クラウドでのゲノミクス

ゲノミクスの発見を加速する

AWS を使用すると、ゲノミクスのお客様はより多くの時間とリソースを科学に費やし、洞察に時間を費やし、画期的な研究を迅速に達成することで、素晴らしい製品を市場に投入できます。

AWS を使用すれば、ゲノミクスデータを便利にアクセスできるようにすることで、お客様がイノベーションを起こすことができます。AWS は、マルチモーダルデータセット全体で安全で問題のないコラボレーション機能を使用して、シーケンスと解釈にかかる時間を短縮するための幅広いサービスを提供します。さらに、仕事に適したツールを選択して、世界規模で最高のコストとパフォーマンスを実現し、ゲノミクスの最新研究を加速させることができます。

AWS でのゲノム発見の加速 (1:06)

利点

発見までの時間を短縮

強力なコンピューティングおよび機械学習オプションにより、科学者はワークロードを迅速に制御して実行することができます。AWS は、他のどのクラウドプロバイダーよりも幅広いコンピューティングサービスを提供しています。100 Gbps のネットワークスループットを提供するコンピューティングインスタンスを提供しているのは AWS だけです。

コストを低く抑えながら、高パフォーマンスを保つ

クラウドコンピューティングの柔軟な料金とオンデマンドの性質により、研究者は、急なワークロード中にコアを増やすためにアイドル状態のインフラストラクチャやスクランブルに対してお金を払うことなく、複雑なゲノムプロジェクトに取り組むことができます。AWS は、従量課金制と事実上無制限のコンピューティング容量を提供します。

世界規模での安全なコラボレーション

AWS リージョンとネットワークのグローバルフットプリントは、科学のグローバルな性質と一致し、ゲノミクス研究者がデータ共有を管理できるようにするセキュリティとアクセス制御を備えています。AWS は、最も安全で信頼できる、広範囲のグローバルクラウドインフラストラクチャです。AWS オープンデータプログラムは公開的に利用可能であり、40 以上のオープンライフサイエンスおよびゲノミクスデータセットでスムーズなコラボレーションを可能にし、文書化された単一の信頼できる情報源を研究および臨床コミュニティに提供します。

100 Gbps

ネットワーキングスループット

2 倍

他のどのクラウドプロバイダーよりも多いアベイラビリティーゾーン

24

データの所有権限をサポートするためのリージョン立ち上げ

90%

オンデマンド料金と比べた潜在的な節約額

100 倍

CPU と比較した Amazon EC2 F1 インスタンスによる加速

200+

世界中のデータセンターからのフル機能サービス

ゲノミクスの AWS パートナー

AWS は、パートナーの最大のネットワーク、柔軟なワークフローの選択、およびゲノミクスの洞察にすばやく到達できるように支援する、フルマネージド型ソリューションのオプションを提供します。

ゲノミクスの AWS パートナーの詳細 »

ゲノミクスのユースケース

  • コンテナ
  • ワークフロー管理
  • ビッグデータ分析
  • データセット
  • コラボレーション
  • コンテナ
  • ゲノミクスパイプラインのためのコンテナ

    ゲノミクスパイプラインの分散および実行を容易にするために、AWS クラウドでプロセスをカプセル化し、コンテナを実行することができます。独自のプラグアンドプレイワークフローアーキテクチャを設定し、ワークフローと研究ニーズに固有の環境を構築してください。AWS で Amazon EC2 Container Service (ECS) を使用する、または Docker を実行することによって、大きなゲノミクス問題を小さい要素に分けて解決することができ、データ出力を再現可能にし、データの共有を容易にします。

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    アーキテクチャビデオ

    このアーキテクチャビデオで、Human Longevity, Inc. が AWS で構築した強力かつ再利用可能なアプリケーションパイプラインについて学んでください。Human Longevity, Inc. が、Docker コンテナで動作するカスタム分析ツールを使って、Amazon S3 で毎日最大 12 TB の raw データを処理する方法をご覧ください。

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    アーキテクチャ図

    ゲノム分析のために AWS で Docker を利用するための、Human Longevity, Inc. からの詳細なアーキテクチャ図を検証してください

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    お客様の導入事例

    この導入事例で、Benchling 社が AWS Lambda を使って検索時間を 90% 短縮し、何百ものゲノムに拡大した方法について学んでください。 

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  • ワークフロー管理
  • ワークフロー管理

    ゲノミクスパイプラインの管理の効率化を支援するために、AWS クラウドでワークフロー管理規則を設計することができます。計算またはデータ操作のステップ一連を構成して実行し、ジョブの並列化を最適化して、終了までの時間を迅速化してください。

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    お客様の導入事例

    この導入事例で、ベイラー医科大学が DNAnexus 社と協力して、どのようにそのゲノム分析パイプラインを AWS クラウドに移動させたかについて学んでください。ベイラー医科大学が、セキュアであり、かつコンプライアンスに準拠した環境を必要とする大規模な臨床ゲノム研究を推し進めた方法をご覧ください

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    お客様の導入事例

    この導入事例で、DNAnexus 社が AWS でゲノム分析用のプラットフォームをどのように構築したかについて学んでください。AWS のインフラストラクチャ、DNAnexus 社のプラットフォーム制御、および認定されたコンプライアンスの組み合わせが、HIPAA、CAP/CLIA、GxP、およびその他プライバシー法と規制の厳しい要求を満たすことを可能にした方法をご覧ください。

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  • ビッグデータ分析
  • ゲノミクスのためのビッグデータ分析

    ゲノミクス研究組織は、そのゲノミクスパイプラインから生じるデータ津波に直面しています。このデータの実用性を高めるために、AWS コンポーネントをデプロイして、データインジェスチョンと分析から、可視化、ストレージ、ウェアハウジング、アーカイブまで、分析パイプライン全体をサポートすることができます。お客様のニーズに合わせて幅広いデータベースサービスから選択する柔軟性を獲得して、最高の成果を挙げてください。

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    アーキテクチャビデオ

    このアーキテクチャビデオで、カリフォルニア大学サンタクルーズ校が、Docker コンテナと EC2 スポットインスタンスによる低コストソリューションを使って数ペタバイト規模のゲノミクスデータを分析する方法をご覧ください。

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    お客様の導入事例

    この導入事例で、カリフォルニア工科大学のグットマン研究所が、AWS のハイパフォーマンスコンピューティング (HPC) クラスターを利用して、ゲノミクスコンピューティング時間を数週間から数日間に短縮する方法を学んでください。

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    お客様の導入事例

    この導入事例で、GENALICE 社が、AWS のハイパフォーマンスコンピューティングサービスを使って、どのように 800 人の患者の完全ゲノムを 60 分で処理することができたかについて学んでください。

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  • データセット
  • パブリックおよびプライベートのデータセットの利用

    AWS では、独自のプライベートデータセットにアクセスする、または NIH 遺伝子型・表現型データベース (dbGaP) や、がんゲノムアトラス (TCGA) などの管理されたレポジトリにアクセスすることができます。ご希望のツールセット (GATK または Galaxy など) を使用して、データを分析してください。AWS には、保管時のデータ、または転送中のデータを暗号化する組み込み機能を含め、これらの機密性の高いデータセットで作業するためのセキュリティおよびコンプライアンスの要件に対処するために必要なすべてのツールが備わっています。

    Health-Genomics_diagrams_Working-Public-Private-Data-Sets

    お客様の導入事例

    この導入事例で、マウントサイナイアイカーン医科大学が、AWS で厳重なプライバシーコントロールおよびセキュリティコントロールを維持しながら、外部共同作業者と大規模なゲノムデータセットを分析し、共有する方法について学んでください。

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    ホワイトペーパー

    AWS でゲノムデータセキュリティとコンプライアンスを構築する

    dbGaP、GWAS、およびその他個人レベルのゲノミクス研究リポジトリからのアクセスが制御されたデータセットで作業する方法について学んでください

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    お客様の導入事例

    この導入事例で、イルミナが AWS を使用して DNA シーケンシング技術を大幅にスケールする方法について学んでください。イルミナ社が、Amazon RedShift などの製品を使用して、その BaseSpace Sequence Hub をサポートし、10 ペタバイトのゲノミクスデータを保存する方法をご覧ください

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  • コラボレーション
  • コラボレーションの促進

    共同作業者が同じ建物内にいるか、地球の裏側にいるかにかかわらず、データを共有できます。AWS では、ユーザー自身と同僚が、データを物理的に動かしたり、知的財産権の侵害を心配したりすることなく、データセットの作成、アルゴリズムの記述、またはツールの作成を実行できる中心的な共有ワークスペースを提供することができます。

    Health-Genomics_diagrams_Collaboration

    お客様の導入事例

    この導入事例で、サーモフィッシャー社が、AWS クラウドをグローバルに使用することによって、研究を行い、協力し、患者のための治療法を改善するためのスケーラブルでセキュアなプラットフォームをその顧客に提供する方法について学んでください。

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    お客様の導入事例

    この導入事例で、Celgene 社が、AWS を使用して自社の研究者たちと学術研究所のセキュアなコラボレーションを実現し、異なる組織の研究者に分離されたアクセスを提供することによってチームワークを可能にした方法について学んでください。

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    お客様の導入事例

    この導入事例で、カリフォルニア大学サンタクルーズ校ゲノミクス研究所が、AWS を使用してサンプルをより迅速に処理し、共同作業者に結果をセキュアに届けることができた方法について学んでください。

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ゲノミクスのコンプライアンス

AWS を使用すれば、研究者は、大規模なコンピューティング効率の向上、再現性のあるデータ処理、マルチモーダルデータセットを取り込むためのデータ統合機能、臨床注釈用の公開データすべてに、コンプライアンス対応の環境からアクセスできます。

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導入事例およびリソースの選択

ゲノミクスのお客様の、すべての導入事例関連リソースをご覧ください

 

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Illumina の導入事例

Illumina は、ゲノムを分析するための統合システムを開発、製造、および販売しています。彼らは Amazon EC2 スポットインスタンスと Amazon S3 に切り替えて、毎月のコンピューティング費用から約 300,000 USD、毎月のストレージ費用から 90,000 USD を節約しました。

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Fred Hutch 微生物叢研究機構の導入事例

Fred Hutch は、ギガバイト単位の生ゲノムデータセットを洞察に変換することにより、治療用抗がん剤の効果を高めることに専念しています。Nextflow を使用して、研究者は AWS Batch プロセスを調整し、Amazon EC2 スポットインスタンスで分析します。これにより、コストを節約し、分析により多くの時間を割くことができます。

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DNAnexus の導入事例

DNAnexus では、AWS 上でクラウドベースのゲノム情報処理およびデータ管理用プラットフォームを開発しました。AWS を利用することで、DNAnexus に合わせたコンプライアンスとセキュリティが提供され、透明性、再現性、データの出所に関するきめ細かいデータ管理を実現しました。

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Fabric Genomics の導入事例

Fabric Genomics は、臨床用途のエンドツーエンドのゲノミクスデータの分析、注釈、キュレーション、分類、およびレポートソリューションを提供します。同社は、顧客に高速な計算速度とセキュリティを提供するために、AWS でソフトウェアを実行することを選択しました。

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Seven Bridges Genomics の導入事例

Seven Bridges Genomics は、AWS 上にゲノミクス分析プラットフォームを構築し、研究者が便利に分析を行えるようにし、さらに収益も上げています。 

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ベイラー医科大学の導入事例

ベイラー医科大学は、老化と心臓病に寄与する遺伝子を特定するために取り組んでいます。Baylor は DNAnexus と提携して、完全に AWS 上に構築されたソリューションである DNAnexus PaaS を開発しました。このソリューションは、Amazon S3 と Amazon Glacier を使用して、1 PB を超える Baylor のゲノミクスデータを保存します。

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Bayer Crop Science の導入事例

Bayer Crop Science は、植え付けサイクルに基づいて季節的な作業負荷を必要とする製品を植える場所と時期を顧客が決められるように支援します。Bayer は、プラットフォームを実行するために伸縮自在で費用対効果の高いソリューションを AWS に求めました。

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マウントサイナイアイカーン医科大学の導入事例

マウントサイナイ医科大学とステーション X は、ヒトゲノムデータソフトウェアプラットフォームである GenePool を作りました。AWS を基盤として、プラットフォームは数分で動的に拡張し、解釈や臨床ゲノミクスの顧客向けデータセットを保存することができます。


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開始方法

ゲノミクスのトップ企業はすでに AWS を使用しています。AWS の専門家にお問い合わせいただき、今すぐ AWS クラウドの導入を開始してください。