無料利用枠

Amazon Omics は AWS 無料利用枠に含まれているので、無料で開始できます。無料利用枠は、初めて Amazon Omics リソースを作成した最初の月から開始されます。Amazon Omics の無料利用枠の詳細は、以下の表でご確認いただけます。

 

最初の 2 か月間は 1 か月あたりの無料利用枠を利用可能

Amazon Omics ストレージ アクティブストレージクラスで 1500 ギガベース/月、アーカイブストレージクラスで 1500 ギガベース/月
Amazon Omics ワークフロー

275 omics.m.xlarge インスタンス時間または同等のコンピューティングインスタンス、および 49,000 GB-時間の実行ストレージ

Amazon Omics 分析 200 ギガバイト/月

Amazon Omics ストレージの料金

Amazon Omicsストレージにゲノム配列を保存する場合、ギガベース/月単位でストレージ料金を支払います。ギガベースとは、インポートしたシーケンスファイル (FASTQ、BAM、CRAM など) から抽出された 10 億塩基対を指します。Amazon Omics ストレージには、ソースファイルから抽出された塩基対、品質スコア、整列、その他のメタデータが保存されます。保存されたギガベース単位で支払うため、最適なファイル形式や圧縮技術を気にする必要はありません。Amazon Omics がすべての処理を行います。

シーケンスオブジェクトは読み取りセットと呼ばれ、論理的には FASTQ、BAM、または CRAM ファイルと同等のものです。Amazon Omics ストレージでは、読み取りセットに対してアクティブストレージクラスとアーカイブストレージクラスが提供されます。アーカイブクラスの読み取りセットの保存コストは、アクティブクラスの読み取りセットよりも 1 か月あたりのコストが低くなります。アクティブクラスの読み取りセットにはミリ秒単位でアクセスできます。アーカイブ層の読み取りセットは、アクセスする前にアクティブ化する必要があります。読み取りセットが 30 日間アクセスされなければ、自動的に低コストのアーカイブストレージクラスに移動し、再度アクティブ化されるまで保存されます。

読み取りセットのインポート手数料はかかりません。Amazon Omics のストレージデータには、最小ストレージ期間である 30 日分の料金が請求されます。30 日が経過する前に削除されたデータには、残りの日数分のストレージ料金に等しい日割り料金が発生します。Amazon Omics ストレージは、長期間使用するが頻繁にアクセスしないデータを年単位で保持するためのものです。

読み取りセットオブジェクトに対して行われた GET 要求には料金がかかります。読み取りセットに関するその他のリクエストタイプはすべて無料です。

Amazon Omics 分析の料金

Amazon Omics 分析は、Amazon Athena や Amazon SageMaker などの幅広い AWS 分析および機械学習サービスで使用するゲノムバリアントデータやゲノム注釈を準備するのに役立ちます。ゲノムバリアントデータを任意の量で保存でき、保存した分だけの料金を支払います。データサイズは、変換されたデータのサイズとして定義されます。ただし、他のサービスのデータをクエリおよび分析する場合は、それらのサービスの使用料を支払います。

Amazon Omics 分析のデータには、最小ストレージ期間である 30 日分の料金が請求されます。30 日が経過する前に削除されたデータには、残りの日数分のストレージ料金に等しい日割り料金が発生します。

Amazon Omics ワークフローの料金

Amazon Omics は、バイオインフォマティクスワークフローの解釈と実行も管理します。Amazon Omics ワークフローでは、最も一般的に使用されている 2 つのワークフロー言語である WDL と Nextflow で書かれたバイオインフォマティックスのスクリプトを実行することができます。これらのスクリプトの 1 回の実行を「実行」と呼びます。使用した分の料金のみをお支払いいただきます。また、Omics インスタンスタイプと実行ストレージの料金は別途請求されます。ワークフロー内のすべてのタスクは、定義されたリソースに最適なインスタンスにマッピングされます。例えば、8 コア CPU と 60 GB の RAM を使用するように定義されたタスクは、omics.r.2xlarge インスタンスタイプにマッピングされて実行されます。ワークフローログは、アカウントの Amazon CloudWatch Logs に保存され、保持することを選択している限り、CloudWatch で料金が請求されます。実行ごとにリソース使用量をレポートするようにサービスを設定して、予算、計画、会計を簡素化することができます。

料金の例

例 1

ある集団シーケンシングイニシアチブでは、収集したバイオバンクから個人の配列を開始しました。これは、欧州西部 (アイルランド) リージョンで行われました。それぞれ 130 ギガベースの 10 万人の個人を配列し、生のシーケンシングデータを Amazon Omics ストレージに保存します。今後 5 年間は、インポート後 30 日経過してもアーカイブストレージクラスに残り、アクティブストレージクラスに移動した後は 30 日間で平均 2 回アクセスされます。各ゲノムは 500 回に分けてダウンロードされ、500 の GET API コールが生成されます。1 つのゲノムにかかる 5 年間の合計コストは、次のとおりです。
アクティブストレージクラス: 0.005769 USD ギガベース/月 * 130 ギガベース * 90 日 = 2.22 USD
アーカイブストレージクラス: 0.001154 USD ギガベース/月 * 130 ギガベース * (1,825 – 90) 日 = 8.56 USD
GET API: 0.005 USD/1,000 API コール * (2 * 500 API コール) = 0.005 USD
5 年間の合計コスト: 2.22 USD + 8.56 USD + 0.005 USD = 10.79 USD (または 2.16 USD/年)

例 2

バイオインフォマティクスの研究者が、米国東部 (バージニア北部) リージョンの Amazon Omics ワークフローで Nextflow ワークフローを実行したいと考えています。ワークフローには 3 つのタスクがあります。1 つ目のタスクでは 16 vCPU と 30 GB のメモリを確保し、3 時間かけて実行します。2 つ目のタスクには 32 vCPU と 160 GB のメモリが必要で、実行には 2 時間かかります。3 つ目のタスクでは 4 vCPU と 10 GB のメモリを確保し、10 分かけて実行します。お客様がワークフローを登録し、デフォルトの 1200 GB のファイルシステムで StartRun API を呼び出します。合計コストは以下の通りです。
タスク 1 (omics.c.4xlarge): 0.9180 USD/時間 * 3 時間 = 2.754 USD
タスク 2 (omics.r.8xlarge):
2.7216 USD/時間 * 2 時間 = 5.4432 USD
タスク 3 (omics.m.xlarge): 0.2592 USD/時間 * 1/6 時間 = 0.0432 USD
ストレージ: 0.0001918 USD/GB-時間 * (1200 GB*(3 時間 +2 時間 + 1/6 時間)) = 1.18916 USD
合計: 9.42956 USD

例 3

あるデータサイエンティストが、バリアントコールフォーマット (VCF) ファイルを 3,202 個持っていて、米国東部 (バージニア北部) リージョンの Amazon Athena で分析したいと考えています。バリアントストアを作成し、Amazon Omics API を使用してこれらのファイルを取り込みます。取り込まれたデータのサイズは 1.5 TB です。その後 1 か月の間に、Athena でクエリを 1000 回実行し、異なる亜母集団の対立遺伝子頻度を計算し、各実行で平均 50 GB を消費しました。全体的な月間コストは次のとおりです。
バリアントストア: 0.035 USD GB/month * (1,024 GB/TB * 1.5 TB) = 53.76 USD
Amazon Athena: 5 USD/TB * 1,000 * 50 / 1,024 = 244.14 USD

その他の料金リソース

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