FPGA 기반 F1 인스턴스를 사용하여 전체 게놈 배열 프로세스의 속도를 대폭 끌어올릴 수 있었습니다. 그 결과, 20시간의 컴퓨팅 시간이 걸렸던 작업을 이제는 단 3시간 만에 처리할 수 있습니다.
Professor Dr. Torsten Haferlach Chief Executive Officer, Munich Leukemia Lab

Munich Leukemia Lab(MLL)은 백혈병과 림프종의 치료법 발견을 목표로 하는 진단 및 연구 기관입니다. MLL은 최첨단 분자 및 IT 지원 방법을 사용하여 혈액 진단 및 치료의 미래를 구현합니다. MLL은 AWS를 사용하여 환자의 게놈 데이터 처리 시간을 20시간에서 3시간으로 단축함으로써 연구를 가속화하고 백혈병 진단을 개선하는 데 도움을 주고 있습니다.

MLL이 높은 스루풋의 차세대 시퀀싱(NGS) 기법을 사용하면서 이 조직의 컴퓨팅 및 스토리지 요구 사항이 크게 증가했고, 결국 MLL 로컬 인프라의 용량을 초과하게 되었습니다. MLL은 엄격한 데이터 보안 기준을 지키면서 날로 높아지는 확장 가능한 컴퓨팅 및 스토리지 요구 사항을 해결하기 위해 Amazon Web Services(AWS)로 눈을 돌렸고, AWS 프랑크푸르트 리전에 Illumina의 BaseSpace 솔루션을 배포했습니다. MLL은 Amazon Elastic Compute Cloud(Amazon EC2) FPGA 기반 F1 인스턴스를 사용하여 유전체학 데이터 처리를 가속화하고, Amazon Simple Storage Service(S3)를 사용하여 비용 효율적인 데이터 스토리지를 제공합니다. 2018년부터 MLL이 4,200개 이상의 환자 게놈을 분석해오는 과정에서 2.4페타바이트가 넘는 데이터가 생성되었습니다. 이제 MLL은 유전체 분석을 가속화하고 진단 정확도를 개선하기 위해 병렬화, 자동화 및 기계 학습 기술을 추가하려고 합니다.

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