เอกสารประกอบ

บทแนะนำสอนการใช้งาน

  • เวิร์กช็อป HealthOmics แบบครบวงจร

    เริ่มต้นใช้งานเวิร์กโฟลว์และการจัดเก็บของ HealthOmics

  • บทช่วยสอน HealthOmics

    ที่เก็บข้อมูลโอเพ่นซอร์สบน GitHub พร้อมโค้ดตัวอย่างที่แสดงให้เห็นถึงวิธีการจัดเก็บ ประมวลผล และสืบค้นชุดข้อมูลจีโนมและชีวภาพโดยใช้ AWS HealthOmics

เครื่องมือ

เครื่องมือเวิร์กโฟลว์

เวิร์กโฟลว์การค้นพบยา

ใช้คอลเลกชั่นของเวิร์กโฟลว์ของ AWS HealthOmics นี้เพื่อเร่งการค้นพบยา

ตัวอย่างเวิร์กโฟลว์

สร้างเวิร์กโฟลว์ส่วนตัวตามตัวอย่างเวิร์กโฟลว์โอเพ่นซอร์ส HealthOmics

Run Analyzer

Run Analyzer เป็นเครื่องมือเพิ่มประสิทธิภาพการทำงานที่ดึงข้อมูลบันทึก Manifest จาก CloudWatch และสร้างสถิติสำหรับการเรียกใช้ รวมถึงการใช้ CPU และหน่วยความจำสำหรับงานเวิร์กโฟลว์แต่ละงาน

WDL Linter

ใช้ HealthOmics WDL linter เพื่อตรวจจับข้อผิดพลาดของเวิร์กโฟลว์ทั่วไปก่อนที่จะเรียกใช้เวิร์กโฟลว์

Nextflow Linter

Lint สำหรับข้อผิดพลาด Nextflow ทั่วไปก่อนที่จะเรียกใช้สคริปต์เวิร์กโฟลว์

ECR Helper

ย้ายคอนเทนเนอร์ที่มีอยู่ไปยังที่เก็บ ECR ส่วนตัวของคุณโดยใช้เครื่องมือ ECR Helper

Re-run Tool

Re-run เก็บถาวรข้อมูลบันทึก Manifest CloudWatch

เครื่องมือพื้นที่เก็บข้อมูล

อ่านชุดตัวจัดการการถ่ายโอน

ดาวน์โหลดไฟล์จากชุดอ้างอิงหรืออ่านของ AWS HealthOmics ได้อย่างง่ายดาย

ตัวนำเข้าที่ขับเคลื่อนด้วยเหตุการณ์

แอป CDK สาธิตสถาปัตยกรรมที่ขับเคลื่อนด้วยเหตุการณ์ที่นำเข้าข้อมูลลงในที่เก็บลำดับ AWS HealthOmics โดยอัตโนมัติเมื่อวัตถุถูกสร้างขึ้นใน Amazon S3

ตัวสร้างการจัดเก็บ Manifest ตามลำดับ

สร้าง Manifest json สำหรับงานนำเข้าการจัดเก็บ AWS HealthOmics ตามลำดับ

ค้นหาชุดการอ่านซ้ำที่ซ้ำกันของการจัดเก็บตามลำดับ

ระบุชุดการอ่านที่ซ้ำกันที่เก็บไว้ในการจัดเก็บ AWS HelathOmics ตามลำดับ

โซลูชัน

มีอะไรใหม่

ตอนนี้ AWS HealthOmics รองรับการตรวจจับเวอร์ชัน DSL และ Nextflow แล้ว
08/13/24

ตอนนี้ AWS HealthOmics รองรับพื้นที่เก็บข้อมูลแบบไดนามิกสำหรับเวิร์กโฟลว์ส่วนตัวแล้ว
30/04/24

ตอนนี้ AWS HealthOmics รองรับการแชร์ข้ามบัญชีสำหรับเวิร์กโฟลว์ส่วนตัวแล้ว
04/30/24

AWS HealthOmics ประกาศการสนับสนุนสำหรับการจัดเก็บลำดับการอ่านผ่าน Amazon S3 API
04/15/24

ตอนนี้ AWS HealthOmics มีข้อมูลเพิ่มเติมสำหรับการทำงานของเวิร์กโฟลว์แล้ว
23/02/24

ตอนนี้ AWS HealthOmics รองรับเวิร์กโฟลว์ Ultima Genomics DeepVariant Ready2Run แล้ว
05/02/24

ขณะนี้การจัดเก็บลำดับ AWS HealthOmics มี ETag ที่คำนวณอัตโนมัติสำหรับชุดการอ่านแล้ว
06/10/23

AWS HealthOmics มีให้บริการแล้วในภูมิภาคอิสราเอล (เทลอาวีฟ)
26/09/23

ขณะนี้ AWS HealthOmics มีเวิร์กโฟลว์สำหรับการจัดเก็บถาวรและการเก็บรักษาข้อมูลแล้ว
30/08/23

ขณะนี้ AWS HealthOmics รองรับการกำหนดเวอร์ชันของการจัดเก็บคำอธิบายประกอบแล้ว
15/08/23

AWS HealthOmics รองรับการแชร์ข้ามบัญชีของการจัดเก็บการวิเคราะห์ข้อมูลโอมิกส์
15/08/23

โพสต์ในบล็อก

ปฏิวัติชีววิทยาเชิงกำเนิดด้วย AWS และ EvolutionaryScale
06/25/2024

Takeda Pharmaceuticals ช่วยเร่งสารสนเทศทางชีวภาพขนาดใหญ่ด้วย AWS HealthOmics ได้อย่างไร
06/19/2024

ปลดล็อกข้อมูลเชิงลึกเกี่ยวกับจีโนมที่มีประสิทธิภาพด้วย AWS HealthOmics Analytics และ Amazon EMR
05/30/2024

การควบคุมระบบเวิร์กโฟลว์ AWS HealthOmics หลายรายการตามขนาด
05/07/24

ทำให้การวิเคราะห์ข้อมูลโอมิกส์เพื่อทุกคนด้วย Basepair บน AWS HealthOmics
04/29/2024

AWS HealthOmics ประกาศความสามารถใหม่สำหรับการบูรณาการที่เก็บข้อมูลและเครื่องมือวิเคราะห์ข้อมูลโอมิกส์อย่างราบรื่น
04/17/2024

จัดเก็บข้อมูลโอมิกส์อย่างคุ้มค่าได้ในทุกขนาดด้วย AWS HealthOmics
24/01/24

การประมวลผลข้อมูล fMRI บน AWS โดยใช้ AFNI และ AWS HealthOmics
08/01/24

เครื่องมือใหม่เพื่อเร่งการย้ายเวิร์กโฟลว์ไปยัง AWS HealthOmics
13/12/23

การวิเคราะห์ข้อมูลหลายรูปแบบด้วย AWS Health และบริการแมชชีนเลิร์นนิง
16/10/23

การออกแบบสถาปัตยกรรมที่ขับเคลื่อนด้วยเหตุการณ์สำหรับเวิร์กโฟลว์ชีวสารสนเทศโดยใช้ AWS HealthOmics และ Amazon EventBridge
11/10/23

รักษาความปลอดภัยของเวิร์กโฟลว์และข้อมูลจีโนมของคุณด้วย AWS HealthOmics
10/09/23

วิดีโอ


การเอาชนะความท้าทายทางวิทยาศาสตร์และไอทีที่เกี่ยวข้องกับการวิเคราะห์สเกลโอมิกส์ (22:11)


ปฏิวัติการแพทย์ที่มีความแม่นยำ: Sonrai ใช้ AWS ในการค้นพบยา (3:03)


AWS re:Invent 2023 - นวัตกรรมโอมิกส์กับ AWS HealthOmics: เส้นทางสู่ผลลัพธ์ที่เร็วขึ้นของ Amgen


AWS re:Invent 2023 - การสร้างแพลตฟอร์มการแพทย์ที่แม่นยำโดยใช้ AWS HealthOmics


AWS HealthOmics การประชุมเชิงปฏิบัติการแบบครบวงจร - การนำเสนอ (43:27)


AWS On Air ft. AWS HealthOmics และข้อมูลเปิด (20:07)


การใช้ AWS HealthOmics สำหรับจีโนมแบบครบวงจร (2:03:06)


AWS On Air ft. เวิร์กโฟลว์ Ready2Run บน AWS HealthOmics (26:34)