AWS HealthOmics のリソース

AWS HealthOmics の使用方法は、こちらのステップバイステップのデベロッパーガイドで学習できます。

AWS HealthOmics の API とパラメータについては、こちらのリファレンスガイドをご覧ください。

HealthOmics ワークフローとストレージの使用を開始する

AWS HealthOmics を使用してゲノムおよび生物学的データセットを保存、処理、クエリする方法を示すサンプルコードを含む GitHub のオープンソースリポジトリ。

この AWS HealthOmics ワークフローのコレクションを使用して、創薬を加速しましょう

オープンソースの HealthOmics ワークフローサンプルに基づいてプライベートワークフローを構築しましょう

実行アナライザーは、CloudWatch から実行マニフェストログを取得し、各ワークフロータスクの CPU とメモリの使用率など、実行の統計情報を生成する、実行パフォーマンス最適化ツールです

HealthOmics WDL リンターを使用して、ワークフローを実行する前に一般的なワークフローエラーを検出しましょう

ワークフロースクリプトを実行する前に、一般的な Nextflow エラーを検出するために lint を実行しましょう

ECR ヘルパーツールを使用して、既存のコンテナをプライベート ECR リポジトリに移行しましょう

CloudWatch 実行マニフェストログからアーカイブされた実行を再実行できます

AWS HealthOmics リファレンスまたは読み取りセットからファイルを簡単にダウンロードできます

Amazon S3 でオブジェクトが作成される際に、AWS HealthOmics シーケンスストアへのデータのインポートを自動化するイベント駆動型アーキテクチャをデモンストレーションする CDK アプリケーション。

AWS HealthOmics シーケンスストアインポートジョブの JSON マニフェストを生成します

AWS HelathOmics シーケンスストアに保存されている重複読み取りセットを識別します

このガイダンスでは、ラボの機器データと、電子実験ノート (ELN) やラボ情報管理システム (LIMS) などのソフトウェアシステムの両方を HealthOmics と統合する科学的データ管理システムを構築する方法を説明します。

このガイダンスは、ライフサイエンスのデータ機器と研究室のシステムファイルを、インターネットまたは低レイテンシーの直接接続を通じて AWS クラウドに接続するのに役立ちます。

このガイダンスでは、オミクス配列データを Amazon Simple Storage Service (Amazon S3) から AWS HealthOmics Storage にインポートする方法を示しています。

このガイダンスは、マルチモーダルヘルスケアおよびライフサイエンス (HCLS) データを分析するためのエンドツーエンドのフレームワークを設定する方法を示しています。

このガイダンスでは、本番グレードのバイオインフォマティクスワークフローを大規模に構築して実行する方法、ならびにオートメーション、ワークフロー分析、ストレージ、運用およびコストのオブザーバビリティのために AWS サービスを利用する方法を示しています。

このガイダンスは、マルチモーダルヘルスケアおよびライフサイエンス (HCLS) データを分析するためのエンドツーエンドのフレームワークを設定する方法を示しています。