我们已经能够使用基于 FPGA 的 F1 实例大大加快整个基因组测序的过程。因此,过去需要 20 个小时的计算时间才能完成的任务现在仅需 3 个小时即可完成。
Professor Dr. Torsten Haferlach Chief Executive Officer, Munich Leukemia Lab

慕尼黑白血病实验室(MLL)是一家诊断和研究机构,其任务是寻找治疗白血病和淋巴瘤的方法。MLL 使用最新的分子和 IT 支持的方法来塑造血液学诊断和治疗的未来。通过使用 AWS,MLL 将处理患者基因组数据的周转时间从 20 小时缩短到 3 小时,从而有助于加速研究并改善白血病的诊断。

MLL 使用高吞吐量下一代测序(NGS)导致该组织的计算和存储需求大幅增加,超过了 MLL 本地基础设施的容量。为了满足其对于可扩展计算和存储功能不断增长的需求,同时以高标准维护数据安全,MLL 转而选择 Amazon Web Services(AWS),并部署 AWS 法兰克福区域提供的 Illumina BaseSpace 解决方案。MLL 使用 Amazon Elastic Compute Cloud(Amazon EC2)基于 FPGA 的 F1 实例来加速基因组学数据处理,以及使用 Amazon Simple Storage Service(Amazon S3)来经济高效地存储数据。自 2018 年以来,MLL 对 4200 多名患者进行了基因组分析,产生的数据超过 2.4 PB。MLL 正在致力于增加并行化、自动化和机器学习,以加快基因组分析并提高诊断准确性。

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