Implante o Illumina DRAGEN na Nuvem AWS com o novo Quick Start

Publicado: Oct 2, 2018

Este Quick Start implanta a plataforma de análise de dados da Illumina, o Dynamic Read Analysis for GENomics Complete Suite (DRAGEN CS), na Nuvem AWS em cerca de 15 minutos.

O DRAGEN CS permite análises ultra-rápidas de dados de Next-Generation Sequencing (NGS – Sequenciamento de próxima geração), reduzindo substancialmente o tempo de análise de dados genômicos e aumentando sua precisão. A plataforma inclui pipelines de bioinformática que oferecem algoritmos altamente otimizados para mapeamento, alinhamento, classificação, marcação de duplicidades e chamadas de variantes de haplótipos. Esses pipelines incluem o DRAGEN Germline V2, o DRAGEN Somatic V2 (tumor e tumor/normal), o DRAGEN Virtual Long Read Detection (VLRD), o DRAGEN RNA Gene Fusion, o DRAGEN Joint Genotyping e o GATK Best Practices.

O Quick Start cria um ambiente da AWS que abrange duas zonas de disponibilidade para proporcionar alta disponibilidade e provisiona dois ambientes de computação do AWS Batch para instâncias spot e sob demanda. Esses ambientes incluem instâncias F1 do DRAGEN conectadas a Field-Programmable Gate Arrays (FPGAs – Matrizes de portas programáveis em campo) para aceleração por hardware.

Para começar a usar:

Você também pode fazer download de modelos do AWS CloudFormation do GitHub para automatizar a implantação.
 
Para procurar e iniciar outras implantações de referência dos Quick Starts da AWS, consulte o nosso catálogo completo.
 
Os Quick Starts são implantações de referência automatizadas que usam modelos do AWS CloudFormation para implantar tecnologias essenciais na AWS de acordo com as melhores práticas da AWS. Este Quick Start foi criado pela Illumina em colaboração com arquitetos de soluções da AWS. A Illumina é um parceiro de tecnologia Advanced da AWS.