Accelera le scoperte genomiche

Con AWS, i clienti che lavorano nell'ambito della genomica possono dedicare più tempo e risorse nel settore scientifico, velocizzando il tempo di raccolta di informazioni, raggiungendo più velocemente gli obiettivi di ricerca e immettendo sul mercato prodotti salvavita.

AWS consente ai clienti di innovare rendendo i dati genomici più accessibili e utili. AWS offre la gamma e l'efficacia dei servizi necessarie a ridurre il tempo tra sequenziamento e interpretazione, con capacità di collaborazione sicure e senza interruzioni tra set di dati multimodali. Inoltre, è possibile scegliere lo strumento corretto per il processo per ottenere il miglior rapporto prestazioni-costi su vasta scala e accelerare gli studi moderni sulla genomica.

Accelerate Genomic Discoveries on AWS (1:06)

100 Gb/s

di throughput di rete

Il doppio

più regioni con zone di disponibilità multiple rispetto al prossimo più grande fornitore di servizi cloud

24

regioni già avviate per supportare la sovranità dei dati

Il 90%

di risparmi potenziali rispetto ai prezzi on demand

Accelerazione

aumentata di 100 volte con le istanze F1 di Amazon EC2 rispetto alle CPU

Oltre 200

servizi completi da data center in tutto il mondo

Vantaggi

Accelera la scoperta

Opzioni di machine learning e calcolo potenti assicurano agli scienziati di poter eseguire i carichi di lavoro in modo veloce e controllato. AWS offre la più vasta selezione di servizi di calcolo, più di ogni altro provider di servizi cloud, oltre a istanze di calcolo che distribuiscono velocità effettiva di rete di 100 Gbps.

Prestazioni elevate a basso costo

I prezzi flessibili e la natura on demand del cloud computing permette ai ricercatori di affrontare progetti genomici complessi, senza dover pagare per l'infrastruttura inattiva o affrettare le operazioni per aumentare i core durante i carichi di lavoro complicati. AWS fornisce prezzi in base al consumo e capacità di calcolo praticamente illimitata.

Collaborazione sicura su vasta scala

L'impronta globale di regioni e rete AWS si applica perfettamente alla natura globale della scienza, con controlli di accesso e sicurezza che permettono ai ricercatori di genomica di gestire la condivisione dei dati. AWS è l'infrastruttura cloud globale più sicura, estesa e affidabile. Il programma AWS Open Data ospita più di 40 set di dati open source dei settori scientifico e genomico per consentire una collaborazione senza interruzioni, fornendo alle comunità di ricerca e cliniche un'unica fonte documentata di attendibilità.

Partner AWS nella genomica

AWS offre la più vasta rete di partner, oltre a una selezione flessibile del flusso di lavoro e opzioni per soluzioni completamente gestite per aiutarti a ottenere più rapidamente informazioni sulla genomica.

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Casi d'uso

  • Trasferimento e storage di dati
  • Automazione dei flussi di lavoro
  • Aggregazione dei dati
  • Analisi terziarie
  • Applicazioni cliniche
  • Set di dati open source
  • Ottimizzazione dei costi
  • Trasferimento e storage di dati
  • Trasferimento di dati e storage

    Il volume di dati genomici rappresenta una sfida per il trasferimento dei dati stessi dai sequenziatori in maniera rapida e controllata e per trovare soluzioni di archiviazione adatte a costi non proibitivi. AWS permette ai ricercatori di gestire dati su larga scala, il cui volume è superiore alle capacità delle infrastrutture on-premise. Tramite il trasferimento dei dati su AWS Cloud, le organizzazioni possono approfittare di un’acquisizione di dati con throughput elevato, di opzioni di storage economicamente vantaggiose, di accesso sicuro e di strumenti di ricerca efficaci per portare avanti la ricerca nella genomica. 

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    Referenze dei clienti

    Blog: Usare Amazon FSx for Lustre per i flussi di lavoro nell’ambito della genomica in AWS

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    Blog: Compressione, storage e accesso ai dati genomici

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    Video: Realizzazione di flussi di lavoro con dati genomici con AWS Storage Gateway

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  • Automazione dei flussi di lavoro
  • Automazione del flusso di lavoro per analisi secondarie

    Le organizzazioni del settore genomico possono scontrarsi con il problema del tracciamento delle origini dati durante l'esecuzione delle analisi secondarie e dei flussi di lavoro riproducibili e scalabili riducendo il minimo sovraccarico IT. AWS offre servizi per analisi dei dati efficaci dal punto di vista economico, scalabili e orchestrazione semplificata per l'esecuzione e l'automazione di flussi di lavoro eseguibili in parallelo. Le opzioni per l'automazione dei flussi di lavoro abilitano le applicazioni cliniche o di ricerca riproducibile, mentre le soluzioni dei partner (NVIDIA e DRAGEN) e open source (Cromwell and Nextflow) native di AWS offrono agli orchestratori dei flussi di lavoro opzioni flessibili per favorire l'analisi di dati su vasta scala. 

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    Referenze dei clienti

    Soluzioni per le analisi genomiche secondarie

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    Quick Start Nextflow su AWS

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    Utilizzo di Cromwell con AWS Batch

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    Illumina DRAGEN su AWS

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  • Aggregazione dei dati
  • Aggregazione e governance dei dati

    La buona riuscita di ricerca e interpretazione genomica dipende spesso da numerosi e diversi set di dati provenienti da vaste popolazioni. AWS permette alle organizzazioni di armonizzare set di dati multi-omic e gestire solidi controlli degli accessi e autorizzazioni in un'infrastruttura globale per mantenere l'integrità dei dati a dispetto della molteplicità di collaboratori e portatori d'interesse coinvolti nella ricerca. AWS semplifica la possibilità di archiviare, eseguire query, analizzare i dati genomici e collegarli con le informazioni cliniche. 

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    Referenze dei clienti

    Genomics Tertiary Analysis and Data Lakes Solution

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    Hail su AWS - Quick Start

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  • Analisi terziarie
  • Interpretazione e deep learning per l’analisi terziaria

    L’analisi richiede set di dati integrati e multimodali e basi di conoscenza, potenza di calcolo intensiva, tecnologia analitica dei Big data e Machine Learning su vasta scala che possono richiedere settimane o mesi, ritardando la creazione di informazioni utili. AWS accelera l’analisi dei big data della genomica grazie al Machine Learning e all’High Performance Computing (Calcolo ad Elevate Prestazioni). Grazie ad AWS, i ricercatori hanno accesso a una maggiore efficienza di elaborazione su vasta scala, elaborazione di dati riproducibili, funzionalità di integrazione dei dati per inserire set di dati multimodali e dati pubblici per annotazioni cliniche, il tutto all'interno di un ambiente idoneo alla conformità. 

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    Referenze dei clienti

    Genomics Tertiary Analysis and Data Lakes Solution

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    Analisi terziaria per la genomica e soluzioni di Machine Learning

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    Blog: Realizzazione di un pipeline di elaborazione di immagini per trascrittomica basata su immagini

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  • Applicazioni cliniche
  • Applicazioni cliniche

    Esistono diversi possibili ostacoli relativamente a scalabilità e adozione di applicazioni cliniche tra cui la velocità delle analisi, la gestione delle informazioni sanitarie protette (PHI) e la produzione di risultati interpretabili e riproducibili. Grazie alle funzionalità di AWS Cloud le organizzazioni possono stabilire una capacità differenziata in genomica per innovare le proprie applicazioni relativamente a medicina di precisione e prassi del paziente. I servizi AWS consentono l'utilizzo della genomica in ambito clinico fornendo le funzionalità di acquisizione, elaborazione e storage dei dati necessarie ad alimentare i laboratori clinici moderni, con l'obiettivo di velocizzare la produzione di risultati garantendo al contempo il rispetto alle normative più stringenti di privacy dei pazienti. 

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    Referenze dei clienti

    Processing and securing clinical genomic data

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    Improving outcomes with computational genomics

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    Genomics diagnostics and discovery at scale

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  • Set di dati open source
  • Set di dati open source

    Con l'aumento dei ricercatori che si spostano sul cloud e sviluppano flussi di lavoro nativi per il cloud portando con sé set di dati di riferimento, spesso in bucket personali, è facile che si generino duplicazioni, silos e documentazione della versione scadente dei set di dati comunemente utilizzati. AWS Open Data Program (ODP) aiuta la democratizzazione dell'accesso ai dati rendendoli disponibili per la lettura in Amazon S3, offrendo alla comunità di ricercatori una singola fonte di attendibilità documentata. Ciò aumenta la riproducibilità dello studio, promuove la collaborazione all'interno della comunità e riduce la duplicazione dei dati. L'ODP riguarda anche il costo di storage, uscita e trasferimenti tra regioni di Amazon S3 per i set di dati accettati.

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    Referenze dei clienti

    Scopri tutti i set di dati open source nell'ambito della genomica

    Scopri il set di dati »

    Dati del Broad Institute gnomAD su AWS

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    NIH STRIDES Initiative supportato da AWS

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  • Ottimizzazione dei costi
  • Ottimizzazione dei costi

    I ricercatori utilizzano grandi set di dati genomici che richiedono opzioni di storage su vasta scala ed elaborazione di calcolo potente, il che potrebbe essere molto costoso. AWS offre opportunità di risparmio dei costi per i ricercatori nel campo della genomica in tutto il ciclo di vita, dallo storage all'interpretazione. L'infrastruttura AWS e i servizi di dati permettono alle organizzazioni di risparmiare tempo, denaro e devolvere più risorse alla scienza.

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    Referenze dei clienti

    Blog: salviamo i koala grazie alla ricerca sul genoma e al cloud computing

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    Istanze Spot di Amazon EC2

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    Blog: classi di storage di Amazon S3

    Leggi il blog »

Conformità nella genomica

Grazie ad AWS, i ricercatori hanno accesso a una maggiore efficienza di elaborazione su vasta scala, elaborazione di dati riproducibili, funzionalità di integrazione dei dati per inserire set di dati multimodali e dati pubblici per annotazioni cliniche, il tutto all'interno di un ambiente idoneo alla conformità.

Ulteriori informazioni sulla conformità della genomica in AWS »

Casi di studio e risorse

Consulta tutti i casi di studio dei clienti di genomica e le risorse correlate.

Caso di studio Illumina

Caso di studio Illumina

Illumina sviluppa, costruisce e immette sul mercato sistemi integrati che analizzano i genomi. Illumina è passata alle istanze Spot di Amazon EC2 e Amazon S3 per risparmiare 300.000 USD sui costi mensili di elaborazione e 90.000 USD su quelli mensili di storage.

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Caso di studio Fred Hutch

Caso di studio sull'iniziativa di ricerca sul microbioma di Fred Hutch

Fred Hutch si focalizza sul rendere i farmaci utili a combattere il tumore più efficaci, traducendo gigabyte di set di dati genomici grezzi in informazioni utili. Grazie a Nextflow, i ricercatori orchestrano processi di AWS Batch e li analizzano con le istanze Spot di Amazon EC2, risparmiando denaro e ottenendo più tempo per l'analisi.

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DNAnexus

Caso di studio DNAnexus

DNAnexus ha sviluppato una piattaforma di gestione di dati e informatica del genoma basata sul cloud su AWS. Grazie a AWS, DNAnexus ha raggiunto una conformità e una sicurezza personalizzate con una gestione granulare dei dati per la trasparenza, la riproducibilità e la provenienza dei dati.

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Caso di studio Fabric Genomics

Caso di studio Fabric Genomics

Fabric Genomics fornisce soluzioni per analisi dei dati genomici end-to-end, annotazione, gestione, classificazione e creazione di report per usi clinici. Fabrics Genomics ha scelto di eseguire il proprio software su AWS perché offre velocità e sicurezza di calcolo ai propri clienti.

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Caso di studio Seven Bridges

Caso di studio Seven Bridges Genomics

Seven Bridges Genomics ha creato la propria piattaforma di analisi genomica su AWS, il che ha reso l'analisi più accessibile e sostenibile dal punto di vista finanziario per i ricercatori. 

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Caso di studio Baylor Medicine

Caso di studio Baylor College of Medicine

Baylor College of Medicine lavora per identificare i geni che contribuiscono all'invecchiamento e alle malattie cardiache. Baylor ha collaborato con DNAnexus su una soluzione progettata completamente su AWS, la DNAnexus PaaS, che utilizza Amazon S3 e Amazon Glacier per archiviare più di 1 PB di dati genomici di Baylor.

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Caso di studio di Bayer Crop Science

Caso di studio di Bayer Crop Science

Bayer Crop Science aiuta i clienti a determinare dove e quando piantare i prodotti che richiedono carichi di lavoro stagionali basati sul ciclo di semina. Bayer si è rivolta ad AWS per ottenere una soluzione più elastica ed efficiente dal punto di vista economico per l'esecuzione della propria piattaforma.

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Caso di studio Icahn School of Medicine

Caso di studio Icahn School of Medicine at Mount Sinai

Icahn School of Medicine sul monte Sinai e Station X hanno creato GenePool, una piattaforma software per dati genomici umani. Con AWS alla base, la piattaforma può dimensionarsi dinamicamente in pochi minuti e archiviare set di dati per clienti del settore della genomica clinica e traslazionale.

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Nozioni di base su AWS

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