Tag: HPC

通过对地震波建模SPECFEM3D和EFISPEC3D的两种开源实现在亚马逊云科技HPC架构上的落地介绍，展示了Amazon ParallelCluster的集群管理能力，使用置放群组、Elastic Fabric Adapter（EFA）和Amazon FSx for Lustre服务优化，满足了高性能计算的要求。

为满足各大油气服务企业将软件快速落地中国的需求，亚马逊云科技和行业内知名公司在软件部署、易用性、成本优化等方面进行了一系列的探索。本文会详细介绍在油气行业数字化创新实践中使用到的解决方案及部署过程中的技术问题。

Blog结合 AWS Serverless 及云原生的HPC服务，演示了相对完整的HPC业务场景，包括前端交互、任务自动化编排及调度、HPC 计算与任务管理，以及CI/CD与基础设施代码化构建业务所需环境。

Deepmind团队于2021年7月公开了Alphafold2算法源代码和相关论文，这一方案被认为可解决困扰生物学长达半个世纪的蛋白质折叠结构预测难题，其准确度高达92.4(百分制)。Alphafold2基于新颖的机器学习方法，以原子精度预测蛋白质结构，在大部分情况下表现出与实验相媲美的准确性，且大大优于其他方法。但截至目前，其官方的单机部署方式需要人工下载数据集并解压、处理输入输出数据以及执行任务脚本，无法实现弹性按需使用，不适用于大规模的蛋白质结构预测。

本文旨在介绍如何利用亚马逊云科技云服务实现药物发现阶段的大规模分子虚拟筛选任务。

利用AWS Batch的多节点并行作业为基于MPI的紧耦合容器化负载调用海量云端计算资源

使用 Slurm Federation 调度实现HPC混合云 Cloudburst

Synopsys 和 AWS 意识到随着半导体技术的进步不断推高每个芯片的复杂性，客户数据中心面临着满足日益增长的资源需求的挑战。 OPC 很适合利用 AWS 云的无限计算规模，因为计算可以并行化。Synopsys 和 AWS 决定启动一项联合调查，以确定 Synopsys Preteus 如何在 AWS 上扩展。

使用电子设计自动化 (EDA) 应用程序的半导体和电子产品公司可以通过利用 AWS 上近乎无限的计算、存储和其他可用资源，大大加快其产品开发生命周期和上市时间。在这篇工作负载支持的博客文章中，我将提供架构(Scale-Out Computing on AWS)和系统级指导，以构建能够将 EDA 应用程序扩展到 30000 个或以上核心的环境。

详细介绍了BeeGFS并行文件系统的Buddy Group使用和故障恢复功能。