ドキュメント

  • ユーザーガイド

    AWS HealthOmics の使用方法は、こちらのステップバイステップのデベロッパーガイドで学習できます。

  • API リファレンス

    AWS HealthOmics の API とパラメータについては、こちらのリファレンスガイドをご覧ください。

チュートリアル

ツール

ワークフローツール

創薬ワークフロー

この AWS HealthOmics ワークフローのコレクションを使用して、創薬を加速しましょう

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サンプルワークフロー

オープンソースの HealthOmics ワークフローサンプルに基づいてプライベートワークフローを構築しましょう

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実行アナライザー

実行アナライザーは、CloudWatch から実行マニフェストログを取得し、各ワークフロータスクの CPU とメモリの使用率など、実行の統計情報を生成する、実行パフォーマンス最適化ツールです

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WDL リンター

HealthOmics WDL リンターを使用して、ワークフローを実行する前に一般的なワークフローエラーを検出しましょう

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Nextflow リンター

ワークフロースクリプトを実行する前に、一般的な Nextflow エラーを検出するために lint を実行しましょう

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ECR ヘルパー

ECR ヘルパーツールを使用して、既存のコンテナをプライベート ECR リポジトリに移行しましょう

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再実行ツール

CloudWatch 実行マニフェストログからアーカイブされた実行を再実行できます

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データストレージツール

読み取りセット転送マネージャー

AWS HealthOmics リファレンスまたは読み取りセットからファイルを簡単にダウンロードできます

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イベント駆動型インポーター

Amazon S3 でオブジェクトが作成される際に、AWS HealthOmics シーケンスストアへのデータのインポートを自動化するイベント駆動型アーキテクチャをデモンストレーションする CDK アプリケーション。

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シーケンスストアマニフェストジェネレーター

AWS HealthOmics シーケンスストアインポートジョブの JSON マニフェストを生成します

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シーケンスストア重複読み取りセットファインダー

AWS HelathOmics シーケンスストアに保存されている重複読み取りセットを識別します

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ソリューション

最新情報

AWS HealthOmics ワークフローが NVIDIA L4 および L40S GPU および拡張された CPU オプションのサポートを開始
2025 年 3 月 7 日

AWS HealthOmics のクロスアカウントデータストア読み取りアクセスの発表
11/22/2024

AWS HealthOmics ワークフローがコールキャッシュと中間ファイルアクセスのサポートを開始
11/21/2024

AWS HealthOmics が DSL と Nextflow のバージョン検出のサポートを開始
2024 年 8 月 13 日

AWS HealthOmics がプライベートワークフローでの動的実行ストレージのサポートを開始
2024 年 4 月 30 日

AWS HealthOmics がプライベートワークフローでのクロスアカウント共有のサポートを開始
2024 年 4 月 30 日

AWS HealthOmics announces support for reading sequence stores through Amazon S3 APIs
04/15/24

AWS HealthOmics がワークフロー実行に関する追加情報の提供を開始
2024 年 2 月 23 日

AWS HealthOmics が Ultima Genomics DeepVariant Ready2Run ワークフローのサポートを開始
2024 年 2 月 5 日

AWS HealthOmics シーケンスストアで、読み取りセット用に自動計算された ETag が追加
2023年10月6日

AWS HealthOmics がイスラエル (テルアビブ) リージョンでご利用いただけるようになりました
2023年9月26日

AWS HealthOmics がワークフロー実行のアーカイブと保存のサポートを開始
2023年8月30日

AWS HealthOmics で注釈ストアのバージョニングのサポートを開始
2023年8月15日

AWS HealthOmics が Omics Analytics のストアのクロスアカウント共有をサポート
2023 年 8 月 15 日

ブログ記事

MGI、Sentieon、AWS でゲノムデータストレージとワークフローを強化する
2025 年 2 月 25 日

AWS を使用して集団全体のゲノム変異を調べる
2025 年 1 月 29 日

AWS HealthOmics と NVIDIA ブループリントで創薬を促進する
2024 年 10 月 7 日

Building a secure and low-code bioinformatics workbench on AWS HealthOmics
2024 年 10 月 2 日

AWS と EvolutionaryScale によるジェネレーティブ・バイオロジー (生成生物学) の革新
2024 年 6 月 25 日

How Takeda Pharmaceuticals Accelerates Large-Scale Bioinformatics with AWS HealthOmics
2024 年 6 月 19 日

Unlock Powerful Genomic Insights with AWS HealthOmics Analytics and Amazon EMR
2024 年 5 月 30 日

Orchestrating Multiple AWS HealthOmics Workflows at Scale
2024 年 5 月 7 日

Democratize Omics Data Analysis with Basepair on AWS HealthOmics
2024 年 4 月 29 日

AWS HealthOmics Announces New Capabilities for Seamless Integration of Omics Data Stores and Analysis Tools
2024 年 4 月 17 日

Store omics data cost effectively at any scale with AWS HealthOmics
2024年1月24日

AFNI と AWS HealthOmics を使用した AWS での fMRI データ前処理
2024年1月8日

AWS HealthOmics へのワークフロー移行を加速する新しいツール
2023年12月13日

AWS Health および機械学習サービスによるマルチモーダルデータ分析
2023年10月16日

AWS HealthOmics と Amazon EventBridge を使用したバイオインフォマティクスワークフローのイベント駆動型アーキテクチャの設計
2023年10月11日

AWS HealthOmics でゲノムワークフローとデータを保護しましょう
2023 年 10 月 9 日

動画

AWS re:Invent 2024 - 臨床診断業務の拡大: Natera のゲノムイノベーション (48:52)

AWS re:Invent 2024 - メルクが生物学的基盤モデルを使用して医薬品設計を改善する方法 (39:38)

Overcoming the Scientific and IT Challenges Associated with Scaling Omics Analysis (22:11)

Revolutionizing precision medicine: Sonrai uses AWS for drug discovery (3:03)

AWS re:Invent 2023 - Omics innovation with AWS HealthOmics: Amgen’s path to faster results

AWS re:Invent 2023-AWS HealthOmics を使用した精密医療プラットフォームの構築

AWS HealthOmics エンドツーエンドワークショップ — プレゼンテーション (43:27)

AWS On Air ft。AWS HealthOmics とオープンデータ (20:07)

ゲノミクスに AWS HealthOmics をエンドツーエンドで使用 (2:03:06)

AWS On Air ft。AWS HealthOmics ですぐに実行できるワークフロー (26:34)