Genomica nel cloud

Semplifica e dimensiona le analisi genomiche in sicurezza con AWS.

AWS offre una scalabilità innata e un ecosistema di partner per strumenti e strumenti preparati per gestire carichi di lavoro e dati sensibili. I clienti AWS possono velocizzare i tempi di analisi genomica e creare un ponte tra l'infrastruttura locale esistente e il cloud.

Grazie ad AWS puoi memorizzare ed elaborare in maniera efficace e dinamica i dati, collaborare con i colleghi e integrare le analisi e il machine learning nell'esperienza pratica a livello clinico.   

I più importanti leader nel campo della genomica parlano dei vantaggi del cloud

Vantaggi

Aumenta la velocità delle scoperte scientifiche

AWS consente ai clienti di questo settore di derivare dati analitici utilizzabili da dati complessi di grandi dimensioni. Non sono necessari grandi investimenti iniziali in termini di tempo e denaro per creare e mantenere l'infrastruttura. AWS consente di accedere alla quantità di risorse necessarie in modo quasi istantaneo, pagando solo in base all'uso effettivo.

Scalabilità e allocazione dinamica delle risorse

Eseguendo pipeline di analisi genomica su AWS significa poter scalare in maniera efficace in base ai picchi di richiesta, quindi ridimensionare nuovamente quando la richiesta cala. AWS fornisce anche alcuni metodi alternativi per l'elaborazione e la definizione dei prezzi per completare l'esecuzione dei test di genomica.

Personalizza e ottimizza i flussi di lavoro

Dalla creazione della pipeline genomica all'integrazione dei risultati genomici fino ai modelli di trattamento diagnostico, AWS dispone di un vasto ecosistema di partner con cui collaborare per ottimizzare e personalizzare i flussi di lavoro. Questo sistema ti offre una varietà di opzioni flessibili e ti consente di offrire una scelta per le tue soluzioni.  

Cromwell su AWS

Cromwell, un sistema di gestione dei flussi di lavoro di Broad Institute ora è supportato dal cloud AWS. Con Cromwell su AWS ricercatori e scienziati avranno a disposizione ancora più flessibilità per dimensionare gli esperimenti genomici utilizzando le funzionalità di elaborazione nel cloud, invece che contendersi risorse locali limitate.

Casi d'uso nel settore della genomica

  • Contenitori
  • Gestione del flusso di lavoro
  • Analisi di Big Data
  • Set di dati
  • Collaborazione
  • Contenitori
  • Contenitori per pipeline genomiche

    Per facilitare le pipeline genomiche nella distribuzione ed esecuzione, è possibile incapsulare i processi ed eseguire contenitori nel cloud AWS. Configura l'architettura del flusso di lavoro plug-n-play e crea un ambiente specifico per le tue esigente relative a ricerca e flussi di lavoro. Utilizzando Amazon EC2 Container Service (ECS) o eseguendo Docker su AWS puoi risolvere i problemi legati a genomiche più grandi in piccole parti, rendendo l'output di dati riproducibile e i dati facilmente condivisibili.

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    Video dell'architettura

    Scopri le pipeline di applicazioni potenti e riutilizzabili create in AWS da Human Longevity, Inc. in questo video sull'architettura. Guarda in che modo elabora fino a 12 TB di dati grezzi al giorno in Amazon S3 tramite strumenti di analisi personalizzati in esecuzione in contenitori Docker.

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    Diagramma dell'architettura

    Esplora il dettagliato diagramma dell'architettura da Human Longevity, Inc. per utilizzare Docker su AWS per le analisi genomiche

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    Caso di studio del cliente

    In questo caso di studio, scopri come Benchling riduce il tempo di ricerca del 90% e scala a centinaia di genomi utilizzando AWS Lambda. 

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  • Gestione del flusso di lavoro
  • Gestione del flusso di lavoro

    Per consentire una gestione più efficiente della tua pipeline genomica, puoi definire regole di gestione del flusso di lavoro nel cloud AWS. Componi ed esegui una serie di passaggi di manipolazione dei dati o di elaborazione e ottimizza la parallelizzazione delle attività per velocizzare il tempo per il completamento.

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    Caso di studio del cliente

    In questo caso di studio, scopri come il Baylor College of Medicine ha lavorato con DNAnexus per spostare le pipeline di analisi genomica sul cloud AWS. Guarda come hanno alimentato grandi studi clinici di genomica che necessitavano di un ambiente sicuro e conforme

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    Caso di studio del cliente

    In questo caso di studio, scopri come DNAnexus ha creato una piattaforma per le analisi genomiche su AWS. Guarda come la combinazione tra i controlli e certificazioni dell'infrastruttura AWS e della piattaforma DNAnexus hanno permesso di soddisfare i requisiti di conformità HIPAA, CAP/CLIA, GxP e altre leggi e regolamentazioni in ambito di privacy.

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  • Analisi di Big Data
  • Analisi dei Big Data per la genomica

    Le organizzazioni che operano in questo settore devono gestire una quantità indescrivibile di dati generati dalle loro pipeline genomiche. Al fine di rendere più utilizzabili tali, puoi distribuire componenti AWS che supportano l'intera pipeline analitica, dall'inserimento dei dati all'analisi, fino alla visualizzazione, storage, backup e archiviazione. Ottieni la flessibilità per scegliere tra una vasta gamma di servizi database per soddisfare le tue esigenze e ottenere i risultati migliori.

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    Video dell'architettura

    In questo video dell'architettura, scopri come UC Santa Cruz analizza petabyte di dati genomici utilizzando una soluzione a basso costo con contenitori Docker e istanze Spot EC2.

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    Caso di studio del cliente

    In questo caso di studio, scopri come il Guttman lab al California Institute of Technology utilizza i cluster HPC (High Performance Computing) su AWS per ridurre il tempo per l'elaborazione genomica da settimane a giorni.

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    Caso di studio del cliente

    In questo caso di studio, scopri come GENALICE ha potuto elaborare la genomica completa di 800 pazienti in 60 minuti utilizzando i servizi di high performance compute di AWS.

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  • Set di dati
  • Utilizzo di set di dati pubblici e privati

    Con AWS puoi accedere ai tuoi set di dati privati o repository controllati quali il database NIH di genotipi e fenotipi (dbGaP) o il Cancer Genome Atlas (TCGA). Scegli il kit di strumenti che preferisci (quali GATK o Galaxy) per analizzare i dati. AWS dispone di tutti gli strumenti di cui hai bisogno per gestire i requisiti di sicurezza e conformità per l'utilizzo di questi set di dati sensibili, comprese funzionalità integrate per crittografare i dati su disco o in transito.

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    Caso di studio del cliente

    In questo caso di studio, scopri come la Icahn School of Medicine sul Monte Sinai analizza e condivide enormi set di dati genomici con collaboratori esterni mantenendo privacy e controlli di sicurezza su AWS.

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    Whitepaper

    Architecting for Genomic Data Security and Compliance in AWS

    Scopri come lavorare con set di dati con accesso controllato da dbGaP, GWAS e altri repository di ricerca genomica a livello individuale

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    Caso di studio del cliente

    In questo caso di studio, scopri come Illumina ridimensiona le enormi risorse assegnate alle tecnologie di sequenziamento del DNA con AWS. e come l'Illumina BaseSpace Sequence Hub e lo storage di 10 PB di dati genomici vengono supportati utilizzando prodotti come Amazon RedShift

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  • Collaborazione
  • Promuovere la collaborazione

    Condividi i tuoi dati con tutti i collaboratori, sia nella stanza accanto sia dall'altra parte del mondo. AWS può fornire uno spazio di lavoro centralizzato e condiviso dove tutte le parti coinvolte possono creare set di dati o scrivere algoritmi e creare strumenti, senza dover spostare fisicamente i dati avanti e indietro o temere di violare i diritti sulla proprietà intellettuale.

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    Caso di studio del cliente

    In questo caso di studio, scopri comeThermo Fish può fornire ai propri clienti una piattaforma sicura e scalabile sulla quale condurre ricerche, collaborare e migliorare il trattamento medico per i pazienti grazie all'utilizzo globale del cloud AWS.

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    Caso di studio del cliente

    In questo caso di studio, scopri come Celgene consente la collaborazione sicura tra i propri ricercatori e i laboratori di ricerca accademici utilizzando AWS e promuove il lavoro di squadra fornendo accessi isolati ai ricercatori provenienti da organizzazioni diverse.

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    Caso di studio del cliente

    In questo caso di studio, scopri come UC Santa Cruz Genomics Institute ha potuto elaborare i campioni più velocemente e ottenere risultati sicuri per i collaboratori utilizzando AWS.

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Alimentare la medicina di precisione su AWS

La medicina su misura basata su elementi soggettivi quantitativi inclusi la genomica, lo stile di vita o l'ambiente circostante sta diventando realtà grazie a nuove tecnologie come il sequenziamento genomico e i dispositivi indossabili IoT. Scopri come le iniziative di medicina di precisione stanno già prendendo forma su AWS.

Seleziona casi di studio e risorse

Consulta tutti i casi di studio dei clienti di genomica e le risorse relative

 

Caso di studio Illumina

In questo caso di studio, scopri come Illumina ridimensiona le enormi risorse assegnate alle tecnologie di sequenziamento del DNA con AWS. e come l'Illumina BaseSpace Sequence Hub e lo storage di 10 PB di dati genomici vengono supportati utilizzando prodotti come Amazon RedShift

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Caso di studio di Sequence Bio

In questo caso di studio, scopri come Sequence Bio costruisce velocemente una piattaforma sicura per scoperte di farmaci basate sui dati, su AWS.

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Caso di studio Smithsonian

In questo caso di studio, scopri come il team scientifico dello Smithsonian Institute dimensiona le istanze di calcolo AWS al bisogno, permettendo al team di annotare i genomi parallelamente al contenimento dei costi.

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Caso di studio di UC Santa Cruz

In questo caso di studio, scopri come l'UC Santa Cruz Genomics Institute ha potuto ridurre il tempo di elaborazione della genomica da 3 mesi a 4 giorni, nonché i costi generali, utilizzando i servizi di elaborazione a prestazioni elevate di AWS.

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Blog: un passo avanti nella ricerca genomica

Blog di AWS Education: AWS collabora con Broad Institute

Scopri come Cromwell, un motore esecutivo che semplifica l'orchestrazione di attività di elaborazione delle attività di elaborazione alla ricerca di analisi genomiche, ora operi sul cloud AWS.

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Blog: distribuisci Illumina DRAGEN con il nuovo Quick Start

Novità di AWS: Nuovo Quick Start per distribuire Illumina DRAGEN sul Cloud AWS.

Scopri come in circa 15 minuti, questo Quick Start distribuisce sul Cloud AWS un’analisi di lettura dinamica per GENomics Complete Suite (DRAGEN CS), una piattaforma di analisi dei dati di Illumina.

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Blog: medicina di precisione su larga scala

Blog AWS Compute: accelerare la medicina di precisione su larga scala

Scopri come Edico Genome ha sviluppato una nuova soluzione per rendere più veloci le analisi genomiche grazie ad applicazioni abilitate FPGA su AWS.

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Blog: Human Longevity, Inc.

Blog delle novità AWS: innovare la medicina con la ricerca genomica.

Scopri come Human Longevity, Inc. sta utilizzando AWS per archiviare quantità enormi di dati generati dall'impegno per rivoluzionare la medicina.

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Nozioni di base

Aziende leader del settore della genomica stanno già utilizzando AWS. Contatta i nostri esperti e comincia il tuo viaggio nel cloud AWS oggi.