게시된 날짜: Mar 7, 2022
오늘 Amazon Genomics CLI가 Cromwell, Nextflow, miniWDL도 포함하는 유전체 분석을 위한 워크플로 관리 도구 카탈로그에 Snakemake를 추가했다고 발표했습니다.
Snakemake는 워크플로를 종속성의 더 작은 단계로 분해하는 규칙으로 워크플로를 지정합니다. Snakemake는 자동으로 규칙 간의 종속성을 결정하고 python 기반 규칙 정의 구문 구조를 통해 추가 제어를 제공합니다. Snakemake와 같은 워크플로 관리 도구가 제공하는 재현성과 투명성의 이점은 Amazon Genomics CLI를 통해 대규모로 실현됩니다. Amazon Genomics CLI는 워크플로 엔진 및 컴퓨팅 클러스터와 같은 클라우드 리소스의 배포를 간소화 및 자동화하여 유전체학 및 생명과학 고객에게 Amazon Web Services(AWS)에서 유전체학 워크플로를 빠르게 설정하고 실행할 수 있는 간편한 명령줄을 제공합니다. 클라우드에서 유전체학 워크플로를 설정 및 실행하는 번거로운 작업을 제거해 주므로 소프트웨어 개발자와 연구자는 클라우드 리소스를 자동으로 프로비저닝, 구성 및 확장하여 더 빠르고 비용 효과적인 인구 수준의 유전체학 연구, 약물 개발 주기 등을 활성화할 수 있습니다.
Amazon Genomics CLI는 AWS 중국 리전, AWS GovCloud(미국) 및 에어갭 지역을 제외한 대부분의 사용 리전에서 시작 시 사용할 수 있습니다.