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2021
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A solução de processamento de dados genômicos da AstraZeneca executa 51 bilhões de testes por dia na AWS

Usando a AWS, a empresa biofarmacêutica AstraZeneca construiu uma solução escalável, eficiente e baseada na nuvem capaz de processar rapidamente dados de sequenciamento genômico.

Oferece suporte para execução

mais de 51 bilhões de testes estatísticos em menos de 24 horas

Entrega facilitada

de insights genômicos para mais de 40 projetos de descoberta de medicamentos em 2020

Aumenta ou diminui a escala na vertical

para acomodar as demandas erráticas de sequenciamento genômico

Libera recursos

para exploração científica

Visão geral

Cerca de 20 anos após a publicação do primeiro genoma humano, a genômica está em transição de uma prática que exige muita pesquisa para um propulsor para a medicina personalizada. Comprometida com essa transição, a empresa biofarmacêutica global AstraZeneca está acelerando o uso de genômica na medicina de precisão e promovendo a tradução de genômica para transformar as descobertas de medicamentos.

A AstraZeneca usa petabytes de dados de sequenciamento genômico para informar pesquisas e desenvolvimento de medicamentos. Para processar dados em escala rapidamente, a AstraZeneca usou a Amazon Web Services (AWS) para criar uma solução rápida e eficaz para extrair insights genômicos impactantes.

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“Nós fornecemos informações genéticas para mais de 40 projetos de descoberta de medicamentos da AstraZeneca em 2020 com esses recursos.”

Slavé Petrovski
Vice-presidente, diretor de análise de genoma e informática, Centro de Pesquisa Genômica, P&D da AstraZeneca

Oportunidade | Criando uma solução que permite inovações por parte dos cientistas

Além de obter insights de dados genômicos rapidamente, a AstraZeneca queria realocar recursos para a exploração científica e evitar desperdiçar o tempo da bioinformática realizando atividades de gerenciamento de dados de valor relativamente baixo. Como a empresa coleta petabytes de dados por meio de múltiplas fontes em grandes picos, ela precisava de uma capacidade de computação avançada e escalável.

Com histórico prévio de criação na AWS, a AstraZeneca decidiu expandir seu uso de ferramentas da AWS para desenvolver uma solução de bioinformática baseada em nuvem para análise e processamento genômicos rápidos.

Solução | Automatizar na AWS para produzir insights rápidos

A solução de alto throughput da AstraZeneca realiza muitas etapas de processamento e análise de dados genômicos. A análise genômica secundária olha para leituras de sequenciamento brutas para reconstruir um genoma e identificar variantes genômicas que podem ser analisadas mais a fundo em estágios posteriores. Para automatizar a orquestração de dados dessas etapas, a arquitetura usa o AWS Lambda, um serviço de computação com tecnologia sem servidor que permite que os usuários executem códigos sem servidores de provisionamento ou gerenciamento. Para criar uma camada de execução de tarefas, a arquitetura usa o AWS Batch, que provisiona dinamicamente a quantidade e o tipo de recursos computacionais ideais, como instâncias otimizadas para CPU ou memória, com base nos requisitos de volume e recursos específicos das tarefas em lote enviadas. Pelo caminho, a arquitetura classifica os dados em buckets usando o Amazon Simple Storage Service (Amazon S3), um serviço de armazenamento de objetos.

Na AWS, a AstraZeneca acelerou e melhorou a produtividade com escala, poder computacional e acesso a serviços de tecnologia avançada. Como a empresa consegue executar análises em escala quando necessário, os dados ficam disponíveis para serem analisados mais cedo. “Agora podemos realizar mais de 51 bilhões de testes estatísticos em menos de 24 horas, estudando os efeitos de mutações ou genes individuais, cada um com uma ampla variedade de fenótipos”, afirma Slavé Petrovski, vice-presidente, diretor de análise de genoma e informática no Centro de Pesquisa Genômica da AstraZeneca. Os esforços da empresa estão sendo compensados “Fornecemos informações genéticas para mais de 40 projetos de descoberta de medicamentos da AstraZeneca em 2020 com esses recursos”, diz Petrovski.

Resultado | Como impulsionar a inovação científica

A AstraZeneca produziu uma pipeline de bioinformática genômica rápida e eficiente que dá aos cientistas o tempo e os recursos para que busquem a inovação. Como resultado, o Centro de Pesquisa Genômica da empresa está avançando em seu objetivo de analisar dois milhões de genomas até 2026.

Sobre a AstraZeneca

A AstraZeneca é uma empresa biofarmacêutica global que desenvolve medicamentos inovadores em diversas áreas terapêuticas. O Centro de Pesquisa Genômica é uma iniciativa da AstraZeneca que busca analisar dois milhões de genomas até 2026.

Produtos da AWS usados

AWS Lambda

O AWS Lambda é um serviço de computação sem servidor que permite executar código sem provisionar ou gerenciar servidores, criando lógica de escalabilidade de cluster com reconhecimento de workloads, mantendo integrações de eventos ou gerenciando tempos de execução.

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AWS Batch

O AWS Batch possibilita que desenvolvedores, cientistas e engenheiros executem de modo fácil e eficiente centenas de milhares de tarefas de computação em lote na AWS.

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Amazon S3

O Amazon Simple Storage Service (Amazon S3) é um serviço de armazenamento de objetos que oferece escalabilidade, disponibilidade de dados, segurança e performance líder do setor.

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