La solution génomique de Biogen utilise AWS pour faire progresser la recherche sur les maladies neurologiques
2020
Défi du secteur
Pour identifier de nouvelles thérapies potentielles, trouver de nouvelles cibles génétiques et mieux comprendre la biologie des maladies neurologiques, les chercheurs ont besoin d'un moyen efficace d'analyser plus de 1 Po de données de la UK Biobank (une étude à long terme de 500 000 personnes sur 30 ans).
Comme tous les groupes utilisaient déjà l'infrastructure AWS, il a été très facile de déplacer les données via un compartiment vers chaque groupe qui disposait d'un cloud privé virtuel Amazon pour utiliser les données. »
David Sexton
Directeur de la technologie et de l'informatique du génome chez Biogen
Solution Biogen
Afin d'analyser l'énorme quantité de données de la UK Biobank, allant du séquençage de l'exome (les régions des gènes codant les protéines) aux biomarqueurs plasmatiques et aux informations biographiques, l'entreprise Biogen savait qu'elle « devait disposer d'une solution informatique adaptée au traitement de données à cette échelle », explique David Sexton, directeur principal de la technologie et de l'informatique du génome. À la recherche d'une solution axée sur le cloud, Biogen s'est associée à Databricks, un partenaire technologique avancé d'Amazon Web Services (AWS) du réseau de partenaires AWS (APN) et un partenaire AWS disposant de la compétence Sciences de la vie pour concevoir une pile de solutions logicielles qui exploite AWS pour analyser les données de manière efficace et sécurisée. Amazon Elastic Compute Cloud (Amazon EC2) fournit la structure de base pour l'analyse des données et le maintien de la pile dans le cloud AWS ;Amazon Simple Storage Service (Amazon S3) fournit une solution de stockage évolutive pour les pétaoctets en constante augmentation du projet et Amazon Virtual Private Cloud (Amazon VPC) fournit une sécurité renforcée.
Avantages d'AWS
L'architecture AWS de Biogen lui a permis de travailler sans effort avec des partenaires pour analyser les données. « Comme tous les groupes utilisaient déjà l'infrastructure AWS », explique M. Sexton, « il a été très facile de déplacer les données via un compartiment vers chaque groupe qui disposait d'un cloud privé virtuel Amazon pour utiliser les données. » Grâce aux informations tirées des données traitées par sa pile AWS, Biogen a pu repositionner son éventail de médicaments sur la base de données génomiques, identifier de nouvelles cibles médicamenteuses et découvrir d'importantes informations sur la base biologique des maladies neurodégénératives comme les maladies d'Alzheimer et de Parkinson.
À propos de Biogen
Biogen est une entreprise de sciences de la vie qui se consacre à l'éradication des maladies neurologiques. Depuis 1978, elle fait œuvre de pionnière dans le domaine des neurosciences et de la biotechnologie. Son portefeuille comprend actuellement 60 traitements cibles pour huit maladies.
À propos de Databricks
Databricks, un partenaire technologique AWS avancé dans l'APN et un partenaire AWS disposant de compétences Science de la vie offre une plateforme d'analyse de données unifiée qui permet aux équipes de données de collaborer avec des outils d'ingénierie et de science des données pour accélérer l'innovation axée sur les données. Databricks propose également une suite de solutions génomiques qui permettent le traitement et l'analyse interactifs des données génomiques à grande échelle.
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