亚马逊AWS官方博客

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基于 Amazon EKS 在 Pachyderm 框架上 快速搭建 GATK 分析流程

Amazon EKS 简化了 Kubernetes 集群的构建与维护,而 Pachyderm 进一步简化了分析类工作流的运行与管理,两者结合,无疑将使得在 Kubernetes 平台上部署企业级分析平台更为轻松。本文通过一个 GATK 基因分析的示例来演示搭建和使用的过程,为您在 Amazon EKS 上采用该解决方案提供参考。

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在 AWS 中国区域一键部署面向基因分析的 Cromwell-on-AWS-Batch 解决方案

Cromwell-on-AWS-Batch是AWS在生命科学领域联合Broad研究院推出的解决方案,已有很多AWS海外区域的客户在使用该解决方案进行基因分析。AWS Batch服务于2019年10月在AWS中国区域上线之后,我们随即根据AWS中国区域的特点对该解决方案进行了适应修改和优化提升,本文通过一个测试示例和一个GATK实际例子来演示在中国区域一键部署的过程,为国内基因分析客户快速上手使用该解决方案加速分析效率提供参考。

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