Tài liệu

Hướng dẫn

Công cụ

Công cụ quy trình làm việc

Quy trình khám phá thuốc

Sử dụng bộ sưu tập quy trình làm việc AWS HealthOmics này để tăng tốc độ khám phá thuốc

Ví dụ về quy trình làm việc

Xây dựng quy trình công việc riêng dựa trên các ví dụ về quy trình làm việc nguồn mở của HealthOmics

Trình phân tích lần chạy

Trình phân tích lần chạy là một công cụ tối ưu hóa hiệu năng lần chạy, có khả năng truy xuất bản ghi bản kê khai lần chạy từ CloudWatch và tạo số liệu thống kê cho một lần chạy, bao gồm việc sử dụng CPU và bộ nhớ cho mỗi tác vụ trong quy trình làm việc

WDL Linter

Sử dụng WDL Linter của HealthOmics để phát hiện các lỗi phổ biến trong quy trình làm việc trước khi chạy quy trình làm việc

Nextflow Linter

Rà soát các lỗi Nextflow phổ biến trước khi chạy tập lệnh quy trình làm việc

ECR Helper

Di chuyển các bộ chứa hiện có sang kho lưu trữ ECR riêng của bạn bằng công cụ ECR Helper

Công cụ chạy lại

Chạy lại các lần chạy đã lưu trữ từ bản ghi bản kê khai lần chạy CloudWatch

Công cụ lưu trữ dữ liệu

Trình quản lý truyền tập phục vụ việc đọc

Dễ dàng tải xuống tệp từ tài liệu tham khảo hoặc tập phục vụ việc đọc trong AWS HealthOmics

Trình nhập dựa trên sự kiện

Ứng dụng CDK mang kiến trúc dựa trên sự kiện, có khả năng tự động hóa việc nhập dữ liệu vào kho trình tự của AWS HealthOmics khi các đối tượng được tạo trong Amazon S3.

Trình tạo bản kê khai kho trình tự

Tạo bản kê khai json cho các tác vụ nhập kho trình tự AWS HealthOmics

Trình tìm tập phục vụ việc đọc trùng lặp trong kho trình tự

Xác định các tập phục vụ việc đọc trùng lặp được lưu trữ trong kho trình tự AWS HealthOmics

Giải pháp

Bài đăng trên blog

Tăng tốc độ tìm kiếm thuốc với AWS HealthOmics và NVIDIA Blueprints
07/10/2024

Xây dựng bàn làm việc tin sinh học bảo mật và cần ít mã trên AWS HealthOmics
10/02/2024

Tạo bước đột phá trong Sinh học tạo sinh với AWS và EvolutionaryScale
25/06/2024

Cách Takeda Pharmaceuticals tăng tốc phát triển tin sinh học trên quy mô lớn với AWS HealthOmics
19/06/2024

Khám phá thông tin chuyên sâu mạnh mẽ về bộ gen với Phân tích của AWS HealthOmics và Amazon EMR
30/05/2024

Điều phối nhiều quy trình làm việc AWS HealthOmics ở quy mô lớn
07/05/2024

Dân chủ hóa các phân tích dữ liệu Omics với Basepair trên AWS HealthOmics
29/04/2024

AWS HealthOmics công bố các khả năng mới để tích hợp liền mạch các kho dữ liệu Omics và các công cụ phân tích
17/04/2024

Lưu trữ dữ liệu omics một cách tiết kiệm ở mọi quy mô với AWS HealthOmics
24/01/24

Xử lý trước dữ liệu fMRI trên AWS bằng AFNI và AWS HealthOmics
08/01/24

Các công cụ mới để đẩy nhanh quá trình di chuyển quy trình làm việc sang AWS HealthOmics
13/12/23

Phân tích dữ liệu đa phương thức với Trạng thái AWS và Dịch vụ máy học
16/10/23

Thiết kế kiến trúc định hướng theo sự kiện cho quy trình làm việc Tin sinh học bằng AWS HealthOmics và Amazon EventBridge
11/10/23

Bảo mật quy trình làm việc và dữ liệu bộ gen của bạn với AWS HealthOmics
09/10/2023

Video


Vượt qua các thách thức khoa học và CNTT liên quan đến việc điều chỉnh quy mô phân tích Omics (22:11)


Tạo bước đột phá trong y học chính xác: Sonrai sử dụng AWS để khám phá thuốc (3:03)


AWS re:Invent 2023 – Đổi mới Omics với AWS HealthOmics: Con đường giúp Amgen đạt được kết quả nhanh hơn


AWS re:Invent 2023 – Xây dựng nền tảng y học chính xác bằng AWS HealthOmics


Hội thảo toàn diện AWS HealthOmics – Bài thuyết trình (43:27)


AWS On Air với nội dung về AWS HealthOmics và Dữ liệu mở (20:07)


Sử dụng AWS HealthOmics toàn diện cho ngành nghiên cứu gen (2:03:06)


AWS On Air với nội dung về Quy trình làm việc Ready2Run trên AWS HealthOmics (26:34)