ทรัพยากรของ AWS HealthOmics
เอกสารประกอบ
-
คู่มือผู้ใช้
เรียนรู้วิธีใช้ AWS HealthOmics ในคู่มือนักพัฒนาแบบทีละขั้นตอนนี้
-
ข้อมูลอ้างอิง API
อ่านคู่มืออ้างอิงนี้สำหรับ AWS HealthOmics API และพารามิเตอร์
บทแนะนำสอนการใช้งาน
-
เวิร์กช็อป HealthOmics แบบครบวงจร
เริ่มต้นใช้งานเวิร์กโฟลว์และการจัดเก็บของ HealthOmics
-
บทช่วยสอน HealthOmics
ที่เก็บข้อมูลโอเพ่นซอร์สบน GitHub พร้อมโค้ดตัวอย่างที่แสดงให้เห็นถึงวิธีการจัดเก็บ ประมวลผล และสืบค้นชุดข้อมูลจีโนมและชีวภาพโดยใช้ AWS HealthOmics
เครื่องมือ
เครื่องมือเวิร์กโฟลว์
เวิร์กโฟลว์การค้นพบยา
ใช้คอลเลกชั่นของเวิร์กโฟลว์ของ AWS HealthOmics นี้เพื่อเร่งการค้นพบยา
ตัวอย่างเวิร์กโฟลว์
สร้างเวิร์กโฟลว์ส่วนตัวตามตัวอย่างเวิร์กโฟลว์โอเพ่นซอร์ส HealthOmics
Run Analyzer
Run Analyzer เป็นเครื่องมือเพิ่มประสิทธิภาพการทำงานที่ดึงข้อมูลบันทึก Manifest จาก CloudWatch และสร้างสถิติสำหรับการเรียกใช้ รวมถึงการใช้ CPU และหน่วยความจำสำหรับงานเวิร์กโฟลว์แต่ละงาน
WDL Linter
ใช้ HealthOmics WDL linter เพื่อตรวจจับข้อผิดพลาดของเวิร์กโฟลว์ทั่วไปก่อนที่จะเรียกใช้เวิร์กโฟลว์
Nextflow Linter
Lint สำหรับข้อผิดพลาด Nextflow ทั่วไปก่อนที่จะเรียกใช้สคริปต์เวิร์กโฟลว์
ECR Helper
ย้ายคอนเทนเนอร์ที่มีอยู่ไปยังที่เก็บ ECR ส่วนตัวของคุณโดยใช้เครื่องมือ ECR Helper
เครื่องมือพื้นที่เก็บข้อมูล
อ่านชุดตัวจัดการการถ่ายโอน
ดาวน์โหลดไฟล์จากชุดอ้างอิงหรืออ่านของ AWS HealthOmics ได้อย่างง่ายดาย
ตัวนำเข้าที่ขับเคลื่อนด้วยเหตุการณ์
แอป CDK สาธิตสถาปัตยกรรมที่ขับเคลื่อนด้วยเหตุการณ์ที่นำเข้าข้อมูลลงในที่เก็บลำดับ AWS HealthOmics โดยอัตโนมัติเมื่อวัตถุถูกสร้างขึ้นใน Amazon S3
ตัวสร้างการจัดเก็บ Manifest ตามลำดับ
สร้าง Manifest json สำหรับงานนำเข้าการจัดเก็บ AWS HealthOmics ตามลำดับ
ค้นหาชุดการอ่านซ้ำที่ซ้ำกันของการจัดเก็บตามลำดับ
ระบุชุดการอ่านที่ซ้ำกันที่เก็บไว้ในการจัดเก็บ AWS HelathOmics ตามลำดับ
โซลูชัน
-
คำแนะนำสำหรับตาข่ายข้อมูลห้องปฏิบัติการบน AWS
คำแนะนำนี้แสดงให้เห็นถึงวิธีการสร้างระบบการจัดการข้อมูลทางวิทยาศาสตร์ที่รวมทั้งข้อมูลเครื่องมือในห้องปฏิบัติการและระบบซอฟต์แวร์ เช่น สมุดบันทึกห้องปฏิบัติการอิเล็กทรอนิกส์ (ELNs) และระบบการจัดการข้อมูลห้องปฏิบัติการ (LIMS) กับ HealthOmics
-
คำแนะนำสำหรับห้องปฏิบัติการที่เชื่อมต่อแบบดิจิทัลบน AWS
คำแนะนำนี้ช่วยให้คุณเชื่อมต่อเครื่องมือข้อมูลวิทยาศาสตร์ชีวภาพและไฟล์ระบบห้องปฏิบัติการเข้ากับ AWS Cloud ไม่ว่าจะผ่านทางอินเทอร์เน็ตหรือการเชื่อมต่อโดยตรงด้วยเวลาแฝงต่ำ
-
คำแนะนำสำหรับการย้ายและการจัดเก็บข้อมูลลำดับด้วย AWS HealthOmics
คำแนะนำนี้แสดงให้เห็นถึงวิธีการนำเข้าข้อมูลลำดับโอมิกส์จาก Amazon Simple Storage Service (Amazon S3) ไปยังที่เก็บข้อมูล AWS HealthOmics
-
คำแนะนำสำหรับการวิเคราะห์ข้อมูลหลายรูปแบบด้วยบริการ AWS Health และ ML บน AWS
คำแนะนำนี้จะสาธิตวิธีการตั้งค่าเฟรมเวิร์กแบบครบวงจรเพื่อวิเคราะห์ข้อมูลด้านการดูแลสุขภาพและวิทยาศาสตร์ชีวภาพ (HCLS) หลายรูปแบบ
-
คำแนะนำสำหรับเวิร์กโฟลว์ชีวสารสนเทศบน AWS
คำแนะนำนี้แสดงให้เห็นว่าคุณสามารถสร้างและเรียกใช้เวิร์กโฟลว์ชีวสารสนเทศระดับการผลิตได้ตามขนาดที่ต้องการ และใช้บริการ AWS สำหรับระบบอัตโนมัติ การวิเคราะห์เวิร์กโฟลว์ การจัดเก็บ และการสังเกตการดำเนินงานและข้อมูลการสังเกต
-
คำแนะนำสำหรับการวิเคราะห์ข้อมูลหลายรูปแบบด้วยบริการ AWS Health และ ML บน AWS
คำแนะนำนี้จะสาธิตวิธีการตั้งค่าเฟรมเวิร์กแบบครบวงจรเพื่อวิเคราะห์ข้อมูลด้านการดูแลสุขภาพและวิทยาศาสตร์ชีวภาพ (HCLS) หลายรูปแบบ
มีอะไรใหม่
ตอนนี้ AWS HealthOmics รองรับการตรวจจับเวอร์ชัน DSL และ Nextflow แล้ว
08/13/24
ตอนนี้ AWS HealthOmics รองรับพื้นที่เก็บข้อมูลแบบไดนามิกสำหรับเวิร์กโฟลว์ส่วนตัวแล้ว
30/04/24
ตอนนี้ AWS HealthOmics รองรับการแชร์ข้ามบัญชีสำหรับเวิร์กโฟลว์ส่วนตัวแล้ว
04/30/24
AWS HealthOmics ประกาศการสนับสนุนสำหรับการจัดเก็บลำดับการอ่านผ่าน Amazon S3 API
04/15/24
ตอนนี้ AWS HealthOmics มีข้อมูลเพิ่มเติมสำหรับการทำงานของเวิร์กโฟลว์แล้ว
23/02/24
ตอนนี้ AWS HealthOmics รองรับเวิร์กโฟลว์ Ultima Genomics DeepVariant Ready2Run แล้ว
05/02/24
ขณะนี้การจัดเก็บลำดับ AWS HealthOmics มี ETag ที่คำนวณอัตโนมัติสำหรับชุดการอ่านแล้ว
06/10/23
AWS HealthOmics มีให้บริการแล้วในภูมิภาคอิสราเอล (เทลอาวีฟ)
26/09/23
ขณะนี้ AWS HealthOmics มีเวิร์กโฟลว์สำหรับการจัดเก็บถาวรและการเก็บรักษาข้อมูลแล้ว
30/08/23
ขณะนี้ AWS HealthOmics รองรับการกำหนดเวอร์ชันของการจัดเก็บคำอธิบายประกอบแล้ว
15/08/23
AWS HealthOmics รองรับการแชร์ข้ามบัญชีของการจัดเก็บการวิเคราะห์ข้อมูลโอมิกส์
15/08/23
โพสต์ในบล็อก
ปฏิวัติชีววิทยาเชิงกำเนิดด้วย AWS และ EvolutionaryScale
06/25/2024
Takeda Pharmaceuticals ช่วยเร่งสารสนเทศทางชีวภาพขนาดใหญ่ด้วย AWS HealthOmics ได้อย่างไร
06/19/2024
ปลดล็อกข้อมูลเชิงลึกเกี่ยวกับจีโนมที่มีประสิทธิภาพด้วย AWS HealthOmics Analytics และ Amazon EMR
05/30/2024
การควบคุมระบบเวิร์กโฟลว์ AWS HealthOmics หลายรายการตามขนาด
05/07/24
ทำให้การวิเคราะห์ข้อมูลโอมิกส์เพื่อทุกคนด้วย Basepair บน AWS HealthOmics
04/29/2024
จัดเก็บข้อมูลโอมิกส์อย่างคุ้มค่าได้ในทุกขนาดด้วย AWS HealthOmics
24/01/24
การประมวลผลข้อมูล fMRI บน AWS โดยใช้ AFNI และ AWS HealthOmics
08/01/24
เครื่องมือใหม่เพื่อเร่งการย้ายเวิร์กโฟลว์ไปยัง AWS HealthOmics
13/12/23
การวิเคราะห์ข้อมูลหลายรูปแบบด้วย AWS Health และบริการแมชชีนเลิร์นนิง
16/10/23
รักษาความปลอดภัยของเวิร์กโฟลว์และข้อมูลจีโนมของคุณด้วย AWS HealthOmics
10/09/23
วิดีโอ
การเอาชนะความท้าทายทางวิทยาศาสตร์และไอทีที่เกี่ยวข้องกับการวิเคราะห์สเกลโอมิกส์ (22:11)
ปฏิวัติการแพทย์ที่มีความแม่นยำ: Sonrai ใช้ AWS ในการค้นพบยา (3:03)
AWS re:Invent 2023 - นวัตกรรมโอมิกส์กับ AWS HealthOmics: เส้นทางสู่ผลลัพธ์ที่เร็วขึ้นของ Amgen
AWS re:Invent 2023 - การสร้างแพลตฟอร์มการแพทย์ที่แม่นยำโดยใช้ AWS HealthOmics
AWS HealthOmics การประชุมเชิงปฏิบัติการแบบครบวงจร - การนำเสนอ (43:27)
AWS On Air ft. AWS HealthOmics และข้อมูลเปิด (20:07)
การใช้ AWS HealthOmics สำหรับจีโนมแบบครบวงจร (2:03:06)
AWS On Air ft. เวิร์กโฟลว์ Ready2Run บน AWS HealthOmics (26:34)