項と参照アーキテクチャを示します。1) AWS へのゲノムデータの転送とデータアクセスパターンの確立、2 ) 二次分析ワークフローの実行、3) データレイクを使った三次分析の実行、および 4) 機械学習を使った三次分析の実行。

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