Relay Therapeutics nutzt AWS um die Arzneimittelforschung zu beschleunigen.
2020
Relay Therapeutics ist ein Präzisionsmedizin-Unternehmen, das den Prozess der Arzneimittelentdeckung durch die Nutzung einzigartiger Erkenntnisse über die Bewegung von Proteinen verändert. Bevor sie vielversprechende Verbindungen im Labor testen können, müssen die Wissenschaftler ein molekulares Universum von verfügbaren Ausgangspunkten berücksichtigen, das fast 10 Milliarden Verbindungen umfasst. Sie müssen diesen umfangreichen Satz auf die 100–200 Verbindungen filtern, die am wahrscheinlichsten an das biologische Ziel binden.
Indem sie mehr Verbindungen analysieren, erhöhen die Wissenschaftler die Wahrscheinlichkeit, dass sie die richtigen Moleküle für die Tests im Labor finden. In einem typischen On-Premises-Rechenzentrum mit Tausenden von CPUs kann die Analyse von einer Milliarde Verbindungen Monate dauern. Die Bereitstellung einer ausreichenden Anzahl von CPUs in einem On-Premises-Rechenzentrum wäre ebenfalls kostspielig, insbesondere aufgrund der „stoßweisen“ Natur der Analysen.
Das Sortieren einer Tabelle mit Milliarden von Zeilen ist keine triviale Aufgabe. Durch den Einsatz von AWS-Technologien können wir all diese Informationen effizient verarbeiten, was uns hilft, unser ultimatives Ziel zu erreichen – Medikamente schneller zu den Patienten zu bringen, als wir es bisher für möglich hielten."
Pat Walters
Senior Vice President of Computation, Relay Therapeutics
Verarbeitung von Milliarden von Molekülen in 24 Stunden
In herkömmlichen IT-Umgebungen prüfen Pharmaunternehmen in der Regel einige Millionen Wirkstoffe gleichzeitig. Relay Therapeutics war entschlossen, diese Zahl in den Milliardenbereich zu skalieren und wandte sich an Amazon Web Services (AWS), um diese Herausforderung zu lösen. „Der wichtigste Faktor bei der Entscheidung für AWS im Vergleich zu anderen Cloud-Anbietern ist die Unterstützung, die wir von Anfang an erhalten haben“, sagt Pat Walters, Senior Vice President of Computation bei Relay Therapeutics. „Und es hat uns weiterhin geholfen, unsere Prozesse effizienter zu gestalten.“
Vereinfachtes Verfahren für Wissenschaftler
Auf AWS hat das Unternehmen auch das virtuelle Screening vereinfacht, sodass Wissenschaftler Open-Source-Skripte verwenden können, um die Analyse auf AWS Batch zu starten. Die Wissenschaftler analysieren die Daten dann schnell, indem sie die Vorteile von Amazon Athena nutzen, einem Serverless-Abfrage-Service, der keine Infrastruktur zu verwalten hat.
50 % Einsparungen bei den Rechenkosten
Am Horizont: Verarbeitung von 10 Billionen Verbindungen
Seit der Bereitstellung der AWS-Hochleistungsrechenlösung hat Relay Therapeutics mehrere Screenings mit fünf Milliarden Substanzen durchgeführt. Aufgrund der Skalierbarkeit von AWS können die Wissenschaftler die Bildschirme auf mehreren Schnappschüssen desselben beweglichen Proteintargets ausführen.
Das Unmögliche möglich machen
Über Relay Therapeutics
Vorteile von AWS
- Analysiert 5 Milliarden molekulare Verbindungen in 1 Tag im Vergleich zu Monaten
- Reduziert die Kosten für Rechenressourcen um 50 %.
- Ermöglicht Wissenschaftlern die einfache Durchführung komplexer Analysen
- Validiert Analyseparameter, um Cloud-Kostenüberschreitungen zu vermeiden
- Skaliert die Rechenressourcen nach Bedarf für jeden Analyseauftrag
Genutzte AWS-Services
AWS Batch
AWS Batch ermöglicht es Entwicklern, Wissenschaftlern und Ingenieuren, mit AWS einfach und effizient unzählige Batchdatenverarbeitungsaufträge durchzuführen.
Amazon Athena
Amazon Athena ist ein interaktiver Abfrageservice, der die Analyse von Daten in Amazon S3 mit Standard-SQL erleichtert.
Amazon EC2-Spot-Instances
Mit Amazon EC2 Spot-Instances können Sie die Vorteile nicht genutzter EC2-Kapazitäten in der AWS Cloud nutzen. Spot-Instances sind mit einem Rabatt von bis zu 90 % im Vergleich zum On-Demand-Preis verfügbar.
Erste Schritte
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