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Savana crea la única red de investigación clínica de procesamiento de lenguaje natural del mundo en AWS

2022

Con sede en Madrid, Savana ayuda a los proveedores de atención médica a descubrir el valor contenido en sus historias clínicas electrónicas (registros médicos electrónicos, EHR por sus siglas en inglés) para uso en investigación. Combina la metodología de nivel de investigación con el procesamiento de lenguaje natural (PLN) y el análisis predictivo para obtener resultados relevantes para proveedores de atención médica y ciencias biológicas que investigan la predicción y el tratamiento de enfermedades. Amazon Web Services (AWS) le permite procesar los grandes volúmenes de datos necesarios para ejecutar los algoritmos de aprendizaje automático. También puede escalar la infraestructura para respaldar el rápido crecimiento en los mercados mundiales, incluidos Estados Unidos, América Latina y Europa Occidental, y al mismo tiempo, cumplir con los requisitos normativos locales. Redujo los costes de TI hasta en un 90 % y el tiempo de procesamiento de estudios en un 25 % en comparación con la tecnología anterior.

IA + RWE de Savana
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AWS y Savana trabajan juntos como proveedores de confianza de servicios en la nube, y nuestros clientes también se benefician de esa confianza. Los Departamentos de TI de los hospitales se están dando cuenta de que la nube es más segura que el enfoque local tradicional”.

Jorge Tello
Director ejecutivo, Savana



Operando una de las redes de investigación multicéntrica de inteligencia artificial más grandes del mundo

La empresa internacional de tecnología médica Savana ofrece una solución basada en la nube que procesa y analiza información clínica no estructurada incluida en historias clínicas electrónicas (registros médicos electrónicos, EHR por sus siglas en inglés) combinadas con otras bases de datos estructuradas como la genómica. Con sede en Madrid, Savana administra una de las redes de investigación multicéntrica de inteligencia artificial (IA) más grandes del mundo, que está compuesta por más de 180 hospitales en 15 países.

Savana procesa miles de millones de registros médicos electrónicos, EHR por sus siglas en inglés, y puntos de datos a través de una canalización automática de datos de hospitales que investigan la predicción y el tratamiento de enfermedades. Hacer esto con éxito requiere una arquitectura fiable que soporte el volumen de información y cuente con el poder de procesamiento necesario para ejecutar algoritmos complejos con los más altos estándares de seguridad. A medida que el negocio crece, su infraestructura también necesita escalar y cumplir con los requisitos normativos de los mercados mundiales sobre el almacenamiento, la administración y la transferencia de datos.

Savana construyó su infraestructura usando AWS debido a su capacidad de escalar y a la amplitud de sus servicios. Ha creado una solución fiable y escalable y, al mismo tiempo, ha reducido los costes hasta en un 90 % y los tiempos de procesamiento de datos en un 35 %, de forma que puede entregar rápidamente resultados para la investigación médica pionera de los clientes.

Creación de la única red de investigación de procesamiento de lenguaje natural del mundo en AWS

Savana utiliza el procesamiento de lenguaje natural (PLN) para obtener la información más relevante acerca de diferentes enfermedades, afecciones y medicamentos del lenguaje médico utilizado por los profesionales médicos en las registros médicos electrónicos, EHR por sus siglas en inglés. A continuación, combina esta información con otras capas de datos, como los datos genéticos y biomoleculares, y fuentes de información como los ensayos clínicos. Identifica patrones y tendencias que pueden informar el análisis predictivo, por ejemplo, detectar qué tipos de pacientes obtendrían más beneficios de un tratamiento específico. También posibilita la identificación de biomarcadores, lo que acorta los procesos de descubrimiento de medicamentos.

La empresa respalda estudios de investigación realizados por proveedores de atención médica y empresas de ciencias biológicas que desean utilizar sus propios datos para mejorar el conocimiento médico en torno a una amplia gama de enfermedades y afecciones, incluidos trastornos de oncoinmunología, neurológicos y cardiovasculares. 

Con AWS, Savana ha implementado la única red de investigación multilingüe basada en PLN. El proceso de armonización de datos de la red implica dar sentido a la información que se encuentra en las secciones de historias clínicas electrónicas, en las que los profesionales médicos agregan notas. La notas se escriben en lenguaje natural y no siguen una estructura predeterminada, y deben ser contextualizadas con fuentes de datos estructurados.

Gestión de datos médicos complejos y más de 100 modelos de IA

Las historias clínicas pueden incluir una amplia gama de datos, como el número de tratamientos, el efecto en los pacientes y cuándo se identificó una enfermedad “Esta es realmente la fuente de información con la cual es posible evaluar la eficacia de un tratamiento o un seguimiento”, afirma Jorge Tello, director ejecutivo (CEO) de Savana.
 
La información puede ser compleja y se pueden utilizar acrónimos, algunos de los cuales pueden tener significados diferentes, por ejemplo, “mm” puede significar “milímetros” o “mieloma múltiple”. Además, la misma enfermedad puede tener diferentes nombres. Savana aporta una metodología de nivel de investigación a esta curación de datos, y combina datos estructurados y no estructurados que se generan en un período de tiempo específico. Antes de poder procesar los datos, Savana estandariza las fuentes de datos —que tienen diversos formatos— y elimina los detalles personales de la información, de modo que no sea posible identificar a los pacientes individuales. Una vez que se han anonimizado los datos, Savana los administra mediante Amazon Simple Storage Service (Amazon S3), un servicio de almacenamiento de objetos, y Amazon Athena, un servicio de consultas interactivo. Savana luego puede ejecutar más de 100 modelos de PLN-IA que reconocen entidades médicas complejas, a través de una canalización construida en AWS.

La innovación significa que los estudios ahora son más económicos y rápidos de ejecutar

Savana redujo los costes y los tiempos de procesamiento en AWS. Savana puede ejecutar cargas de trabajo tolerantes a fallos por hasta un 90 % menos en comparación con los precios bajo demanda con instancias de spot de Amazon Elastic Compute Cloud (Amazon EC2), lo que le permite acceder a la capacidad de computación disponible de Amazon EC2. También redujo el tiempo de procesamiento de datos en un 25 %, con lo cual es posible procesar un estudio típico en nueve semanas, frente a las doce semanas necesarias con la tecnología anterior.

Esta rápida respuesta significa que los clientes reciben los resultados de la investigación médica con mayor rapidez, y Savana puede así atender más estudios y clientes. “Podemos adaptar las instancias que utilizamos a un coste muy bajo y podemos mantener el tiempo que toma el procesamiento,” sostiene Tello. “Realmente es de mucha utilidad contar con esta previsibilidad acerca de cuánto dinero gastaremos el próximo mes o el próximo año”.

Savana ha experimentado un ahorro del 37 % en los costes totales de TI con los servicios de AWS, tales como Amazon registros médicos electrónicos, EHR por sus siglas en inglés, Amazon Relational Database Service (RDS) y AWS Fargate. Además, ha conseguido una reducción del 73 % en el tiempo total necesario para ejecutar y completar tareas en todos los equipos de Savana.

Respaldo del crecimiento con escalabilidad y agilidad

Savana está creciendo rápidamente, y por ello requiere tecnología que pueda escalar con facilidad a medida que atiende a más clientes y mercados. “Recibimos nuevos contratos de nuevos clientes todos los meses y manejamos millones de puntos de datos, por lo que necesitamos poder aumentar nuestros recursos de computación y almacenamiento rápidamente”, dice Tello. La empresa prevé que el volumen de las historias clínicas que deberá procesar podría aumentar diez veces en los próximos dos años.
 
Asimismo, es necesario que la infraestructura sea lo suficientemente ágil para procesar documentos en cinco idiomas diferentes —inglés, francés, alemán, portugués y español— y que cumpla con los requisitos cambiantes de los clientes. “Esta es una tecnología nueva para nuestros clientes, por lo que cambian sus requisitos casi todas las semanas o meses”, afirma Tello. “Los servicios de AWS son realmente flexibles, así que podemos adaptar nuestro servicio con facilidad al estudio en el que estamos trabajando”.
 
Con AWS, Savana puede administrar y procesar grandes volúmenes de documentos de diferentes ubicaciones, con el alto nivel de seguridad necesario para los registros de salud. Puede anonimizar por completo esta información confidencial, lo que garantiza la máxima privacidad para hospitales y pacientes.
 
Además, puede procesar información médica de conformidad con las normativas locales, debido a la presencia de AWS en estos mercados. “Para nosotros es importante trabajar con un proveedor global como AWS, porque al trabajar con organizaciones estadounidenses, podemos procesar datos en los Estados Unidos, y al trabajar con organizaciones europeas, podemos procesar datos en Europa”, dice Tello. “Los datos son un recurso crítico, y al utilizar AWS, nuestros clientes saben en dónde se encuentran sus datos”.

Expansión en los Estados Unidos y ofrecimiento de PLN como servicio

Savana continúa optimizando sus servicios en AWS, con el objetivo de seguir reduciendo los costes y el tiempo de procesamiento. Al mismo tiempo, está desarrollando una solución basada en AWS que ofrecerá sus capacidades de PLN como servicio. Esto les permitirá a los clientes cargar directamente las historias clínicas electrónicas en el sistema de Savana y recibir el análisis con rapidez.
 
A medida que sus clientes aprenden a confiar en los servicios en la nube, la empresa española también está ampliando su presencia en los Estados Unidos. “AWS es nuestro proveedor de confianza de servicios en la nube, y nuestros clientes también se benefician de esa confianza”, dice Tello. “Los Departamentos de TI de los hospitales se están dando cuenta de que la computación en la nube es más segura que el enfoque local tradicional”.

Acerca de Savana

Savana ofrece servicios para el procesamiento y análisis de historias clínicas electrónicas (registros médicos electrónicos, EHR por sus siglas en inglés). Con sede en Madrid, Savana administra una de las redes de investigación de inteligencia artificial (IA) multicéntrica y multilingüe más grandes del mundo, que está compuesta por más de 180 hospitales en 15 países.

Beneficios de AWS

  • Escala la capacidad de procesamiento de historias clínicas a medida que la empresa crece
  • Reduce los costes hasta en un 90 %
  • Procesa las historias clínicas un 25 % más rápido
  • Se perfecciona para ofrecer nuevos servicios de procesamiento de lenguaje natural

Servicios de AWS utilizados

Amazon Athena

Amazon Athena es un servicio de consultas interactivo que facilita el análisis de datos en Amazon S3 con SQL estándar. Athena no tiene servidor, de manera que no es necesario administrar infraestructura y solo paga por las consultas que ejecuta.

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Amazon Simple Storage Service (S3)

Amazon Simple Storage Service (Amazon S3) es un servicio de almacenamiento de objetos que ofrece escalabilidad, disponibilidad de datos, seguridad y rendimiento líderes en el sector.

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Instancias de spot de Amazon EC2

Las instancias de spot de Amazon EC2 permiten aprovechar la capacidad sin usar de EC2 en la nube de AWS. Las instancias de spot están disponibles con un descuento de hasta el 90 % en comparación con los precios bajo demanda.

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Introducción

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